146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0502 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  100 
 
 		 717 aa  1432    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  46.04 
 
 		 729 aa  531  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.86 
 
 		 2741 aa  172  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.36 
 
 		 2741 aa  167  9e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  37.69 
 
 		 916 aa  155  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1534  TPR repeat-containing protein  30.8 
 
 		 868 aa  150  6e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.8 
 
 		 991 aa  134  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  24.58 
 
 		 1060 aa  134  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  26.9 
 
 		 903 aa  126  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1214  TPR repeat-containing protein  27.86 
 
 		 1365 aa  125  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  29.78 
 
 		 893 aa  123  9e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  34.1 
 
 		 532 aa  121  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3648  TPR repeat-containing protein  30.24 
 
 		 905 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  32.63 
 
 		 1009 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  26.04 
 
 		 828 aa  116  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2461  TPR repeat-containing protein  30.24 
 
 		 905 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  27.91 
 
 		 1328 aa  115  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  29.38 
 
 		 919 aa  114  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  24.85 
 
 		 846 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1685  Tetratricopeptide domain protein  24.43 
 
 		 891 aa  111  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.131427 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.58 
 
 		 1162 aa  111  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  27.58 
 
 		 1162 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  28.43 
 
 		 809 aa  107  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  29.96 
 
 		 853 aa  106  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  23.62 
 
 		 854 aa  105  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 		 937 aa  104  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  26.3 
 
 		 1215 aa  104  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2808  TPR repeat-containing protein  27.82 
 
 		 883 aa  103  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0914392  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  26.14 
 
 		 1219 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  27.95 
 
 		 949 aa  103  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  28.01 
 
 		 1054 aa  103  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  32.07 
 
 		 1779 aa  101  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  23.65 
 
 		 994 aa  100  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  32.71 
 
 		 1409 aa  100  9e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  28.76 
 
 		 1025 aa  100  9e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.98 
 
 		 968 aa  100  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1412  tetratricopeptide TPR_4  33.01 
 
 		 874 aa  99.4  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  24.84 
 
 		 957 aa  98.6  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  39.26 
 
 		 1475 aa  98.2  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  30.07 
 
 		 1247 aa  97.1  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 854 aa  96.3  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  28.96 
 
 		 851 aa  95.5  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2373  tetratricopeptide TPR_3  23.37 
 
 		 918 aa  95.5  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1636  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  27.38 
 
 		 2637 aa  95.1  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1711 aa  94.4  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  33.91 
 
 		 827 aa  90.5  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  28.8 
 
 		 1051 aa  90.1  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 		 851 aa  89.7  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  26.57 
 
 		 3535 aa  89.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  26.57 
 
 		 3419 aa  89.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2706  TPR repeat-containing protein  26.45 
 
 		 928 aa  88.6  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1586  hypothetical protein  26.72 
 
 		 595 aa  88.6  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7301  WD-40 repeat-containing protein  27.54 
 
 		 1247 aa  88.6  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.408957  hitchhiker  0.00671221 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0573  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  26.57 
 
 		 3298 aa  87  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  25.47 
 
 		 3299 aa  87  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5411  Tetratricopeptide TPR_4  35.21 
 
 		 873 aa  87  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.710354  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3223  hypothetical protein  26.84 
 
 		 447 aa  86.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.758214  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  26.73 
 
 		 868 aa  85.9  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  27.3 
 
 		 1448 aa  86.3  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3057  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.14 
 
 		 904 aa  86.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.249484 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  26.6 
 
 		 3537 aa  85.9  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2670  tetratricopeptide TPR_4  31 
 
 		 905 aa  85.1  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3620  Tetratricopeptide domain protein  29.62 
 
 		 950 aa  85.1  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2488  Tetratricopeptide domain protein  29.62 
 
 		 950 aa  84.7  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1164  hypothetical protein  32.56 
 
 		 643 aa  83.6  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.145735  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 1276 aa  83.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  22.1 
 
 		 884 aa  82.4  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1987  hypothetical protein  27.8 
 
 		 1039 aa  81.6  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  22.51 
 
 		 923 aa  81.6  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1984  hypothetical protein  27.31 
 
 		 959 aa  82  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5804  TPR repeat-containing protein  24.43 
 
 		 796 aa  80.9  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0380  tetratricopeptide region  25.9 
 
 		 960 aa  80.1  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4189  hypothetical protein  37.1 
 
 		 1246 aa  79.7  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0054  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 885 aa  78.6  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.494605 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  24.74 
 
 		 1007 aa  79  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  24.38 
 
 		 1544 aa  79  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03421  hypothetical protein  29.2 
 
 		 418 aa  79  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.634587 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4247  TPR repeat-containing protein  21.43 
 
 		 1055 aa  78.2  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3307  Tetratricopeptide domain protein  21.77 
 
 		 909 aa  77.8  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.106188 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3267  tetratricopeptide TPR_4  30.09 
 
 		 890 aa  77.4  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.318718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3265  hypothetical protein  26.91 
 
 		 845 aa  77  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6030  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 		 880 aa  75.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  29.89 
 
 		 1266 aa  76.3  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5642  Tetratricopeptide TPR_4  21.75 
 
 		 725 aa  76.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00884597 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0354  hypothetical protein  33.89 
 
 		 1025 aa  75.9  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.219727  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1020  hypothetical protein  31.58 
 
 		 565 aa  75.1  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5349  hypothetical protein  29.73 
 
 		 1441 aa  75.1  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.598215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5301  Tetratricopeptide TPR_4  32.26 
 
 		 897 aa  74.7  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3141  hypothetical protein  32.69 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  26.98 
 
 		 1621 aa  74.3  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1301  hypothetical protein  27.62 
 
 		 989 aa  72.8  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4183  tetratricopeptide TPR_4  38.14 
 
 		 944 aa  72.4  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166941 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3041  tetratricopeptide TPR_4  30.23 
 
 		 890 aa  70.9  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3192  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 		 1036 aa  70.1  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  23.12 
 
 		 1650 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0007  TPR repeat-containing protein  26.78 
 
 		 822 aa  69.7  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.286469  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2387  hypothetical protein  35.94 
 
 		 1051 aa  69.7  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  34.38 
 
 		 1507 aa  69.7  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4669  TPR repeat-containing protein  31.62 
 
 		 811 aa  69.3  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1632  Tetratricopeptide TPR_4  31.25 
 
 		 848 aa  69.3  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521503  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>