More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1152 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1152  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  100 
 
 
710 aa  1421    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0872705  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5174  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  75.51 
 
 
703 aa  999    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.903635 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1061  diguanylate phosphodiesterase  37.11 
 
 
454 aa  252  2e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.347929  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4174  diguanylate phosphodiesterase  37.4 
 
 
425 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.886993  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4505  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor(s)  37.01 
 
 
409 aa  249  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.660376  normal  0.902865 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0227  diguanylate phosphodiesterase  33.51 
 
 
429 aa  237  6e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0172  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor(s)  35.03 
 
 
419 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0212595  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2139  diguanylate phosphodiesterase  36.03 
 
 
403 aa  233  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.067843  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0177  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor(s)  34.95 
 
 
419 aa  232  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0378  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor(s)  35.05 
 
 
475 aa  226  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.150373  normal  0.0425607 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2246  diguanylate phosphodiesterase  32.82 
 
 
413 aa  221  3.9999999999999997e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.101865  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0179  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  40.05 
 
 
750 aa  219  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.102862  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2421  diguanylate phosphodiesterase  34.72 
 
 
432 aa  218  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0356024  normal  0.0553373 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4968  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor(s)  35.77 
 
 
447 aa  216  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49831  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2526  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor(s)  36.53 
 
 
422 aa  207  5e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4110  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor(s)  34.74 
 
 
411 aa  197  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3883  diguanylate phosphodiesterase  35.75 
 
 
442 aa  188  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.385825  decreased coverage  0.00073239 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2099  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  46.95 
 
 
402 aa  186  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.316821 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2071  hypothetical protein  34.92 
 
 
512 aa  179  1e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0137  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor(s)  33.96 
 
 
407 aa  178  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.116698  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2061  hypothetical protein  34.58 
 
 
512 aa  175  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1906  diguanylate phosphodiesterase  42.6 
 
 
410 aa  174  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0735137  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1985  diguanylate phosphodiesterase  38.84 
 
 
485 aa  172  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.299339  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1771  diguanylate phosphodiesterase  41.05 
 
 
475 aa  169  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.142828  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0326  diguanylate phosphodiesterase  38.83 
 
 
385 aa  162  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.308148 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0617  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.99 
 
 
883 aa  159  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00427205 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0829  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.79 
 
 
994 aa  159  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3854  diguanylate phosphodiesterase  39.83 
 
 
375 aa  151  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4554  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.87 
 
 
331 aa  150  9e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4571  diguanylate phosphodiesterase  30.65 
 
 
447 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.300583 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1662  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.86 
 
 
820 aa  148  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.29973  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0137  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.2 
 
 
763 aa  144  7e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0176  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.94 
 
 
786 aa  143  9e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000781405  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1770  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.81 
 
 
769 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0395066  normal  0.809527 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2411  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.25 
 
 
632 aa  143  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893826 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3724  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.05 
 
 
580 aa  139  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0883602  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6871  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.82 
 
 
720 aa  139  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1210  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.07 
 
 
797 aa  139  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.489928 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0232  diguanylate phosphodiesterase  33.96 
 
 
352 aa  137  9e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3936  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.95 
 
 
585 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.573208  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1318  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.8 
 
 
720 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.939542  normal  0.14823 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0554  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.1 
 
 
584 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0111263  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3754  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.76 
 
 
585 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000868734  normal  0.0557959 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0514  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.76 
 
 
585 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00136052  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3153  putative diguanylate phosphodiesterase  25.54 
 
 
584 aa  135  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.920716  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5253  diguanylate phosphodiesterase  39.51 
 
 
392 aa  134  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.550971 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2663  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.48 
 
 
753 aa  134  5e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3810  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.56 
 
 
585 aa  134  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000137032  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2441  diguanylate phosphodiesterase  36.99 
 
 
443 aa  133  9e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0555  hypothetical protein  24.9 
 
 
584 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1097  diguanylate phosphodiesterase  36.86 
 
 
456 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3475  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.9 
 
 
583 aa  132  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4614  diguanylate phosphodiesterase  34.6 
 
 
378 aa  132  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2389  hypothetical protein  29.89 
 
 
741 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1361  diguanylate cyclase  32.39 
 
 
731 aa  131  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3633  diguanylate phosphodiesterase  35.74 
 
 
453 aa  130  9.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2783  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  37.15 
 
 
1101 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1949  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.54 
 
 
773 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6320  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.75 
 
 
612 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1803  diguanylate phosphodiesterase  34.98 
 
 
382 aa  129  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.507868 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2213  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  29.87 
 
 
742 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0024682 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2693  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.85 
 
 
960 aa  128  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0967779  normal  0.228544 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7376  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.25 
 
 
736 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25 
 
 
766 aa  128  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21870  EAL domain/GGDEF domain-containing protein  34.03 
 
 
601 aa  127  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.220571  hitchhiker  0.00056029 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3902  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.71 
 
 
990 aa  127  9e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2881  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.1 
 
 
612 aa  126  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.457989  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4283  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.07 
 
 
616 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.188884 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1366  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.18 
 
 
329 aa  125  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0426  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.84 
 
 
616 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.636145 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0442  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  34.9 
 
 
1785 aa  125  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5036  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.62 
 
 
296 aa  125  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.261853  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0300  diguanylate phosphodiesterase  37.22 
 
 
362 aa  125  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.907769  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3018  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.1 
 
 
612 aa  125  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140333  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1691  diguanylate phosphodiesterase  37.21 
 
 
366 aa  124  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000214274 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3750  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.17 
 
 
718 aa  124  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0894  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.43 
 
 
605 aa  125  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.396651  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2855  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  52.89 
 
 
712 aa  124  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3571  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.19 
 
 
611 aa  124  6e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0350  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.29 
 
 
606 aa  124  8e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0495897  normal  0.0419453 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2991  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.49 
 
 
615 aa  123  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2971  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.3 
 
 
613 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.900441  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2357  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.3 
 
 
613 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2565  two component signal transduction response regulator  30.21 
 
 
703 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1867  hypothetical protein  32.92 
 
 
582 aa  122  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145916  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4345  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.92 
 
 
572 aa  122  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1718  diguanylate phosphodiesterase  36.1 
 
 
379 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0187822  normal  0.029577 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0705  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30 
 
 
590 aa  121  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2308  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.64 
 
 
752 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.245361  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000065  diguanylate cyclase/phosphodiesterase domain 2  30.42 
 
 
320 aa  121  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3112  diguanylate phosphodiesterase  39.22 
 
 
244 aa  120  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1510  diguanylate phosphodiesterase  32.11 
 
 
475 aa  120  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51660  EAL/GGDEF domain-containing protein  26.46 
 
 
592 aa  120  7.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2453  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.33 
 
 
633 aa  120  7.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4044  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.55 
 
 
702 aa  120  9e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246164  normal  0.385301 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1222  diguanylate phosphodiesterase  29.86 
 
 
346 aa  120  9e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000327641  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4702  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.13 
 
 
464 aa  120  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.781083  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3107  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.52 
 
 
610 aa  120  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0529  diguanylate phosphodiesterase  37.04 
 
 
378 aa  120  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.907499  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2206  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.57 
 
 
752 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0281501  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>