More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3959 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3959  Ribonuclease III  100 
 
 		 228 aa  467  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3303  Ribonuclease III  65.33 
 
 		 225 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2813  ribonuclease III  65.33 
 
 		 225 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  0.303497 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2144  RNAse III  58.33 
 
 		 233 aa  262  4e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3081  ribonuclease III  52.45 
 
 		 228 aa  205  5e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.569411  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4580  ribonuclease III  51.23 
 
 		 227 aa  202  5e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  44.8 
 
 		 246 aa  179  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  48.1 
 
 		 240 aa  174  9e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  43.84 
 
 		 246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  40.55 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  43.58 
 
 		 245 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  43.58 
 
 		 245 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2501  ribonuclease III  43.58 
 
 		 245 aa  164  9e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121317  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  44.13 
 
 		 241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  42.47 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  41.74 
 
 		 235 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  43.12 
 
 		 245 aa  162  6e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  43.12 
 
 		 245 aa  161  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3700  ribonuclease III  43.12 
 
 		 245 aa  161  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3590  ribonuclease III  43.12 
 
 		 245 aa  161  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  43.12 
 
 		 245 aa  161  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  43.12 
 
 		 245 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000342133  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3608  ribonuclease III  43.12 
 
 		 245 aa  160  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  37.73 
 
 		 236 aa  160  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  42.92 
 
 		 259 aa  159  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  39.81 
 
 		 232 aa  159  4e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  38.64 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3672  ribonuclease III  41.89 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405617  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0212  ribonuclease III  45.62 
 
 		 248 aa  156  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  38.36 
 
 		 243 aa  156  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  38.36 
 
 		 243 aa  156  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  42.18 
 
 		 236 aa  155  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1945  Ribonuclease III  41.28 
 
 		 228 aa  154  9e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210553  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  40.64 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  42.79 
 
 		 235 aa  153  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1387  ribonuclease III  41.1 
 
 		 237 aa  152  4e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.023535  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  41.04 
 
 		 242 aa  152  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0380  ribonuclease III  39.46 
 
 		 234 aa  152  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.492905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1494  ribonuclease III  37.56 
 
 		 222 aa  151  7e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  36.82 
 
 		 246 aa  150  1e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  41.2 
 
 		 236 aa  150  1e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  42.38 
 
 		 246 aa  150  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  39.15 
 
 		 236 aa  150  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2029  ribonuclease III  38.64 
 
 		 222 aa  149  5e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0184754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1975  ribonuclease III  39.91 
 
 		 227 aa  148  6e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  40.55 
 
 		 262 aa  148  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  38.07 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13780  ribonuclease III  41.15 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  38.57 
 
 		 246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0951  ribonuclease III  41.06 
 
 		 233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.608841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1376  Ribonuclease III  44.9 
 
 		 224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.028132  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  39.37 
 
 		 233 aa  146  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  36.94 
 
 		 233 aa  144  8.000000000000001e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  38.57 
 
 		 377 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  37.61 
 
 		 237 aa  144  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  35.29 
 
 		 241 aa  144  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  37.61 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  34.84 
 
 		 241 aa  143  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1475  ribonuclease III  41.36 
 
 		 229 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.723705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4374  ribonuclease III  38.74 
 
 		 229 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3951  ribonuclease III  40.1 
 
 		 229 aa  142  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2784  ribonuclease III  38.16 
 
 		 245 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2959  ribonuclease III  38.16 
 
 		 245 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0879861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0920  ribonuclease III  40.55 
 
 		 234 aa  143  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  36.87 
 
 		 231 aa  142  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2824  ribonuclease III  38.16 
 
 		 245 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  37.5 
 
 		 282 aa  143  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2743  ribonuclease III  38.16 
 
 		 245 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00278248  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2847  ribonuclease III  38.16 
 
 		 245 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0152776  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02461  ribonuclease III  38.16 
 
 		 226 aa  142  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1101  Ribonuclease III  38.16 
 
 		 226 aa  142  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0115033  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2722  ribonuclease III  38.16 
 
 		 226 aa  142  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.444526  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2720  ribonuclease III  38.16 
 
 		 226 aa  142  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0115218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1068  ribonuclease III  39.6 
 
 		 226 aa  142  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1110  ribonuclease III  38.16 
 
 		 226 aa  142  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.506107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3803  ribonuclease III  38.16 
 
 		 226 aa  142  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02425  hypothetical protein  38.16 
 
 		 226 aa  142  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2853  ribonuclease III  38.16 
 
 		 226 aa  142  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0190873  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2932  ribonuclease III  38.16 
 
 		 226 aa  142  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.223981  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4217  ribonuclease III  40.1 
 
 		 229 aa  142  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1714  Ribonuclease III  39.9 
 
 		 229 aa  142  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.61541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3433  ribonuclease III  43.78 
 
 		 268 aa  142  6e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.699086  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0281  ribonuclease III  38.05 
 
 		 225 aa  142  6e-33  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2785  ribonuclease III  40.1 
 
 		 226 aa  142  6e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.40342  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  39.63 
 
 		 238 aa  142  6e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1433  ribonuclease III  38.29 
 
 		 229 aa  141  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00353608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2208  Ribonuclease III  39.42 
 
 		 383 aa  141  7e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3054  ribonuclease III  37.68 
 
 		 226 aa  141  7e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.255199  hitchhiker  0.00979275 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1650  ribonuclease III  38.94 
 
 		 385 aa  141  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4602  ribonuclease III  39.9 
 
 		 237 aa  141  7e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4288  ribonuclease III  38.29 
 
 		 229 aa  141  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3281  ribonuclease III  42.86 
 
 		 276 aa  141  7e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  38.81 
 
 		 246 aa  141  8e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2458  ribonuclease III  41.87 
 
 		 233 aa  141  9e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3071  ribonuclease III  38.92 
 
 		 226 aa  141  9e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0430535  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1463  ribonuclease III  39.21 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2296  Ribonuclease III  39.42 
 
 		 383 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1659  ribonuclease III  38.18 
 
 		 248 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  37.27 
 
 		 221 aa  140  9.999999999999999e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  38.5 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>