More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5253 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5253  diguanylate phosphodiesterase  100 
 
 
392 aa  764    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.550971 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1691  diguanylate phosphodiesterase  38.31 
 
 
366 aa  185  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000214274 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1097  diguanylate phosphodiesterase  42.28 
 
 
456 aa  168  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3633  diguanylate phosphodiesterase  35.98 
 
 
453 aa  167  4e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0300  diguanylate phosphodiesterase  37.71 
 
 
362 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.907769  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0529  diguanylate phosphodiesterase  37.25 
 
 
378 aa  162  7e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.907499  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1803  diguanylate phosphodiesterase  37.47 
 
 
382 aa  161  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.507868 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4614  diguanylate phosphodiesterase  35.58 
 
 
378 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2441  diguanylate phosphodiesterase  38.43 
 
 
443 aa  144  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2099  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  36.54 
 
 
402 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.316821 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1152  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  39.51 
 
 
710 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0872705  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3112  diguanylate phosphodiesterase  40.87 
 
 
244 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2139  diguanylate phosphodiesterase  36.56 
 
 
403 aa  127  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.067843  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1061  diguanylate phosphodiesterase  34.12 
 
 
454 aa  123  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.347929  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2421  diguanylate phosphodiesterase  33.6 
 
 
432 aa  123  7e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0356024  normal  0.0553373 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5174  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  34.83 
 
 
703 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.903635 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4505  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor(s)  34.13 
 
 
409 aa  119  9e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.660376  normal  0.902865 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1771  diguanylate phosphodiesterase  35.71 
 
 
475 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.142828  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1906  diguanylate phosphodiesterase  36.05 
 
 
410 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0735137  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4110  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor(s)  33.63 
 
 
411 aa  113  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0177  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor(s)  33.49 
 
 
419 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1985  diguanylate phosphodiesterase  30.95 
 
 
485 aa  111  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.299339  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0172  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor(s)  33.33 
 
 
419 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0212595  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4174  diguanylate phosphodiesterase  36.32 
 
 
425 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.886993  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0894  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.13 
 
 
605 aa  110  5e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.396651  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3854  diguanylate phosphodiesterase  30.29 
 
 
375 aa  107  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0179  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  35.94 
 
 
750 aa  106  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.102862  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2246  diguanylate phosphodiesterase  33.19 
 
 
413 aa  106  8e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.101865  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1402  diguanylate phosphodiesterase  36.97 
 
 
372 aa  106  8e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.281797  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0705  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.53 
 
 
590 aa  106  9e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1731  diguanylate phosphodiesterase  36.86 
 
 
378 aa  105  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0227  diguanylate phosphodiesterase  29.44 
 
 
429 aa  105  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3883  diguanylate phosphodiesterase  35.86 
 
 
442 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.385825  decreased coverage  0.00073239 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0350  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.87 
 
 
606 aa  103  7e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0495897  normal  0.0419453 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2526  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor(s)  34.25 
 
 
422 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1120  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.3 
 
 
637 aa  101  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2663  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.99 
 
 
753 aa  101  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0326  diguanylate phosphodiesterase  38.25 
 
 
385 aa  100  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.308148 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0232  diguanylate phosphodiesterase  30.48 
 
 
352 aa  98.6  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51660  EAL/GGDEF domain-containing protein  28.88 
 
 
592 aa  98.2  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3107  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.84 
 
 
610 aa  97.8  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21870  EAL domain/GGDEF domain-containing protein  27.82 
 
 
601 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.220571  hitchhiker  0.00056029 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1194  hypothetical protein  30.42 
 
 
284 aa  97.1  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.603137  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1867  hypothetical protein  28.4 
 
 
582 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145916  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0436  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.19 
 
 
590 aa  96.3  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2453  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.53 
 
 
633 aa  96.7  7e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3571  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.85 
 
 
611 aa  95.5  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2103  cyclic-di-GMP regulatory protein  26.01 
 
 
409 aa  94.4  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.444099  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4001  diguanylate phosphodiesterase  31.63 
 
 
357 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838727  normal  0.748991 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1718  diguanylate phosphodiesterase  31.16 
 
 
379 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0187822  normal  0.029577 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1678  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.07 
 
 
596 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.684126  normal  0.910388 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0228  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.33 
 
 
653 aa  93.2  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2030  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.17 
 
 
598 aa  92.8  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149487  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1320  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.49 
 
 
584 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00692574  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4571  diguanylate phosphodiesterase  30.95 
 
 
447 aa  92  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.300583 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3177  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.73 
 
 
523 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.178264  normal  0.217843 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3886  EAL domain/GGDEF domain protein  27.3 
 
 
590 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00288669  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3468  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.27 
 
 
523 aa  90.9  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1310  diguanylate phosphodiesterase  31.16 
 
 
306 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.016111  normal  0.292811 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1514  diguanylate phosphodiesterase  25.95 
 
 
437 aa  89  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000323461  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4968  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor(s)  30.84 
 
 
447 aa  89  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49831  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1210  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.48 
 
 
797 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.489928 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3739  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.79 
 
 
796 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84423  hitchhiker  0.00115944 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1598  GGDEF:CBS:EAL  30.49 
 
 
590 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.29213  normal  0.0431902 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2129  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.39 
 
 
627 aa  87.8  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.590205 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4726  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.93 
 
 
676 aa  87.8  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0452393  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3724  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.35 
 
 
580 aa  87.8  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0883602  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0914  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.91 
 
 
656 aa  87.4  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0360964 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3527  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.46 
 
 
581 aa  86.7  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0137  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor(s)  32.72 
 
 
407 aa  86.3  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.116698  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0005  diguanylate phosphodiesterase  30.18 
 
 
259 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162907  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3768  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.82 
 
 
765 aa  85.9  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0661883  normal  0.152244 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2763  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.93 
 
 
820 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3076  diguanylate phosphodiesterase  29.28 
 
 
285 aa  85.9  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1820  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.55 
 
 
599 aa  84.7  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.322861  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0256  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.72 
 
 
653 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3107  diguanylate phosphodiesterase  30.34 
 
 
259 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.757565  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3696  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.21 
 
 
747 aa  85.1  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.031791  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1571  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.2 
 
 
583 aa  84.3  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.260448  normal  0.637098 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6273  GGDEF family protein  27.75 
 
 
629 aa  84.7  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0447  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.11 
 
 
549 aa  84  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1612  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.09 
 
 
537 aa  84.3  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0369823  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4784  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.66 
 
 
785 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6320  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.97 
 
 
612 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0151  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.03 
 
 
613 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.435912 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3824  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.83 
 
 
877 aa  83.6  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.668765  normal  0.248455 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0430  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.18 
 
 
449 aa  83.2  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.97576 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4937  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.57 
 
 
980 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.157609 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1949  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.5 
 
 
773 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3045  sensory box/GGDEF family protein  29.28 
 
 
367 aa  82  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3242  EAL domain-containing protein  30.19 
 
 
283 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.0750539 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3861  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.57 
 
 
980 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.623044  normal  0.861278 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0388  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.96 
 
 
801 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2966  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.44 
 
 
613 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3153  putative diguanylate phosphodiesterase  25.96 
 
 
584 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.920716  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3003  diguanylate phosphodiesterase  31.39 
 
 
387 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000176635 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0764  GGDEF domain-containing protein  30.28 
 
 
905 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2810  diguanylate phosphodiesterase  30.23 
 
 
257 aa  82  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0057  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  31.28 
 
 
836 aa  81.6  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4612  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.65 
 
 
610 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>