More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1560 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1558  YD repeat-containing protein  96.63 
 
 		 3320 aa  1670    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1560  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 1126 aa  2330    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2020  YD repeat-containing protein  67.45 
 
 		 1140 aa  1276    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2022  YD repeat-containing protein  67.94 
 
 		 1488 aa  1139    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.904557  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2925  YD repeat protein  30.33 
 
 		 3456 aa  368  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1566  hypothetical protein  62.74 
 
 		 360 aa  251  6e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0920602  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1441  hypothetical protein  24.11 
 
 		 2138 aa  162  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  25.52 
 
 		 2096 aa  161  6e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  24.97 
 
 		 1834 aa  160  1e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4802  hypothetical protein  24.62 
 
 		 2017 aa  155  5.9999999999999996e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772458  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  23.95 
 
 		 927 aa  154  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1894  YD repeat protein  23.45 
 
 		 2443 aa  148  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.179364 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  25.81 
 
 		 2094 aa  147  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  24.02 
 
 		 690 aa  144  9e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2269  YD repeat protein  24.96 
 
 		 2479 aa  143  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1414  hypothetical protein  26.29 
 
 		 2534 aa  140  2e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.733329 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  25.06 
 
 		 1600 aa  134  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  23.94 
 
 		 1352 aa  122  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  28.11 
 
 		 2117 aa  122  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2155  Rhs family protein-like protein  24.53 
 
 		 2698 aa  122  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0998  YD repeat-containing protein  27.88 
 
 		 2558 aa  121  7e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1893  YD repeat protein  23.4 
 
 		 2510 aa  120  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111399 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0160  TccC4  24.14 
 
 		 952 aa  116  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.189077  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  26.34 
 
 		 1271 aa  115  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  24.02 
 
 		 903 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_003296  RS05537  putative RHS-related protein  22.41 
 
 		 764 aa  109  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.285743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  24.67 
 
 		 1576 aa  109  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  23.42 
 
 		 1467 aa  108  5e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32830  hypothetical protein  24.18 
 
 		 889 aa  107  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000050197  hitchhiker  0.0000345173 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  24.94 
 
 		 1976 aa  107  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  22.9 
 
 		 1560 aa  105  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5746  YD repeat protein  24.04 
 
 		 2652 aa  104  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0159  insecticidal toxin complex protein TcdB2  24.45 
 
 		 2417 aa  103  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.163635  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5751  YD repeat protein  25 
 
 		 2035 aa  103  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1512  YD repeat protein  25 
 
 		 2059 aa  102  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384432 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  21.96 
 
 		 1595 aa  102  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  21.96 
 
 		 1586 aa  101  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  22.83 
 
 		 1433 aa  99.8  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  22.43 
 
 		 741 aa  99.8  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  23.84 
 
 		 3027 aa  99  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0177  insecticidal toxin complex protein TcdB2  25.1 
 
 		 2458 aa  99  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  21.79 
 
 		 1614 aa  98.2  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2025  hypothetical protein  56.73 
 
 		 121 aa  97.8  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000128695  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  22.05 
 
 		 788 aa  97.8  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  22.05 
 
 		 788 aa  97.8  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0586  YD repeat-containing protein  22.87 
 
 		 956 aa  97.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2566  hypothetical protein  25.14 
 
 		 980 aa  97.1  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00381829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0610  YD repeat protein  28.89 
 
 		 954 aa  96.3  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0579  YD repeat-containing protein  28.89 
 
 		 954 aa  96.3  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0604  YD repeat-containing protein  28.89 
 
 		 954 aa  96.3  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.244718 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4037  YD repeat-containing protein  23.21 
 
 		 955 aa  95.5  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  22.66 
 
 		 1551 aa  95.5  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05526  putative RHS-related protein  22.31 
 
 		 705 aa  94.4  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1051  YD repeat-containing protein  23.09 
 
 		 927 aa  94.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1823  putative toxin protein  27.01 
 
 		 994 aa  94.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0293647  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  22.48 
 
 		 2149 aa  94.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  28.25 
 
 		 628 aa  94.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  23.3 
 
 		 1572 aa  93.6  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7436  Rhs family protein-like protein  23.57 
 
 		 2076 aa  92.4  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  22.15 
 
 		 1547 aa  91.7  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  22.6 
 
 		 1527 aa  90.9  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  21.53 
 
 		 1568 aa  90.9  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  21.13 
 
 		 1381 aa  90.1  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  23.03 
 
 		 1611 aa  90.1  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  21.01 
 
 		 1577 aa  90.5  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  25.71 
 
 		 2277 aa  89  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  20.27 
 
 		 1602 aa  89  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  22.43 
 
 		 867 aa  87.4  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  21.76 
 
 		 924 aa  87.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  26.74 
 
 		 3073 aa  86.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4340  insecticidal toxin protein, putative  23.43 
 
 		 940 aa  87  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4038  YD repeat-containing protein  23.35 
 
 		 881 aa  87  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.23853 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4032  YD repeat-containing protein  22.15 
 
 		 920 aa  85.9  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0529613 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  25.57 
 
 		 1517 aa  84.3  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4344  insecticidal toxin protein, putative  22.29 
 
 		 886 aa  83.2  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0609  YD repeat protein  25.09 
 
 		 958 aa  82.4  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0578  YD repeat-containing protein  25.09 
 
 		 962 aa  82.4  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0603  YD repeat-containing protein  25.09 
 
 		 962 aa  82.4  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0731118 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1189  RHS repeat family protein  24.41 
 
 		 952 aa  82  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.667138  hitchhiker  0.0000780044 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  22.77 
 
 		 1942 aa  82  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  22.21 
 
 		 1550 aa  82  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  28.25 
 
 		 1485 aa  81.6  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  21.62 
 
 		 1609 aa  81.3  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00940  rhs-related protein  24.65 
 
 		 468 aa  80.9  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.70443 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4033  YD repeat-containing protein  25.11 
 
 		 939 aa  80.9  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.195324 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  22.9 
 
 		 1840 aa  80.9  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  23.05 
 
 		 1409 aa  80.5  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04723  RhsD protein  23.37 
 
 		 920 aa  79.3  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.370413  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  21.49 
 
 		 1390 aa  79.3  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0197  Rhs family protein-like protein  22.96 
 
 		 2413 aa  79.3  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  26.23 
 
 		 678 aa  79  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29400  hypothetical protein  23.05 
 
 		 1317 aa  79  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  21.32 
 
 		 1418 aa  78.6  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0162  TccC3  21.67 
 
 		 989 aa  78.6  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0406  putative insecticidal toxin complex protein  23.93 
 
 		 929 aa  78.6  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0473  YD repeat-containing protein  24.05 
 
 		 952 aa  78.2  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0589964  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0407  putative insecticidal toxin complex protein  24.01 
 
 		 921 aa  78.2  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0409  putative insecticial toxin complex protein  23.98 
 
 		 958 aa  78.2  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04849  RhsD protein  23.15 
 
 		 917 aa  78.2  0.0000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0148662  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  21.39 
 
 		 1402 aa  77.8  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>