More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_3076 on replicon NC_013207
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013207  Aaci_3076  diguanylate phosphodiesterase  100 
 
 
285 aa  580  1e-164  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2663  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.2 
 
 
753 aa  122  5e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.9 
 
 
766 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1949  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.6 
 
 
773 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0617  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.33 
 
 
883 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00427205 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2411  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.2 
 
 
632 aa  113  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893826 
 
 
-
 
NC_004310  BR0487  EAL domain-containing protein  29.72 
 
 
544 aa  112  7.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.606097  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2441  diguanylate phosphodiesterase  36.32 
 
 
443 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0699  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.48 
 
 
633 aa  110  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1210  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.6 
 
 
797 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.489928 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3777  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.62 
 
 
594 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4854  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.62 
 
 
594 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0706  diguanylate phosphodiesterase  33.19 
 
 
356 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.578959  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1598  GGDEF:CBS:EAL  33.33 
 
 
590 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.29213  normal  0.0431902 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3724  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.82 
 
 
580 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0883602  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1803  diguanylate phosphodiesterase  33.63 
 
 
382 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.507868 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3527  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.16 
 
 
581 aa  107  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1280  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.46 
 
 
818 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3319  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.59 
 
 
584 aa  106  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.777593  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0521  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  30.04 
 
 
685 aa  105  7e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.799608 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0397  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.92 
 
 
818 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0436  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.44 
 
 
590 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3886  EAL domain/GGDEF domain protein  32.89 
 
 
590 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00288669  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0192  diguanylate phosphodiesterase  30.97 
 
 
429 aa  105  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.11093  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0555  hypothetical protein  32.14 
 
 
584 aa  104  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0555  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.14 
 
 
583 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1867  hypothetical protein  31.56 
 
 
582 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145916  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1514  diguanylate phosphodiesterase  31.22 
 
 
437 aa  103  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000323461  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3475  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.14 
 
 
583 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0514  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.14 
 
 
585 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00136052  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3936  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.14 
 
 
585 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.573208  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0451  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.25 
 
 
844 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.323465 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3754  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.14 
 
 
585 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000868734  normal  0.0557959 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3153  putative diguanylate phosphodiesterase  31.76 
 
 
584 aa  103  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.920716  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0554  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.14 
 
 
584 aa  103  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0111263  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4345  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.59 
 
 
572 aa  103  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2129  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.97 
 
 
627 aa  102  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.590205 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4726  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.85 
 
 
676 aa  102  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0452393  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3536  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.17 
 
 
587 aa  102  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.220147  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1544  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.38 
 
 
762 aa  102  7e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1033  diguanylate phosphodiesterase  29.78 
 
 
413 aa  102  8e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4612  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.17 
 
 
610 aa  102  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1194  hypothetical protein  31.17 
 
 
284 aa  101  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.603137  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2881  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.35 
 
 
612 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.457989  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4051  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  29.05 
 
 
1497 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.996532 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0538  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.43 
 
 
684 aa  101  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.561154  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1503  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.56 
 
 
947 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1310  diguanylate phosphodiesterase  31.08 
 
 
306 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.016111  normal  0.292811 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0467  EAL domain protein  29.82 
 
 
351 aa  101  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0116221  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51660  EAL/GGDEF domain-containing protein  32.03 
 
 
592 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3810  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.7 
 
 
585 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000137032  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0350  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.52 
 
 
606 aa  101  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0495897  normal  0.0419453 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3853  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.05 
 
 
1490 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.982948  hitchhiker  0.0000000550616 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1754  diguanylate phosphodiesterase  33.18 
 
 
431 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1120  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.78 
 
 
637 aa  101  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3797  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.22 
 
 
540 aa  100  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1820  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.82 
 
 
599 aa  100  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.322861  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0800  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  30.17 
 
 
781 aa  100  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3018  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.35 
 
 
612 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140333  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1320  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.22 
 
 
584 aa  100  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00692574  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0429  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.77 
 
 
1487 aa  99.8  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.89086 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4001  diguanylate phosphodiesterase  30.3 
 
 
357 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838727  normal  0.748991 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3910  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  28.63 
 
 
1497 aa  99.8  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0233  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with extracellular sensor  30.61 
 
 
513 aa  99.8  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3428  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  27.9 
 
 
1484 aa  99.4  6e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.978359  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4283  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.22 
 
 
616 aa  99.4  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.188884 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1718  diguanylate phosphodiesterase  31.08 
 
 
379 aa  99  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0187822  normal  0.029577 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6350  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.04 
 
 
665 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2318  diguanylate phosphodiesterase  31.65 
 
 
371 aa  99.4  7e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.440144  normal  0.199138 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2156  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30 
 
 
904 aa  99  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.145891  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1073  diguanylate phosphodiesterase  31.33 
 
 
367 aa  99  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21870  EAL domain/GGDEF domain-containing protein  31.11 
 
 
601 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.220571  hitchhiker  0.00056029 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0427  sensory box protein  28.27 
 
 
1491 aa  98.6  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0426  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.89 
 
 
616 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.636145 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3843  GGDEF  30.58 
 
 
763 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0604  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.22 
 
 
700 aa  98.2  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1239  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.72 
 
 
810 aa  98.2  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0849983 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6320  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.48 
 
 
612 aa  98.6  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0177  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor(s)  30.58 
 
 
419 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2139  diguanylate phosphodiesterase  31.3 
 
 
403 aa  98.2  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.067843  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3194  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.18 
 
 
726 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.178802  normal  0.0329837 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2246  diguanylate phosphodiesterase  28.95 
 
 
413 aa  98.2  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.101865  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0635  diguanylate phosphodiesterase  32.62 
 
 
340 aa  98.2  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5176  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.49 
 
 
642 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.27918 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0627  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.82 
 
 
678 aa  98.2  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2641  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.6 
 
 
1118 aa  98.6  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.604832  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2966  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.77 
 
 
613 aa  98.6  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3930  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  28.22 
 
 
1497 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1027  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.39 
 
 
842 aa  97.4  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0664928  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0179  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  34.98 
 
 
750 aa  97.8  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.102862  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0122  EAL  28.7 
 
 
525 aa  97.4  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3724  EAL-containing signal transduction protein  27.62 
 
 
536 aa  97.8  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.549123  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2783  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  31.11 
 
 
1101 aa  97.8  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0431  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.43 
 
 
1494 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0710833  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3596  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.43 
 
 
1466 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.872186 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001526  sensory box/GGDEF family protein  26.97 
 
 
477 aa  97.1  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0501758  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0172  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor(s)  30.58 
 
 
419 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0212595  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00065  GGDEF/EAL domain protein  27.87 
 
 
814 aa  97.1  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2675  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  33.33 
 
 
1023 aa  97.1  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0543152  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2220  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  31.14 
 
 
971 aa  97.1  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00060546  normal  0.0976665 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>