More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0705 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0705  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  100 
 
 
590 aa  1215    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3319  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  46.13 
 
 
584 aa  513  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.777593  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3527  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  46.41 
 
 
581 aa  509  1e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3810  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  45.77 
 
 
585 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000137032  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0514  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  44.92 
 
 
585 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00136052  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0555  hypothetical protein  45.95 
 
 
584 aa  504  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3754  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  45.6 
 
 
585 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000868734  normal  0.0557959 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0555  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  45.8 
 
 
583 aa  496  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0554  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  45.62 
 
 
584 aa  497  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0111263  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3886  EAL domain/GGDEF domain protein  43.7 
 
 
590 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00288669  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3936  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  45.08 
 
 
585 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.573208  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3475  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  45.62 
 
 
583 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1598  GGDEF:CBS:EAL  42.88 
 
 
590 aa  490  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.29213  normal  0.0431902 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1678  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  42.83 
 
 
596 aa  487  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.684126  normal  0.910388 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1320  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  42.51 
 
 
584 aa  488  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00692574  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51660  EAL/GGDEF domain-containing protein  41.94 
 
 
592 aa  480  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4345  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  43.09 
 
 
572 aa  477  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3724  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  43.83 
 
 
580 aa  474  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0883602  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21870  EAL domain/GGDEF domain-containing protein  41.8 
 
 
601 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.220571  hitchhiker  0.00056029 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3153  putative diguanylate phosphodiesterase  44.89 
 
 
584 aa  475  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.920716  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2411  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  41.75 
 
 
632 aa  475  1e-132  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893826 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0436  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  44.32 
 
 
590 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1867  hypothetical protein  41.28 
 
 
582 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145916  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3571  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.96 
 
 
611 aa  412  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0350  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.23 
 
 
606 aa  397  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0495897  normal  0.0419453 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1820  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.54 
 
 
599 aa  396  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.322861  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3107  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.44 
 
 
610 aa  367  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0894  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.99 
 
 
605 aa  365  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.396651  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2453  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.26 
 
 
633 aa  363  4e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1949  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.26 
 
 
773 aa  362  8e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4283  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.28 
 
 
616 aa  359  7e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.188884 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0426  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.87 
 
 
616 aa  355  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.636145 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4854  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.21 
 
 
594 aa  354  2e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3777  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.21 
 
 
594 aa  354  2e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1120  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.21 
 
 
637 aa  352  1e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0151  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.08 
 
 
613 aa  343  5e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.435912 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2663  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.38 
 
 
753 aa  340  5.9999999999999996e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0617  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.46 
 
 
883 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00427205 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3536  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.69 
 
 
587 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.220147  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4612  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.27 
 
 
610 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2966  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.35 
 
 
613 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0176  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.96 
 
 
786 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000781405  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6320  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.24 
 
 
612 aa  335  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2991  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.24 
 
 
615 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2030  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.98 
 
 
598 aa  335  2e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149487  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3018  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.01 
 
 
612 aa  333  6e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140333  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2129  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.18 
 
 
627 aa  332  9e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.590205 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2881  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.19 
 
 
612 aa  332  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.457989  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2357  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.89 
 
 
613 aa  332  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2971  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.89 
 
 
613 aa  332  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.900441  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.29 
 
 
766 aa  325  2e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4726  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.18 
 
 
676 aa  318  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0452393  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1210  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.85 
 
 
797 aa  317  3e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.489928 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2103  cyclic-di-GMP regulatory protein  38.12 
 
 
409 aa  294  3e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.444099  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1842  EAL domain protein  29.66 
 
 
590 aa  264  4e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.449408  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2369  diguanylate cyclase  39.05 
 
 
353 aa  260  6e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34805  normal  0.423605 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0567  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.1 
 
 
599 aa  253  9.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75252  normal  0.598217 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4001  diguanylate phosphodiesterase  42.11 
 
 
357 aa  247  6e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838727  normal  0.748991 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1718  diguanylate phosphodiesterase  51.45 
 
 
379 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0187822  normal  0.029577 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1154  hypothetical protein  29.89 
 
 
603 aa  242  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1310  diguanylate phosphodiesterase  49.61 
 
 
306 aa  240  5e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.016111  normal  0.292811 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0613  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.03 
 
 
1036 aa  226  8e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.147117  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0699  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.29 
 
 
633 aa  221  1.9999999999999999e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1510  diguanylate phosphodiesterase  42.8 
 
 
475 aa  207  6e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2675  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  24.75 
 
 
1023 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0543152  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1388  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.45 
 
 
806 aa  197  3e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.844108  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1194  hypothetical protein  43.4 
 
 
284 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.603137  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5145  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.77 
 
 
565 aa  180  8e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.881972  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3230  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.44 
 
 
594 aa  179  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.74861  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2479  diguanylate phosphodiesterase  34.82 
 
 
416 aa  155  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0467  EAL domain protein  34.47 
 
 
351 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0116221  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1514  diguanylate phosphodiesterase  34.78 
 
 
437 aa  152  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000323461  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0828  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  34.4 
 
 
734 aa  148  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.84548  normal  0.140102 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4836  putative diguanylate phosphodiesterase  35.42 
 
 
254 aa  144  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.252765  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4934  diguanylate phosphodiesterase  32.26 
 
 
256 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000539515  normal  0.673945 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0424  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.1 
 
 
441 aa  137  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.130175  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1033  diguanylate phosphodiesterase  32 
 
 
413 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0730  diguanylate cyclase  27.18 
 
 
343 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1771  diguanylate phosphodiesterase  34.03 
 
 
475 aa  134  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.142828  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.72 
 
 
310 aa  134  6e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1534  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.48 
 
 
642 aa  133  6.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.376143  normal  0.346331 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1371  diguanylate phosphodiesterase  31.03 
 
 
361 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0635  diguanylate phosphodiesterase  30.34 
 
 
340 aa  130  8.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0264  diguanylate phosphodiesterase  34.25 
 
 
259 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.317431 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1408  diguanylate phosphodiesterase  33.48 
 
 
332 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.939193  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0819  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.18 
 
 
793 aa  129  1.0000000000000001e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00766455  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0201  diguanylate cyclase  34.9 
 
 
446 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2139  diguanylate phosphodiesterase  35.02 
 
 
403 aa  129  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.067843  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1233  diguanylate phosphodiesterase  33.62 
 
 
258 aa  128  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0891  GGDEF family protein  33.58 
 
 
433 aa  128  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.331841  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4571  diguanylate phosphodiesterase  36.05 
 
 
447 aa  128  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.300583 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2061  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.46 
 
 
318 aa  128  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365539  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1247  hypothetical protein  32.48 
 
 
257 aa  128  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000126257  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1985  diguanylate phosphodiesterase  35.53 
 
 
485 aa  128  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.299339  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1172  diguanylate phosphodiesterase  33.64 
 
 
258 aa  128  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.459391 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1584  diguanylate phosphodiesterase  35.62 
 
 
263 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0237519  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0005  diguanylate phosphodiesterase  32.19 
 
 
259 aa  127  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162907  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0236  EAL domain protein  33.33 
 
 
260 aa  127  6e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0909  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.22 
 
 
848 aa  127  8.000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3633  diguanylate phosphodiesterase  33.86 
 
 
453 aa  126  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>