More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2042 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_2042  diguanylate phosphodiesterase  100 
 
 		 352 aa  720    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.281797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0706  diguanylate phosphodiesterase  46.57 
 
 		 356 aa  322  4e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.578959  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2318  diguanylate phosphodiesterase  46.05 
 
 		 371 aa  315  7e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.440144  normal  0.199138 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0058  diguanylate phosphodiesterase  45.85 
 
 		 357 aa  304  1.0000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1073  diguanylate phosphodiesterase  42.49 
 
 		 367 aa  290  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0828  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  40.17 
 
 		 734 aa  244  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.84548  normal  0.140102 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0220  hypothetical protein  34.48 
 
 		 362 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0467  EAL domain protein  32.58 
 
 		 351 aa  209  4e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0116221  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0220  hypothetical protein  34.2 
 
 		 360 aa  209  7e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0635  diguanylate phosphodiesterase  36.84 
 
 		 340 aa  198  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3232  diguanylate phosphodiesterase  38.05 
 
 		 266 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.72536  normal  0.33635 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3566  diguanylate phosphodiesterase  40.57 
 
 		 265 aa  168  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333064  normal  0.483567 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3442  diguanylate phosphodiesterase  38.77 
 
 		 254 aa  168  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1408  diguanylate phosphodiesterase  38.77 
 
 		 332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.939193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3242  EAL domain-containing protein  40.16 
 
 		 283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.0750539 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2208  diguanylate phosphodiesterase  35.17 
 
 		 254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3886  EAL domain/GGDEF domain protein  38.59 
 
 		 590 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00288669  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3438  diguanylate phosphodiesterase  38.93 
 
 		 265 aa  160  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1598  GGDEF:CBS:EAL  38.17 
 
 		 590 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.29213  normal  0.0431902 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1678  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.59 
 
 		 596 aa  160  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.684126  normal  0.910388 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1320  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.73 
 
 		 584 aa  159  7e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00692574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2830  diguanylate phosphodiesterase  39.74 
 
 		 253 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.011956  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0883  diguanylate phosphodiesterase  37.07 
 
 		 262 aa  155  7e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0024  diguanylate phosphodiesterase  36.16 
 
 		 246 aa  155  9e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.481277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0026  diguanylate phosphodiesterase  36.16 
 
 		 246 aa  155  9e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1718  diguanylate phosphodiesterase  34.16 
 
 		 379 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0187822  normal  0.029577 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0236  EAL domain protein  36.82 
 
 		 260 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1949  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.58 
 
 		 773 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1247  hypothetical protein  34.05 
 
 		 257 aa  155  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000126257  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0171  EAL  36.82 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0028  diguanylate phosphodiesterase  36.99 
 
 		 255 aa  154  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0806  signal protein  35.86 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1310  diguanylate phosphodiesterase  37.44 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.016111  normal  0.292811 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1210  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.57 
 
 		 797 aa  154  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.489928 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51660  EAL/GGDEF domain-containing protein  37.55 
 
 		 592 aa  153  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0894  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.14 
 
 		 605 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.396651  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4001  diguanylate phosphodiesterase  35.17 
 
 		 357 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838727  normal  0.748991 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21870  EAL domain/GGDEF domain-containing protein  35.09 
 
 		 601 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.220571  hitchhiker  0.00056029 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0176  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.61 
 
 		 786 aa  152  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000781405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1902  diguanylate phosphodiesterase  33.93 
 
 		 253 aa  151  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.570063 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2810  diguanylate phosphodiesterase  35.81 
 
 		 257 aa  150  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1867  hypothetical protein  35.92 
 
 		 582 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145916  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4934  diguanylate phosphodiesterase  35.29 
 
 		 256 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000539515  normal  0.673945 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3527  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.75 
 
 		 581 aa  150  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0005  diguanylate phosphodiesterase  35.56 
 
 		 259 aa  149  7e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0525  diguanylate phosphodiesterase  36.16 
 
 		 251 aa  149  8e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2411  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.19 
 
 		 632 aa  149  8e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893826 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0617  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.17 
 
 		 883 aa  147  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00427205 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2934  diguanylate phosphodiesterase  36.77 
 
 		 252 aa  147  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.780718  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3825  hypothetical protein  37.93 
 
 		 249 aa  147  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.186672  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0914  EAL domain-containing protein  33.19 
 
 		 256 aa  146  5e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0541  diguanylate phosphodiesterase  33.78 
 
 		 257 aa  146  5e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0545  diguanylate phosphodiesterase  32.89 
 
 		 257 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.89 
 
 		 766 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3798  diguanylate phosphodiesterase  32.89 
 
 		 257 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1747  diguanylate phosphodiesterase  36.12 
 
 		 291 aa  145  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.087315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0519  diguanylate phosphodiesterase  32.89 
 
 		 257 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4345  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.9 
 
 		 572 aa  144  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0601  diguanylate phosphodiesterase  33.33 
 
 		 258 aa  143  5e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1388  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.09 
 
 		 806 aa  143  5e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.844108  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3107  diguanylate phosphodiesterase  37.44 
 
 		 259 aa  142  7e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.757565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0436  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.47 
 
 		 590 aa  142  8e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0264  diguanylate phosphodiesterase  35 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317431 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2663  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.18 
 
 		 753 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3724  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.63 
 
 		 580 aa  140  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0883602  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1233  diguanylate phosphodiesterase  33.48 
 
 		 258 aa  139  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3153  putative diguanylate phosphodiesterase  34.32 
 
 		 584 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.920716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0637  hypothetical protein  33.48 
 
 		 257 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00815017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1172  diguanylate phosphodiesterase  33.48 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.459391 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3475  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.53 
 
 		 583 aa  137  4e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0555  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.53 
 
 		 583 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0555  hypothetical protein  34.53 
 
 		 584 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3319  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.47 
 
 		 584 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.777593  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0699  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.87 
 
 		 633 aa  136  7.000000000000001e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1820  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.28 
 
 		 599 aa  135  8e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.322861  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0514  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.47 
 
 		 585 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00136052  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3754  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.47 
 
 		 585 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000868734  normal  0.0557959 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3936  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.47 
 
 		 585 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.573208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3810  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.47 
 
 		 585 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000137032  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2731  putative diguanylate phosphodiesterase  33.92 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0554  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.08 
 
 		 584 aa  134  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0111263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2103  cyclic-di-GMP regulatory protein  33.9 
 
 		 409 aa  133  5e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.444099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3571  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.47 
 
 		 611 aa  132  6.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1584  diguanylate phosphodiesterase  32.89 
 
 		 263 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0237519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1371  diguanylate phosphodiesterase  34.22 
 
 		 361 aa  129  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3093  cyclic-di-GMP regulatory protein  31.93 
 
 		 239 aa  129  9.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0272737 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2342  diguanylate phosphodiesterase  36.1 
 
 		 257 aa  127  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1510  diguanylate phosphodiesterase  30.08 
 
 		 475 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0792  diguanylate phosphodiesterase  34.11 
 
 		 224 aa  125  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.307783 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1965  diguanylate phosphodiesterase  33.92 
 
 		 248 aa  122  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.616941  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1560  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.44 
 
 		 800 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0426061  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0567  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.13 
 
 		 599 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75252  normal  0.598217 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2479  diguanylate phosphodiesterase  33.33 
 
 		 416 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1033  diguanylate phosphodiesterase  30.83 
 
 		 413 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1136  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.47 
 
 		 799 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.415908  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1514  diguanylate phosphodiesterase  31.78 
 
 		 437 aa  117  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000323461  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2032  diguanylate phosphodiesterase  30.43 
 
 		 406 aa  117  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.252984 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00175  hypothetical protein ycgF  31.9 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000286  response regulator VieA  29.46 
 
 		 384 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.926031  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2712  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.62 
 
 		 793 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.109908 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>