189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_26640 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_26640  transcriptional regulator, tetR family  100 
 
 		 215 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.062936  normal  0.0737104 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19920  transcriptional regulator, tetR family  36.79 
 
 		 207 aa  97.4  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.314765  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  40.51 
 
 		 240 aa  94.7  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 234 aa  89.7  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17850  transcriptional regulator, tetR family  38.51 
 
 		 173 aa  88.2  9e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.760857 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  35.4 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 268 aa  75.1  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2879  regulatory protein TetR  34.12 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  35.97 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 253 aa  71.6  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  42.61 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  36.2 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  36.42 
 
 		 283 aa  65.1  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  37.72 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 272 aa  62  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  35.88 
 
 		 272 aa  62  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3462  regulatory protein TetR  32.52 
 
 		 221 aa  62  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249959  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0683  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0129651  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  38.05 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0744  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0222814 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0251  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3445  transcriptional regulator, TetR family  37.59 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  30.27 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  41.53 
 
 		 259 aa  57  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  29.88 
 
 		 248 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3817  transcriptional regulator, TetR family  36.15 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  31.71 
 
 		 311 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2560  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.283011  normal  0.208167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2727  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6384  putative transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.317451  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  32.87 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2060  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10310  transcriptional regulator, tetR family  33.59 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  40.37 
 
 		 342 aa  55.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3340  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3985  hypothetical protein  31.47 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5781  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 246 aa  54.7  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  38.05 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 343 aa  54.7  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  30 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  34.15 
 
 		 239 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  35.83 
 
 		 262 aa  53.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 265 aa  54.3  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6279  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 235 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8685  Tetracyclin repressor domain protein  33.33 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 235 aa  53.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4078  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 269 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 221 aa  52.8  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1952  regulatory protein TetR  47.46 
 
 		 241 aa  52.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  34.45 
 
 		 253 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 255 aa  52  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2840  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 238 aa  52  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23630  transcriptional regulator  28.24 
 
 		 210 aa  52.4  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 224 aa  52  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 246 aa  51.6  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 259 aa  51.6  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  32.64 
 
 		 343 aa  51.6  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 228 aa  51.6  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 234 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 229 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4181  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 240 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.367396  normal  0.615524 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1669  transcriptional regulator, TetR family  26.99 
 
 		 255 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 248 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3348  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 267 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3147  regulatory protein TetR  30.05 
 
 		 183 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0414  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>