More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0361 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0361  ribonuclease III  100 
 
 		 253 aa  514  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.782335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4194  ribonuclease III  47.11 
 
 		 242 aa  223  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.197328  normal  0.7656 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3916  ribonuclease III  41.96 
 
 		 248 aa  178  8e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5150  ribonuclease III  43.86 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0990083  normal  0.260918 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1206  hypothetical protein  40.51 
 
 		 241 aa  176  3e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000396494 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1396  ribonuclease III  39.32 
 
 		 247 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1321  ribonuclease III  41.38 
 
 		 252 aa  158  9e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1139  ribonuclease III  36.44 
 
 		 246 aa  155  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1763  ribonuclease III  41.55 
 
 		 237 aa  148  9e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03140  putative ribonuclease III  37.98 
 
 		 247 aa  144  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.956327  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0194  Ribonuclease III  35.56 
 
 		 273 aa  131  7.999999999999999e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0177  Ribonuclease III  34.76 
 
 		 271 aa  128  8.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0218765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  37.26 
 
 		 260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2495  ribonuclease III  35.56 
 
 		 273 aa  126  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0164  Ribonuclease III  33.33 
 
 		 273 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.233205  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0231  ribonuclease III  39.41 
 
 		 263 aa  119  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.933376  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0128  ribonuclease III  32.86 
 
 		 276 aa  118  7.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.230547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0172  Ribonuclease III  33.82 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  34.4 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1659  ribonuclease III  33.48 
 
 		 248 aa  110  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11290  RNAse III  35.32 
 
 		 234 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  34.42 
 
 		 243 aa  108  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  33.19 
 
 		 245 aa  108  6e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  34.42 
 
 		 243 aa  108  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  31.2 
 
 		 246 aa  106  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  33.18 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  32.48 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0852  ribonuclease III  35.38 
 
 		 243 aa  104  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  31.6 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  33.33 
 
 		 240 aa  102  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0212  ribonuclease III  34.85 
 
 		 248 aa  101  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  36.76 
 
 		 238 aa  101  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2813  ribonuclease III  31.19 
 
 		 225 aa  98.6  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  0.303497 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3303  Ribonuclease III  31.19 
 
 		 225 aa  98.6  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  30.84 
 
 		 242 aa  98.6  8e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1807  ribonuclease III  32.68 
 
 		 224 aa  97.1  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1509  ribonuclease III  30.09 
 
 		 263 aa  97.1  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.691644  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  32.08 
 
 		 262 aa  97.1  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  30.49 
 
 		 223 aa  95.9  5e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  31.43 
 
 		 229 aa  95.9  6e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  31.28 
 
 		 259 aa  94.7  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  30.84 
 
 		 246 aa  94.4  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0250  ribonuclease III  32.41 
 
 		 221 aa  95.1  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1626  ribonuclease III  32.2 
 
 		 225 aa  95.1  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140221  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  29.33 
 
 		 235 aa  94.7  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  33.91 
 
 		 245 aa  94.4  2e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1975  ribonuclease III  30.56 
 
 		 227 aa  94  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1494  ribonuclease III  30.97 
 
 		 222 aa  94.4  2e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1995  ribonuclease III  31.71 
 
 		 225 aa  93.6  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  30.32 
 
 		 221 aa  93.6  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1092  Ribonuclease III  31.7 
 
 		 228 aa  92.8  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.268595  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0374  ribonuclease III  32.57 
 
 		 259 aa  92.8  5e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.7646  hitchhiker  0.000724257 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3433  ribonuclease III  33.33 
 
 		 268 aa  92.4  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.699086  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  30.93 
 
 		 236 aa  92.4  7e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08900  RNAse III  32.04 
 
 		 220 aa  92  8e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.493633  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02998  ribonuclease III  39.55 
 
 		 228 aa  91.3  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0481  ribonuclease III  31.08 
 
 		 233 aa  91.7  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  33.64 
 
 		 246 aa  91.3  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3281  ribonuclease III  29.81 
 
 		 276 aa  91.3  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18360  RNAse III  30.1 
 
 		 250 aa  91.3  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  30.73 
 
 		 241 aa  91.3  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  30.73 
 
 		 241 aa  90.9  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10070  ribonuclease III  30.59 
 
 		 300 aa  90.5  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000284156  hitchhiker  0.000000433173 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2293  ribonuclease III  31.16 
 
 		 240 aa  90.1  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.051216  hitchhiker  0.000715248 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1159  ribonuclease III  28.07 
 
 		 222 aa  90.1  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0556281  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  29.46 
 
 		 236 aa  90.1  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  29.89 
 
 		 235 aa  90.1  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2243  RNAse III  31.51 
 
 		 226 aa  89.7  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1037  ribonuclease III  31.7 
 
 		 225 aa  89.7  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00165891  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  28.9 
 
 		 226 aa  89  6e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0333  ribonuclease III  31.36 
 
 		 265 aa  89  7e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.283295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2122  ribonuclease III  30.58 
 
 		 243 aa  88.6  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0434013 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0774  ribonuclease III  31.56 
 
 		 229 aa  89  8e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.811993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0367  ribonuclease III  31.36 
 
 		 265 aa  89  8e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0273818 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  31.62 
 
 		 240 aa  88.6  8e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  31.03 
 
 		 246 aa  88.2  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3601  ribonuclease III  37.16 
 
 		 270 aa  87.8  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1686  ribonuclease III  30.63 
 
 		 233 aa  88.6  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  27.32 
 
 		 236 aa  88.6  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3689  ribonuclease III  28.64 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3959  Ribonuclease III  29.09 
 
 		 228 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0209  RNAse III  28.31 
 
 		 234 aa  88.2  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0862  ribonuclease III  28.45 
 
 		 231 aa  88.2  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1139  ribonuclease III  33.5 
 
 		 306 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.323858  normal  0.0251289 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1159  ribonuclease III  30 
 
 		 233 aa  87.4  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000332232  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0920  ribonuclease III  29.13 
 
 		 234 aa  87.4  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1666  ribonuclease III  29.9 
 
 		 241 aa  87.4  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.0114969 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2780  ribonuclease III  39.23 
 
 		 267 aa  87.8  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal  0.181798 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  33.17 
 
 		 231 aa  87.4  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12940  ribonuclease III  33.11 
 
 		 240 aa  87  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2273  ribonuclease III  31.16 
 
 		 239 aa  87  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0049  ribonuclease III  31.11 
 
 		 229 aa  86.3  4e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1144  ribonuclease III  31.11 
 
 		 229 aa  85.9  5e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  29.3 
 
 		 241 aa  85.9  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2029  ribonuclease III  27.52 
 
 		 222 aa  85.9  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0184754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5964  ribonuclease III  30.66 
 
 		 267 aa  85.9  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0570  ribonuclease III  31.86 
 
 		 232 aa  85.5  7e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2807  ribonuclease III  31.19 
 
 		 246 aa  85.1  9e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000160446  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  29.27 
 
 		 233 aa  85.1  9e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7995  Ribonuclease III  35.48 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.509721  normal  0.250763 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>