More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4934 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4934  diguanylate phosphodiesterase  100 
 
 
256 aa  529  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000539515  normal  0.673945 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3442  diguanylate phosphodiesterase  60.98 
 
 
254 aa  318  5e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0264  diguanylate phosphodiesterase  58.44 
 
 
259 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.317431 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3232  diguanylate phosphodiesterase  58.4 
 
 
266 aa  298  5e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.72536  normal  0.33635 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0914  EAL domain-containing protein  56.97 
 
 
256 aa  295  4e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0236  EAL domain protein  58.44 
 
 
260 aa  295  5e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1408  diguanylate phosphodiesterase  57.66 
 
 
332 aa  295  5e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.939193  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3107  diguanylate phosphodiesterase  57.43 
 
 
259 aa  292  4e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.757565  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0171  EAL  57.2 
 
 
260 aa  291  8e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1902  diguanylate phosphodiesterase  55.1 
 
 
253 aa  288  5.0000000000000004e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.570063 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1247  hypothetical protein  53.39 
 
 
257 aa  283  1.0000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000126257  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1172  diguanylate phosphodiesterase  54.17 
 
 
258 aa  278  7e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.459391 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1584  diguanylate phosphodiesterase  51.2 
 
 
263 aa  276  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0237519  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1233  diguanylate phosphodiesterase  53.11 
 
 
258 aa  275  8e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0028  diguanylate phosphodiesterase  50.82 
 
 
255 aa  270  2e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2208  diguanylate phosphodiesterase  54.89 
 
 
254 aa  270  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2731  putative diguanylate phosphodiesterase  48.18 
 
 
259 aa  264  1e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0519  diguanylate phosphodiesterase  49.59 
 
 
257 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3798  diguanylate phosphodiesterase  49.19 
 
 
257 aa  261  8e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0545  diguanylate phosphodiesterase  49.19 
 
 
257 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0525  diguanylate phosphodiesterase  52.74 
 
 
251 aa  261  1e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3566  diguanylate phosphodiesterase  51.88 
 
 
265 aa  259  4e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333064  normal  0.483567 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0541  diguanylate phosphodiesterase  48.58 
 
 
257 aa  258  7e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3438  diguanylate phosphodiesterase  51.46 
 
 
265 aa  257  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3242  EAL domain-containing protein  50.6 
 
 
283 aa  257  1e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.0750539 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0601  diguanylate phosphodiesterase  47.64 
 
 
258 aa  256  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0883  diguanylate phosphodiesterase  47.41 
 
 
262 aa  255  4e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0005  diguanylate phosphodiesterase  50.84 
 
 
259 aa  253  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162907  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3825  hypothetical protein  49.39 
 
 
249 aa  252  4.0000000000000004e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.186672  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2810  diguanylate phosphodiesterase  52.28 
 
 
257 aa  251  9.000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2934  diguanylate phosphodiesterase  51.33 
 
 
252 aa  249  3e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.780718  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0024  diguanylate phosphodiesterase  48.72 
 
 
246 aa  249  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.481277  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0026  diguanylate phosphodiesterase  48.72 
 
 
246 aa  249  4e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0637  hypothetical protein  47.9 
 
 
257 aa  243  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00815017  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1747  diguanylate phosphodiesterase  48.74 
 
 
291 aa  242  5e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.087315  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0806  signal protein  46.64 
 
 
257 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2830  diguanylate phosphodiesterase  48.31 
 
 
253 aa  232  5e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.011956  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1965  diguanylate phosphodiesterase  45.93 
 
 
248 aa  229  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.616941  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2342  diguanylate phosphodiesterase  46.72 
 
 
257 aa  221  7e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0792  diguanylate phosphodiesterase  47.27 
 
 
224 aa  212  4.9999999999999996e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.307783 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3093  cyclic-di-GMP regulatory protein  39.82 
 
 
239 aa  194  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0272737 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0635  diguanylate phosphodiesterase  35.87 
 
 
340 aa  162  4.0000000000000004e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0706  diguanylate phosphodiesterase  36.77 
 
 
356 aa  161  7e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.578959  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0828  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  35.02 
 
 
734 aa  160  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.84548  normal  0.140102 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0467  EAL domain protein  34.57 
 
 
351 aa  161  1e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0116221  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2663  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.77 
 
 
753 aa  158  7e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1138  diguanylate phosphodiesterase  38.29 
 
 
266 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0617  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.41 
 
 
883 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00427205 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1073  diguanylate phosphodiesterase  35 
 
 
367 aa  150  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2042  diguanylate phosphodiesterase  35.29 
 
 
352 aa  150  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.281797  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51660  EAL/GGDEF domain-containing protein  35.32 
 
 
592 aa  148  9e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2318  diguanylate phosphodiesterase  36.91 
 
 
371 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.440144  normal  0.199138 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0058  diguanylate phosphodiesterase  37.73 
 
 
357 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1210  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.75 
 
 
797 aa  145  5e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.489928 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.56 
 
 
766 aa  144  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1320  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.23 
 
 
584 aa  144  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00692574  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0436  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.1 
 
 
590 aa  144  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0220  hypothetical protein  32.72 
 
 
362 aa  141  9e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0220  hypothetical protein  32.72 
 
 
360 aa  141  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1061  diguanylate phosphodiesterase  34.82 
 
 
454 aa  141  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.347929  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0894  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.4 
 
 
605 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.396651  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1310  diguanylate phosphodiesterase  34.56 
 
 
306 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.016111  normal  0.292811 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1949  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.64 
 
 
773 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0705  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.26 
 
 
590 aa  138  7.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4345  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.64 
 
 
572 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2411  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.88 
 
 
632 aa  137  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893826 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1718  diguanylate phosphodiesterase  33.64 
 
 
379 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0187822  normal  0.029577 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1510  diguanylate phosphodiesterase  35.45 
 
 
475 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0176  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.18 
 
 
786 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000781405  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3527  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.89 
 
 
581 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3886  EAL domain/GGDEF domain protein  34.68 
 
 
590 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00288669  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3724  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.51 
 
 
580 aa  135  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0883602  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3153  putative diguanylate phosphodiesterase  33.18 
 
 
584 aa  135  5e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.920716  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1820  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31 
 
 
599 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.322861  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00175  hypothetical protein ycgF  32.89 
 
 
390 aa  135  7.000000000000001e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4001  diguanylate phosphodiesterase  33.64 
 
 
357 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838727  normal  0.748991 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1194  hypothetical protein  32.17 
 
 
284 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.603137  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3475  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.72 
 
 
583 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0555  hypothetical protein  32.58 
 
 
584 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3936  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.64 
 
 
585 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.573208  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0514  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.64 
 
 
585 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00136052  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3810  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.64 
 
 
585 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000137032  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0555  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.72 
 
 
583 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0554  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.58 
 
 
584 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0111263  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3754  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.64 
 
 
585 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000868734  normal  0.0557959 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1678  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.72 
 
 
596 aa  132  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.684126  normal  0.910388 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3319  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.48 
 
 
584 aa  132  5e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.777593  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2103  cyclic-di-GMP regulatory protein  30.84 
 
 
409 aa  132  7.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.444099  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1598  GGDEF:CBS:EAL  33.78 
 
 
590 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.29213  normal  0.0431902 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21870  EAL domain/GGDEF domain-containing protein  32.88 
 
 
601 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.220571  hitchhiker  0.00056029 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1867  hypothetical protein  33.33 
 
 
582 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145916  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2246  diguanylate phosphodiesterase  36.04 
 
 
413 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.101865  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0699  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.73 
 
 
633 aa  123  2e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1514  diguanylate phosphodiesterase  30.14 
 
 
437 aa  124  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000323461  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3082  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.33 
 
 
517 aa  122  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.720655  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1986  BLUF/cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  31.31 
 
 
403 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.758889  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01138  predicted FAD-binding phosphodiesterase  30.57 
 
 
403 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1757  diguanylate phosphodiesterase  33.48 
 
 
418 aa  120  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388257  hitchhiker  0.000204445 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01146  hypothetical protein  30.57 
 
 
403 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2032  diguanylate phosphodiesterase  31.16 
 
 
406 aa  120  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.252984 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>