More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1763 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1763  ribonuclease III  100 
 
 		 237 aa  491  9.999999999999999e-139  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3916  ribonuclease III  37.84 
 
 		 248 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4194  ribonuclease III  37.1 
 
 		 242 aa  149  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.197328  normal  0.7656 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0361  ribonuclease III  41.55 
 
 		 253 aa  148  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.782335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1396  ribonuclease III  37.96 
 
 		 247 aa  148  9e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5150  ribonuclease III  36.76 
 
 		 253 aa  139  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0990083  normal  0.260918 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1139  ribonuclease III  36.74 
 
 		 246 aa  138  7.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1206  hypothetical protein  36.24 
 
 		 241 aa  137  1e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000396494 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1321  ribonuclease III  36.61 
 
 		 252 aa  134  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03140  putative ribonuclease III  39.26 
 
 		 247 aa  122  6e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.956327  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  33.49 
 
 		 262 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  37.34 
 
 		 246 aa  115  6e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0177  Ribonuclease III  37.17 
 
 		 271 aa  115  7.999999999999999e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0218765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0128  ribonuclease III  38.14 
 
 		 276 aa  113  3e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.230547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  37.04 
 
 		 236 aa  113  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1240  ribonuclease III  33.33 
 
 		 232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2495  ribonuclease III  35.81 
 
 		 273 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  36.28 
 
 		 229 aa  112  5e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0194  Ribonuclease III  34.63 
 
 		 273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  34.91 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0164  Ribonuclease III  35.27 
 
 		 273 aa  109  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.233205  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1144  ribonuclease III  34.08 
 
 		 229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  35.56 
 
 		 246 aa  107  1e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  34.76 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  37 
 
 		 240 aa  106  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  32.6 
 
 		 243 aa  105  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0231  ribonuclease III  32.8 
 
 		 263 aa  105  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.933376  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  32.6 
 
 		 243 aa  105  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  34.91 
 
 		 246 aa  105  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  35.92 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  33.33 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0852  ribonuclease III  31.43 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  36.32 
 
 		 221 aa  103  3e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0049  ribonuclease III  32.29 
 
 		 229 aa  102  4e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0774  ribonuclease III  32.74 
 
 		 229 aa  102  4e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.811993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  35.68 
 
 		 235 aa  102  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  36.84 
 
 		 245 aa  102  7e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  34.76 
 
 		 236 aa  101  8e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  34.53 
 
 		 235 aa  101  8e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  31.56 
 
 		 232 aa  101  8e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  35.75 
 
 		 246 aa  101  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08900  RNAse III  34.5 
 
 		 220 aa  101  9e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.493633  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3455  ribonuclease III  35.44 
 
 		 259 aa  101  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.690337  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  30.4 
 
 		 245 aa  100  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  32.39 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  33.94 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1659  ribonuclease III  36.32 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0993  ribonuclease III  30.68 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0631846  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  36.09 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2293  ribonuclease III  33.02 
 
 		 240 aa  99  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.051216  hitchhiker  0.000715248 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1063  ribonuclease III  30.28 
 
 		 256 aa  99  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0362018  normal  0.166075 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0928  ribonuclease III  30.28 
 
 		 256 aa  99  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  32.06 
 
 		 241 aa  98.2  9e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  33.16 
 
 		 233 aa  98.2  9e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  34.13 
 
 		 236 aa  98.2  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0172  Ribonuclease III  35.41 
 
 		 277 aa  98.2  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2612  ribonuclease III  34.62 
 
 		 271 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1240  ribonuclease III  33.92 
 
 		 227 aa  97.8  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1388  ribonuclease III  29.39 
 
 		 243 aa  97.1  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.625723  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1947  ribonuclease III  37.89 
 
 		 253 aa  97.1  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2972  Ribonuclease III  34.57 
 
 		 272 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2807  ribonuclease III  33.33 
 
 		 246 aa  97.4  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000160446  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  32.98 
 
 		 241 aa  97.1  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  32.98 
 
 		 241 aa  97.4  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18360  RNAse III  33.5 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3267  ribonuclease III  37.5 
 
 		 228 aa  96.7  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0395589 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2620  ribonuclease III  37.57 
 
 		 228 aa  96.3  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  33.01 
 
 		 238 aa  96.3  4e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  32.63 
 
 		 235 aa  95.5  6e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3433  ribonuclease III  33.33 
 
 		 268 aa  95.5  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.699086  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1753  ribonuclease III  32.44 
 
 		 230 aa  95.5  7e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  33.77 
 
 		 236 aa  95.1  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0209  RNAse III  31.25 
 
 		 234 aa  95.1  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0839  ribonuclease III  33.64 
 
 		 227 aa  95.1  9e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0212  ribonuclease III  33.83 
 
 		 248 aa  95.1  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5261  ribonuclease III  36.13 
 
 		 227 aa  94.7  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48838  normal  0.851553 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1509  ribonuclease III  35.11 
 
 		 263 aa  94.4  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.691644  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0862  ribonuclease III  34.31 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1081  ribonuclease III  31.61 
 
 		 239 aa  93.6  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1609  ribonuclease III  35.24 
 
 		 252 aa  94  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1092  Ribonuclease III  33.51 
 
 		 228 aa  94.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.268595  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2640  ribonuclease III  35.16 
 
 		 272 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.943861 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2766  ribonuclease III  30.09 
 
 		 226 aa  94  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000758412  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1159  ribonuclease III  28.57 
 
 		 222 aa  94.4  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0556281  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11290  RNAse III  35 
 
 		 234 aa  93.2  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  33.98 
 
 		 231 aa  92.8  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2813  ribonuclease III  31.44 
 
 		 225 aa  92.8  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  0.303497 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3303  Ribonuclease III  31.44 
 
 		 225 aa  92.8  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1641  ribonuclease III  33.49 
 
 		 240 aa  92.4  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1613  ribonuclease III  31.46 
 
 		 223 aa  92.4  5e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2651  ribonuclease III  33.52 
 
 		 271 aa  92  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.224672  normal  0.0332159 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  30.04 
 
 		 223 aa  92.4  6e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1666  ribonuclease III  31.94 
 
 		 241 aa  92  7e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.0114969 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  34.58 
 
 		 282 aa  91.7  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  35.42 
 
 		 228 aa  91.3  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1852  RNAse III  33.33 
 
 		 221 aa  91.7  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1159  ribonuclease III  30.53 
 
 		 226 aa  91.7  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0446334  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0453  ribonuclease III  31.05 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2232  Ribonuclease III  34.22 
 
 		 256 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0797386 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  35.08 
 
 		 242 aa  91.3  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>