136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10642 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2747  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  43.8 
 
 
1151 aa  693    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0901  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  67 
 
 
1082 aa  1372    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3908  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  49.82 
 
 
1141 aa  909    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00208129  normal  0.199175 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0251  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  52.65 
 
 
1113 aa  987    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0918  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  67 
 
 
1082 aa  1372    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200509  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1210  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  65.97 
 
 
1084 aa  1345    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.809916  normal  0.696176 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3372  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  43.86 
 
 
1143 aa  707    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.369157  normal  0.661883 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2428  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  44.73 
 
 
1128 aa  702    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.550911  hitchhiker  0.0018506 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0907  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  67.55 
 
 
1080 aa  1379    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00623789 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2296  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  44.7 
 
 
1103 aa  744    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.566051  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5129  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  64.45 
 
 
1083 aa  1322    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0179444  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10642  exonuclease V gamma subunit recC  100 
 
 
1097 aa  2153    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.167031  normal  0.143221 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0992  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  41.08 
 
 
1158 aa  639    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.218847  normal  0.146183 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1434  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30.71 
 
 
1068 aa  424  1e-117  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.686584  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0582  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.82 
 
 
1091 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1360  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30.85 
 
 
1077 aa  403  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0996  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  31.55 
 
 
1075 aa  404  1e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.958514 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2148  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.27 
 
 
1061 aa  402  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0763  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  30.32 
 
 
1127 aa  390  1e-107  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1894  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  30.75 
 
 
1060 aa  385  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000000164621 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1402  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30 
 
 
1077 aa  385  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.937343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0325  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.21 
 
 
1071 aa  386  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00559956 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0345  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.66 
 
 
1074 aa  383  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1533  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  31.08 
 
 
1054 aa  363  7.0000000000000005e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3816  exonuclease V subunit gamma  28.55 
 
 
1123 aa  337  9e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.826552  normal  0.163807 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03302  exonuclease V subunit gamma  26.93 
 
 
1164 aa  335  2e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3233  exonuclease V subunit gamma  28.81 
 
 
1123 aa  335  2e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1041  exonuclease V subunit gamma  28.81 
 
 
1123 aa  335  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0989  exonuclease V subunit gamma  28.81 
 
 
1123 aa  333  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3222  exonuclease V subunit gamma  28.06 
 
 
1123 aa  332  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.790994  normal  0.118959 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3322  exonuclease V subunit gamma  28.26 
 
 
1123 aa  332  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.056399 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3142  exonuclease V subunit gamma  28.17 
 
 
1123 aa  330  7e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4087  exonuclease V subunit gamma  28.9 
 
 
1122 aa  330  9e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.459792  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3208  exonuclease V subunit gamma  29.27 
 
 
1123 aa  329  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.330224 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3391  exonuclease V subunit gamma  28.76 
 
 
1132 aa  330  1.0000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.884703  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02670  exonuclease V (RecBCD complex), gamma chain  28.8 
 
 
1122 aa  329  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0869  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.8 
 
 
1122 aa  329  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02631  hypothetical protein  28.8 
 
 
1122 aa  329  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2968  exonuclease V subunit gamma  28.8 
 
 
1122 aa  329  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3142  exonuclease V subunit gamma  28.8 
 
 
1122 aa  329  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0893  exonuclease V subunit gamma  28.8 
 
 
1122 aa  329  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3040  exonuclease V subunit gamma  28.7 
 
 
1122 aa  327  7e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3159  exonuclease V subunit gamma  28.17 
 
 
1123 aa  326  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2969  exonuclease V subunit gamma  28.8 
 
 
1122 aa  325  2e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.481674  normal  0.0228423 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002684  exodeoxyribonuclease V gamma chain  27.33 
 
 
1163 aa  322  1.9999999999999998e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3009  exonuclease V subunit gamma  29.72 
 
 
1128 aa  322  1.9999999999999998e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1054  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.79 
 
 
1085 aa  320  1e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3265  exonuclease V subunit gamma  28.06 
 
 
1124 aa  318  2e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.625608  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1905  exonuclease V subunit gamma  27.04 
 
 
1148 aa  318  5e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0912  exonuclease V subunit gamma  28.26 
 
 
1132 aa  317  9e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.986553  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3233  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.77 
 
 
1131 aa  313  1e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.911528 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0373  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.69 
 
 
1064 aa  312  2e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1458  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  24.32 
 
 
1149 aa  308  4.0000000000000004e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0545  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  24.81 
 
 
1098 aa  308  5.0000000000000004e-82  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.444064  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1900  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.17 
 
 
1163 aa  303  1e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0680  exonuclease V subunit gamma  25.38 
 
 
1127 aa  295  4e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257765  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0803  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.62 
 
 
1184 aa  291  5.0000000000000004e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.316931  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1756  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  24.45 
 
 
1166 aa  290  1e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0268  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.17 
 
 
1144 aa  290  1e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0760  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.95 
 
 
1158 aa  288  4e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0191191 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4674  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.84 
 
 
1160 aa  284  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0516374 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1271  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.52 
 
 
1164 aa  283  1e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2769  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.25 
 
 
1198 aa  282  2e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4538  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.43 
 
 
1160 aa  278  6e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.483988  normal  0.0568406 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4672  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28 
 
 
1159 aa  276  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155523 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2170  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.83 
 
 
1063 aa  274  7e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.411228  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1937  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  24.54 
 
 
1187 aa  272  2.9999999999999997e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2024  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.1 
 
 
1162 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.93867  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2641  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.13 
 
 
1190 aa  271  5.9999999999999995e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.144342 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4564  hypothetical protein  25.04 
 
 
1260 aa  270  1e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2278  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.04 
 
 
1260 aa  270  1e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0688  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.21 
 
 
1150 aa  269  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.131155  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2129  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  24.48 
 
 
1192 aa  269  2e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1985  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30.05 
 
 
1158 aa  270  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18739  normal  0.278857 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55690  exodeoxyribonuclease V gamma chain  27.93 
 
 
1171 aa  268  5e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1775  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.58 
 
 
1236 aa  267  1e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2419  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.6 
 
 
1269 aa  266  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2110  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  23.86 
 
 
1226 aa  266  2e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2290  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.02 
 
 
1274 aa  265  4e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01027  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.59 
 
 
1206 aa  265  4.999999999999999e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1625  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.98 
 
 
1173 aa  264  6e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.158099  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2351  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.75 
 
 
1375 aa  262  2e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1853  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.43 
 
 
1234 aa  263  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2245  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.45 
 
 
1234 aa  261  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.965648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2048  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  24.51 
 
 
1270 aa  261  7e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2149  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  25.68 
 
 
1270 aa  260  8e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2095  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  24.51 
 
 
1270 aa  260  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2533  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  24.06 
 
 
1270 aa  258  4e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.568964  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0776  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.06 
 
 
1158 aa  258  6e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0680  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  27.86 
 
 
1157 aa  257  7e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0012  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  26.33 
 
 
1197 aa  254  5.000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0520  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  27.51 
 
 
1174 aa  254  8.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.318804  normal  0.0360548 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0563  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.37 
 
 
1183 aa  248  4.9999999999999997e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.480964  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14751  exodeoxyribonuclease V subunit C 125 kD polypeptide  22.19 
 
 
1097 aa  248  6e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.683363 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4322  exodeoxyribonuclease V, RecC subunit  28.53 
 
 
1112 aa  247  8e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1849  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  30.76 
 
 
1218 aa  246  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.013439  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0643  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  21.93 
 
 
1097 aa  245  3e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4852  exodeoxyribonuclease V gamma chain  28.4 
 
 
1156 aa  244  5e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2852  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  28.32 
 
 
1149 aa  244  7e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.481141  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1389  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  29.27 
 
 
1197 aa  243  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.454262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>