More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1691 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1691  diguanylate phosphodiesterase  100 
 
 		 366 aa  734    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000214274 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0529  diguanylate phosphodiesterase  42 
 
 		 378 aa  231  1e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.907499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1097  diguanylate phosphodiesterase  37.47 
 
 		 456 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3633  diguanylate phosphodiesterase  37.89 
 
 		 453 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5253  diguanylate phosphodiesterase  38.31 
 
 		 392 aa  196  4.0000000000000005e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.550971 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0300  diguanylate phosphodiesterase  39.42 
 
 		 362 aa  183  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.907769  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4614  diguanylate phosphodiesterase  43.43 
 
 		 378 aa  180  4e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2441  diguanylate phosphodiesterase  47.47 
 
 		 443 aa  178  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1803  diguanylate phosphodiesterase  35.43 
 
 		 382 aa  172  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.507868 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1985  diguanylate phosphodiesterase  41.36 
 
 		 485 aa  171  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.299339  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1771  diguanylate phosphodiesterase  43.84 
 
 		 475 aa  169  6e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.142828  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2099  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  43.13 
 
 		 402 aa  168  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.316821 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4505  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor(s)  39.55 
 
 		 409 aa  166  6.9999999999999995e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.660376  normal  0.902865 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0179  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  48.61 
 
 		 750 aa  163  5.0000000000000005e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.102862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3112  diguanylate phosphodiesterase  46.12 
 
 		 244 aa  159  7e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1061  diguanylate phosphodiesterase  40.83 
 
 		 454 aa  157  3e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.347929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2246  diguanylate phosphodiesterase  41.01 
 
 		 413 aa  156  5.0000000000000005e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.101865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1906  diguanylate phosphodiesterase  41.78 
 
 		 410 aa  154  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0735137  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0227  diguanylate phosphodiesterase  38.28 
 
 		 429 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2139  diguanylate phosphodiesterase  40.37 
 
 		 403 aa  149  8e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.067843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1402  diguanylate phosphodiesterase  41.63 
 
 		 372 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.281797  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2421  diguanylate phosphodiesterase  38.71 
 
 		 432 aa  144  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0356024  normal  0.0553373 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4968  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor(s)  39.84 
 
 		 447 aa  143  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49831  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1320  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.16 
 
 		 584 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00692574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2663  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.85 
 
 		 753 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1731  diguanylate phosphodiesterase  34.76 
 
 		 378 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0705  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.85 
 
 		 590 aa  136  6.0000000000000005e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0326  diguanylate phosphodiesterase  39.83 
 
 		 385 aa  135  8e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.308148 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0176  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.72 
 
 		 786 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000781405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51660  EAL/GGDEF domain-containing protein  33.44 
 
 		 592 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0172  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor(s)  40 
 
 		 419 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0212595  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0177  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor(s)  40 
 
 		 419 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1152  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  37.21 
 
 		 710 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0872705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5174  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  36.28 
 
 		 703 aa  133  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.903635 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4174  diguanylate phosphodiesterase  39.05 
 
 		 425 aa  132  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.886993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0617  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.82 
 
 		 883 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00427205 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2526  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor(s)  37.44 
 
 		 422 aa  130  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4571  diguanylate phosphodiesterase  38.03 
 
 		 447 aa  130  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.300583 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3886  EAL domain/GGDEF domain protein  30.96 
 
 		 590 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00288669  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1949  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.95 
 
 		 773 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21870  EAL domain/GGDEF domain-containing protein  32.62 
 
 		 601 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.220571  hitchhiker  0.00056029 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.5 
 
 		 766 aa  127  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1210  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.92 
 
 		 797 aa  127  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.489928 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0894  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.76 
 
 		 605 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.396651  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1510  diguanylate phosphodiesterase  39.27 
 
 		 475 aa  126  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0137  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor(s)  37.85 
 
 		 407 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.116698  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1598  GGDEF:CBS:EAL  30.18 
 
 		 590 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.29213  normal  0.0431902 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1867  hypothetical protein  36.91 
 
 		 582 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145916  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1678  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.62 
 
 		 596 aa  124  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.684126  normal  0.910388 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2411  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.61 
 
 		 632 aa  124  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893826 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3527  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.86 
 
 		 581 aa  120  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1718  diguanylate phosphodiesterase  34.63 
 
 		 379 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0187822  normal  0.029577 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4110  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor(s)  35.65 
 
 		 411 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0232  diguanylate phosphodiesterase  35.21 
 
 		 352 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4001  diguanylate phosphodiesterase  34.24 
 
 		 357 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838727  normal  0.748991 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1310  diguanylate phosphodiesterase  36.65 
 
 		 306 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.016111  normal  0.292811 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3854  diguanylate phosphodiesterase  38.03 
 
 		 375 aa  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1514  diguanylate phosphodiesterase  32.47 
 
 		 437 aa  116  6e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000323461  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3883  diguanylate phosphodiesterase  39.71 
 
 		 442 aa  116  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.385825  decreased coverage  0.00073239 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0151  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.86 
 
 		 613 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.435912 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4726  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.79 
 
 		 676 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0452393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3093  cyclic-di-GMP regulatory protein  36.16 
 
 		 239 aa  112  7.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0272737 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2075  GGDEF domain/EAL domain-containing protein  32.74 
 
 		 1004 aa  110  3e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4283  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.72 
 
 		 616 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.188884 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0426  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.99 
 
 		 616 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.636145 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3724  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.13 
 
 		 580 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0883602  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0350  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.33 
 
 		 606 aa  107  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0495897  normal  0.0419453 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0028  diguanylate phosphodiesterase  31.11 
 
 		 255 aa  107  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2103  cyclic-di-GMP regulatory protein  29.73 
 
 		 409 aa  107  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.444099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3153  putative diguanylate phosphodiesterase  31.25 
 
 		 584 aa  106  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.920716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3607  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  31.6 
 
 		 620 aa  106  6e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4345  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.2 
 
 		 572 aa  104  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3536  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.04 
 
 		 587 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.220147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2030  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.53 
 
 		 598 aa  104  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149487  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4612  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.04 
 
 		 610 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3018  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.49 
 
 		 612 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140333  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0555  hypothetical protein  28.87 
 
 		 584 aa  103  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0554  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.05 
 
 		 584 aa  104  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0111263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3825  hypothetical protein  34.48 
 
 		 249 aa  103  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.186672  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0378  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor(s)  33.33 
 
 		 475 aa  103  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.150373  normal  0.0425607 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3438  diguanylate phosphodiesterase  33.78 
 
 		 265 aa  103  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2881  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.21 
 
 		 612 aa  103  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.457989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3754  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.24 
 
 		 585 aa  102  8e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000868734  normal  0.0557959 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0005  diguanylate phosphodiesterase  33.19 
 
 		 259 aa  102  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0514  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.19 
 
 		 585 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00136052  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4836  putative diguanylate phosphodiesterase  34.35 
 
 		 254 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.252765  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3936  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.19 
 
 		 585 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.573208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2731  putative diguanylate phosphodiesterase  28.93 
 
 		 259 aa  102  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0637  hypothetical protein  30.86 
 
 		 257 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00815017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0555  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.72 
 
 		 583 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1902  diguanylate phosphodiesterase  27.43 
 
 		 253 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.570063 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3475  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.78 
 
 		 583 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0236  EAL domain protein  30.67 
 
 		 260 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3810  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.85 
 
 		 585 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000137032  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0346  diguanylate phosphodiesterase  35 
 
 		 250 aa  100  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.160431  normal  0.561605 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3242  EAL domain-containing protein  31.98 
 
 		 283 aa  100  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.0750539 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0436  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.79 
 
 		 590 aa  100  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3319  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.34 
 
 		 584 aa  100  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.777593  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3545  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.15 
 
 		 569 aa  100  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1820  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.42 
 
 		 599 aa  99.8  7e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.322861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>