More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_0346 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007644  Moth_0346  diguanylate phosphodiesterase  100 
 
 		 250 aa  497  1e-140  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.160431  normal  0.561605 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0436  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.54 
 
 		 590 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1820  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.28 
 
 		 599 aa  129  6e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.322861  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0894  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.46 
 
 		 605 aa  129  6e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.396651  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3153  putative diguanylate phosphodiesterase  34.04 
 
 		 584 aa  126  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.920716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3724  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.33 
 
 		 580 aa  125  6e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0883602  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3527  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.62 
 
 		 581 aa  125  6e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0555  hypothetical protein  35.24 
 
 		 584 aa  124  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1310  diguanylate phosphodiesterase  32.66 
 
 		 306 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.016111  normal  0.292811 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1061  diguanylate phosphodiesterase  36.92 
 
 		 454 aa  123  3e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.347929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3475  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.24 
 
 		 583 aa  123  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0555  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.24 
 
 		 583 aa  123  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0554  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.24 
 
 		 584 aa  122  6e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0111263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3754  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.62 
 
 		 585 aa  122  7e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000868734  normal  0.0557959 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0514  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.62 
 
 		 585 aa  122  7e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00136052  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4345  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.91 
 
 		 572 aa  122  7e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3936  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.62 
 
 		 585 aa  122  8e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.573208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3319  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.8 
 
 		 584 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.777593  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3810  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.62 
 
 		 585 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000137032  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1718  diguanylate phosphodiesterase  32.26 
 
 		 379 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0187822  normal  0.029577 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4001  diguanylate phosphodiesterase  31.85 
 
 		 357 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838727  normal  0.748991 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1320  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.61 
 
 		 584 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00692574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2139  diguanylate phosphodiesterase  34.72 
 
 		 403 aa  115  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.067843  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3886  EAL domain/GGDEF domain protein  34.86 
 
 		 590 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00288669  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1598  GGDEF:CBS:EAL  34.86 
 
 		 590 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.29213  normal  0.0431902 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1678  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.5 
 
 		 596 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.684126  normal  0.910388 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2103  cyclic-di-GMP regulatory protein  32.29 
 
 		 409 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.444099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0350  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.78 
 
 		 606 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0495897  normal  0.0419453 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2441  diguanylate phosphodiesterase  34.62 
 
 		 443 aa  113  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1510  diguanylate phosphodiesterase  33.19 
 
 		 475 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21870  EAL domain/GGDEF domain-containing protein  32.76 
 
 		 601 aa  111  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.220571  hitchhiker  0.00056029 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2246  diguanylate phosphodiesterase  35.02 
 
 		 413 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.101865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3854  diguanylate phosphodiesterase  34.39 
 
 		 375 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0706  diguanylate phosphodiesterase  30.99 
 
 		 356 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.578959  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0705  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.13 
 
 		 590 aa  109  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2479  diguanylate phosphodiesterase  34.36 
 
 		 416 aa  108  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3536  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.65 
 
 		 587 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.220147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4612  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.65 
 
 		 610 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1194  hypothetical protein  30.8 
 
 		 284 aa  108  6e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.603137  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1097  diguanylate phosphodiesterase  33.2 
 
 		 456 aa  108  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4571  diguanylate phosphodiesterase  33.62 
 
 		 447 aa  107  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.300583 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2042  diguanylate phosphodiesterase  32.03 
 
 		 352 aa  107  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.281797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1771  diguanylate phosphodiesterase  35.94 
 
 		 475 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.142828  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51660  EAL/GGDEF domain-containing protein  35.43 
 
 		 592 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1867  hypothetical protein  32.33 
 
 		 582 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145916  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1803  diguanylate phosphodiesterase  36.28 
 
 		 382 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.507868 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0731  diguanylate phosphodiesterase  27.69 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2411  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.5 
 
 		 632 aa  107  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893826 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2318  diguanylate phosphodiesterase  31.42 
 
 		 371 aa  106  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.440144  normal  0.199138 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2526  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor(s)  35.59 
 
 		 422 aa  106  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0617  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.37 
 
 		 883 aa  106  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00427205 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0326  diguanylate phosphodiesterase  35.32 
 
 		 385 aa  105  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.308148 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2663  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.3 
 
 		 753 aa  106  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0836  diguanylate phosphodiesterase  30.25 
 
 		 252 aa  105  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.861332  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2421  diguanylate phosphodiesterase  34.91 
 
 		 432 aa  105  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0356024  normal  0.0553373 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.77 
 
 		 766 aa  105  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0179  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  36.09 
 
 		 750 aa  105  9e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.102862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1210  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.88 
 
 		 797 aa  105  9e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.489928 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4174  diguanylate phosphodiesterase  33.33 
 
 		 425 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.886993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2099  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  34.06 
 
 		 402 aa  105  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.316821 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2129  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.94 
 
 		 627 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.590205 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1073  diguanylate phosphodiesterase  33.33 
 
 		 367 aa  102  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3633  diguanylate phosphodiesterase  33.48 
 
 		 453 aa  102  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4934  diguanylate phosphodiesterase  33.48 
 
 		 256 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000539515  normal  0.673945 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1152  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  32.68 
 
 		 710 aa  102  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0872705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3571  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.91 
 
 		 611 aa  101  9e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1154  hypothetical protein  31.65 
 
 		 603 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4323  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  36.32 
 
 		 743 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.366607  normal  0.0420324 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1120  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.86 
 
 		 637 aa  100  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0220  hypothetical protein  25.99 
 
 		 362 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2453  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.3 
 
 		 633 aa  100  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2030  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.88 
 
 		 598 aa  100  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149487  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4505  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor(s)  31.78 
 
 		 409 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.660376  normal  0.902865 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0220  hypothetical protein  25.99 
 
 		 360 aa  99.8  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4110  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor(s)  35.38 
 
 		 411 aa  99.8  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2783  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  35.06 
 
 		 1101 aa  99  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3107  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.87 
 
 		 610 aa  98.2  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3825  hypothetical protein  31.96 
 
 		 249 aa  97.4  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.186672  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3093  cyclic-di-GMP regulatory protein  29.95 
 
 		 239 aa  97.8  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0272737 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3462  RNase II stability modulator  31.06 
 
 		 667 aa  96.7  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.347087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0122  EAL  30.36 
 
 		 525 aa  96.7  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3442  diguanylate phosphodiesterase  32.87 
 
 		 254 aa  96.7  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5285  RNase II stability modulator  31.91 
 
 		 667 aa  96.7  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.445502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0529  diguanylate phosphodiesterase  34.31 
 
 		 378 aa  96.3  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.907499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1731  diguanylate phosphodiesterase  37.79 
 
 		 378 aa  96.3  5e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1571  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.78 
 
 		 583 aa  95.9  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.260448  normal  0.637098 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3732  diguanylate phosphodiesterase  32.88 
 
 		 271 aa  95.5  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.731065  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04753  Response regulator with EAL domain  32.3 
 
 		 417 aa  95.5  7e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.736071  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1949  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.03 
 
 		 773 aa  95.5  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0699  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.44 
 
 		 633 aa  95.1  8e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3635  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.8 
 
 		 656 aa  95.1  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3777  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.3 
 
 		 594 aa  95.5  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4854  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.3 
 
 		 594 aa  95.5  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3232  diguanylate phosphodiesterase  33.33 
 
 		 266 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.72536  normal  0.33635 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0828  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  28.89 
 
 		 734 aa  94  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.84548  normal  0.140102 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5174  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  35.05 
 
 		 703 aa  94  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.903635 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0553  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32 
 
 		 699 aa  93.6  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0467  EAL domain protein  27.63 
 
 		 351 aa  93.2  3e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0116221  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4614  diguanylate phosphodiesterase  33.33 
 
 		 378 aa  93.2  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1388  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.15 
 
 		 806 aa  93.2  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.844108  normal  0.953027 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>