More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0529 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0529  diguanylate phosphodiesterase  100 
 
 
378 aa  746    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.907499  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1097  diguanylate phosphodiesterase  41.56 
 
 
456 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4614  diguanylate phosphodiesterase  43.51 
 
 
378 aa  232  6e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1691  diguanylate phosphodiesterase  41.91 
 
 
366 aa  228  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000214274 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3633  diguanylate phosphodiesterase  40.42 
 
 
453 aa  225  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0300  diguanylate phosphodiesterase  41.93 
 
 
362 aa  212  7.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.907769  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2441  diguanylate phosphodiesterase  48.92 
 
 
443 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1803  diguanylate phosphodiesterase  40.34 
 
 
382 aa  189  7e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.507868 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5253  diguanylate phosphodiesterase  37.25 
 
 
392 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.550971 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3112  diguanylate phosphodiesterase  47.77 
 
 
244 aa  162  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2421  diguanylate phosphodiesterase  41.07 
 
 
432 aa  155  8e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0356024  normal  0.0553373 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2139  diguanylate phosphodiesterase  40.72 
 
 
403 aa  153  4e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.067843  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4505  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor(s)  38.79 
 
 
409 aa  152  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.660376  normal  0.902865 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2246  diguanylate phosphodiesterase  41.59 
 
 
413 aa  149  6e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.101865  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1061  diguanylate phosphodiesterase  37.16 
 
 
454 aa  146  6e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.347929  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0227  diguanylate phosphodiesterase  34.98 
 
 
429 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2099  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  38.86 
 
 
402 aa  140  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.316821 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1771  diguanylate phosphodiesterase  37.72 
 
 
475 aa  140  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.142828  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1985  diguanylate phosphodiesterase  37.44 
 
 
485 aa  139  7e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.299339  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1731  diguanylate phosphodiesterase  45.33 
 
 
378 aa  139  8.999999999999999e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4571  diguanylate phosphodiesterase  36.97 
 
 
447 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.300583 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4174  diguanylate phosphodiesterase  37.78 
 
 
425 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.886993  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4110  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor(s)  37.61 
 
 
411 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1906  diguanylate phosphodiesterase  36.36 
 
 
410 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0735137  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2663  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.7 
 
 
753 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1949  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.18 
 
 
773 aa  132  9e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1152  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  37.04 
 
 
710 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0872705  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4968  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor(s)  39.83 
 
 
447 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49831  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0179  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  42.06 
 
 
750 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.102862  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1402  diguanylate phosphodiesterase  37.59 
 
 
372 aa  130  3e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.281797  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0172  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor(s)  36.24 
 
 
419 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0212595  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0177  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor(s)  36.77 
 
 
419 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5174  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  35.87 
 
 
703 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.903635 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0705  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.14 
 
 
590 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0617  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.22 
 
 
883 aa  127  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00427205 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1510  diguanylate phosphodiesterase  37.27 
 
 
475 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2526  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor(s)  38.71 
 
 
422 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1210  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.23 
 
 
797 aa  124  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.489928 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0232  diguanylate phosphodiesterase  35.24 
 
 
352 aa  122  9e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1598  GGDEF:CBS:EAL  32.3 
 
 
590 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.29213  normal  0.0431902 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0326  diguanylate phosphodiesterase  39.22 
 
 
385 aa  120  4.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.308148 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51660  EAL/GGDEF domain-containing protein  37.39 
 
 
592 aa  119  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1678  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.87 
 
 
596 aa  119  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.684126  normal  0.910388 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3883  diguanylate phosphodiesterase  40.57 
 
 
442 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.385825  decreased coverage  0.00073239 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3724  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.21 
 
 
580 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0883602  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0151  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.31 
 
 
613 aa  117  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.435912 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21870  EAL domain/GGDEF domain-containing protein  32.31 
 
 
601 aa  116  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.220571  hitchhiker  0.00056029 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0426  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.78 
 
 
616 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.636145 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1320  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.27 
 
 
584 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00692574  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0350  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.2 
 
 
606 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0495897  normal  0.0419453 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3886  EAL domain/GGDEF domain protein  37.05 
 
 
590 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00288669  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3854  diguanylate phosphodiesterase  36.32 
 
 
375 aa  113  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1194  hypothetical protein  35.43 
 
 
284 aa  113  6e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.603137  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1514  diguanylate phosphodiesterase  36.32 
 
 
437 aa  113  6e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000323461  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.56 
 
 
766 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3527  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.09 
 
 
581 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3082  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.48 
 
 
517 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.720655  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2103  cyclic-di-GMP regulatory protein  33.63 
 
 
409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.444099  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3571  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.87 
 
 
611 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2479  diguanylate phosphodiesterase  37.33 
 
 
416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0176  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.64 
 
 
786 aa  110  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000781405  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0914  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.04 
 
 
656 aa  110  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0360964 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0436  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.73 
 
 
590 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0346  diguanylate phosphodiesterase  34.31 
 
 
250 aa  109  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.160431  normal  0.561605 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4345  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.37 
 
 
572 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4283  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.7 
 
 
616 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.188884 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3153  putative diguanylate phosphodiesterase  34.98 
 
 
584 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.920716  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3319  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.55 
 
 
584 aa  107  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.777593  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1867  hypothetical protein  35.45 
 
 
582 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145916  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0378  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor(s)  31.84 
 
 
475 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.150373  normal  0.0425607 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0555  hypothetical protein  34.55 
 
 
584 aa  107  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0555  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.55 
 
 
583 aa  107  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3475  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.55 
 
 
583 aa  107  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0554  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.55 
 
 
584 aa  107  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0111263  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2411  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.18 
 
 
632 aa  107  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893826 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0819  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.91 
 
 
793 aa  106  5e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00766455  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0467  EAL domain protein  33.79 
 
 
351 aa  106  6e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0116221  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2129  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.44 
 
 
627 aa  106  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.590205 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3093  cyclic-di-GMP regulatory protein  32.72 
 
 
239 aa  106  6e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0272737 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3462  RNase II stability modulator  36.09 
 
 
667 aa  106  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.347087  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2109  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.12 
 
 
570 aa  106  7e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0707223  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5285  RNase II stability modulator  36.09 
 
 
667 aa  106  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.445502  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4146  GGDEF domain-containing protein  33.78 
 
 
777 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1718  diguanylate phosphodiesterase  35.53 
 
 
379 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0187822  normal  0.029577 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2067  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.8 
 
 
705 aa  104  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3076  diguanylate phosphodiesterase  33.04 
 
 
285 aa  104  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0447  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.14 
 
 
549 aa  104  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2641  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.78 
 
 
1118 aa  104  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.604832  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3754  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.08 
 
 
585 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000868734  normal  0.0557959 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1820  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.58 
 
 
599 aa  104  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.322861  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3936  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.08 
 
 
585 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.573208  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0514  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.08 
 
 
585 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00136052  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0172  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.29 
 
 
685 aa  104  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3810  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.08 
 
 
585 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000137032  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4001  diguanylate phosphodiesterase  36.16 
 
 
357 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838727  normal  0.748991 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1138  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.84 
 
 
827 aa  103  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.0051075  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1312  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.76 
 
 
776 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5122  RNase II stability modulator  34.78 
 
 
667 aa  103  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0232161 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2339  aminoglycoside response regulator  32.88 
 
 
526 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000320511  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4747  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  35.09 
 
 
623 aa  103  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.311394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>