More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1139 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1139  ribonuclease III  100 
 
 		 246 aa  503  1e-141  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03140  putative ribonuclease III  67.76 
 
 		 247 aa  324  7e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.956327  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1321  ribonuclease III  52.84 
 
 		 252 aa  236  2e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4194  ribonuclease III  41.26 
 
 		 242 aa  176  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.197328  normal  0.7656 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1396  ribonuclease III  37.39 
 
 		 247 aa  169  4e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0361  ribonuclease III  36.44 
 
 		 253 aa  155  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.782335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3916  ribonuclease III  37.12 
 
 		 248 aa  151  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1206  hypothetical protein  36.53 
 
 		 241 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000396494 
 
 
-
 
NC_002950  PG1763  ribonuclease III  36.74 
 
 		 237 aa  138  8.999999999999999e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5150  ribonuclease III  37.38 
 
 		 253 aa  128  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0990083  normal  0.260918 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  32.74 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0177  Ribonuclease III  35.14 
 
 		 271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0218765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0172  Ribonuclease III  36.92 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  35.37 
 
 		 243 aa  112  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  35.37 
 
 		 243 aa  112  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  31.3 
 
 		 246 aa  107  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  33.64 
 
 		 245 aa  106  3e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  32.46 
 
 		 245 aa  105  6e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  30.6 
 
 		 231 aa  105  8e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2495  ribonuclease III  32.44 
 
 		 273 aa  104  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1240  ribonuclease III  31.3 
 
 		 232 aa  101  1e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0852  ribonuclease III  31.51 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0231  ribonuclease III  34.55 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.933376  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  31.55 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  30.8 
 
 		 228 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0164  Ribonuclease III  31.53 
 
 		 273 aa  98.6  7e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.233205  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1159  ribonuclease III  31.91 
 
 		 233 aa  98.2  9e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000332232  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  28.76 
 
 		 240 aa  98.2  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0209  RNAse III  28.57 
 
 		 234 aa  97.1  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  30.77 
 
 		 221 aa  97.1  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  32.34 
 
 		 238 aa  97.1  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  32.21 
 
 		 235 aa  96.7  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05680  ribonuclease III  30.67 
 
 		 279 aa  96.3  4e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0033442  normal  0.77116 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  34.74 
 
 		 236 aa  96.3  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0194  Ribonuclease III  31.82 
 
 		 273 aa  95.1  9e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1159  ribonuclease III  30.63 
 
 		 222 aa  95.1  9e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0556281  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0128  ribonuclease III  29 
 
 		 276 aa  94.7  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.230547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  29.46 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11290  RNAse III  33.02 
 
 		 234 aa  94.7  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  31.84 
 
 		 236 aa  94  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  32.16 
 
 		 246 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0847  ribonuclease III  32.76 
 
 		 226 aa  94  2e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  28.83 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0862  ribonuclease III  33.97 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  32.11 
 
 		 246 aa  94.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  28.89 
 
 		 246 aa  94.4  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1666  ribonuclease III  32.86 
 
 		 241 aa  93.6  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.0114969 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  32.16 
 
 		 246 aa  93.6  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  29.96 
 
 		 232 aa  92.8  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  32.68 
 
 		 233 aa  93.2  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2807  ribonuclease III  29.02 
 
 		 246 aa  93.2  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000160446  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0374  ribonuclease III  33.66 
 
 		 259 aa  92  8e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.7646  hitchhiker  0.000724257 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  31.7 
 
 		 246 aa  91.7  9e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1659  ribonuclease III  31.51 
 
 		 248 aa  91.7  9e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1609  ribonuclease III  31.94 
 
 		 252 aa  91.7  9e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  30 
 
 		 226 aa  91.3  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0481  ribonuclease III  32.75 
 
 		 233 aa  91.7  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  31.44 
 
 		 236 aa  90.9  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10070  ribonuclease III  29.73 
 
 		 300 aa  90.5  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000284156  hitchhiker  0.000000433173 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0650  ribonuclease III  32 
 
 		 248 aa  89.7  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.314508  normal  0.397443 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  31.4 
 
 		 259 aa  89.7  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  29.91 
 
 		 240 aa  89.4  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1807  ribonuclease III  29.09 
 
 		 252 aa  89.7  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158054  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1347  ribonuclease III  31.03 
 
 		 228 aa  89.7  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.316032  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0212  ribonuclease III  29.28 
 
 		 248 aa  89.4  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1753  ribonuclease III  30.94 
 
 		 230 aa  89.4  6e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  30.92 
 
 		 235 aa  89  6e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1641  ribonuclease III  31.25 
 
 		 240 aa  88.6  8e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2273  ribonuclease III  31.02 
 
 		 239 aa  88.6  8e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  32.82 
 
 		 234 aa  88.6  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0839  ribonuclease III  33.8 
 
 		 227 aa  87.8  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1388  ribonuclease III  29.09 
 
 		 243 aa  88.2  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.625723  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2029  ribonuclease III  31.07 
 
 		 222 aa  88.2  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0184754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1852  RNAse III  27.51 
 
 		 221 aa  88.2  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1686  ribonuclease III  32.16 
 
 		 233 aa  88.2  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1807  ribonuclease III  33.17 
 
 		 224 aa  87  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1092  Ribonuclease III  31.48 
 
 		 228 aa  87  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.268595  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1626  ribonuclease III  33.17 
 
 		 225 aa  87.4  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140221  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1995  ribonuclease III  32.27 
 
 		 225 aa  87  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  29.22 
 
 		 241 aa  87  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  29.71 
 
 		 230 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  29.73 
 
 		 223 aa  87.4  2e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1121  Ribonuclease III  29.22 
 
 		 226 aa  86.7  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  28.77 
 
 		 241 aa  86.7  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1400  ribonuclease III  29.22 
 
 		 226 aa  86.7  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  30.8 
 
 		 237 aa  86.7  4e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2293  ribonuclease III  30.05 
 
 		 240 aa  85.9  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.051216  hitchhiker  0.000715248 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  28.85 
 
 		 241 aa  85.9  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1054  ribonuclease III  30.43 
 
 		 226 aa  85.5  7e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0157951  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  27.75 
 
 		 233 aa  85.5  8e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3433  ribonuclease III  27.95 
 
 		 268 aa  85.1  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.699086  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2501  ribonuclease III  30.88 
 
 		 245 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121317  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0473  ribonuclease III  27.15 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.270178  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1366  ribonuclease III  28.77 
 
 		 281 aa  84.3  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0216195  normal  0.417724 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08900  RNAse III  27.78 
 
 		 220 aa  83.6  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.493633  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2243  RNAse III  31.84 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1604  ribonuclease III  28.89 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0333  ribonuclease III  31.96 
 
 		 265 aa  83.2  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.283295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0918  ribonuclease III  30.91 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.300487  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1613  ribonuclease III  29.95 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>