126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1549 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1549  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  552  1e-156  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.837882 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1494  hypothetical protein  92.28 
 
 		 285 aa  518  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0134759  hitchhiker  0.000194556 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4617  hypothetical protein  60.9 
 
 		 287 aa  311  5.999999999999999e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0771  hypothetical protein  59.54 
 
 		 276 aa  276  3e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1704  spermidine synthase-like protein  54.93 
 
 		 287 aa  275  9e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406029  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3599  hypothetical protein  56.11 
 
 		 289 aa  263  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.155801  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2329  hypothetical protein  50.74 
 
 		 273 aa  245  6e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7684  hypothetical protein  50 
 
 		 273 aa  237  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1355  Spermidine synthase-like protein  49.06 
 
 		 332 aa  224  9e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2075  Spermidine synthase-like protein  47.18 
 
 		 287 aa  221  8e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000156685  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2683  Spermidine synthase-like protein  47.37 
 
 		 281 aa  219  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2425  hypothetical protein  45.9 
 
 		 307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503783  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1526  hypothetical protein  45.45 
 
 		 296 aa  207  1e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2514  putative spermidine synthase  46.43 
 
 		 262 aa  196  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.246608  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2968  Spermidine synthase-like protein  47.69 
 
 		 284 aa  195  9e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185015  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1429  Methyltransferase type 12  42.74 
 
 		 268 aa  192  6e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0362  putative spermidine synthase  42.96 
 
 		 310 aa  189  4e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0575  putative spermidine synthase  40.99 
 
 		 316 aa  187  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4192  hypothetical protein  42.75 
 
 		 516 aa  185  9e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216811  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4795  hypothetical protein  41.18 
 
 		 261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34113  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0442  hypothetical protein  43.56 
 
 		 517 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22930  spermidine synthase  42.03 
 
 		 304 aa  182  6e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0650317 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3103  Spermidine synthase-like protein  44.49 
 
 		 280 aa  181  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0371  hypothetical protein  44.15 
 
 		 517 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2245  hypothetical protein  40.66 
 
 		 262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000444033 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1268  Spermidine synthase-like protein  48.02 
 
 		 320 aa  170  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1581  Methyltransferase type 11  46.26 
 
 		 304 aa  170  3e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.564591 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1946  spermidine synthase-like protein  39.85 
 
 		 282 aa  170  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821047  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2508  hypothetical protein  40.34 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0190771  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5354  hypothetical protein  41.22 
 
 		 514 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5405  hypothetical protein  40.46 
 
 		 514 aa  162  7e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62211  normal  0.453689 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5605  hypothetical protein  40.46 
 
 		 514 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3722  hypothetical protein  39.69 
 
 		 514 aa  159  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2255  hypothetical protein  41.2 
 
 		 492 aa  158  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0695  Spermidine synthase-like protein  39.56 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06000  hypothetical protein  42.97 
 
 		 266 aa  151  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  41.82 
 
 		 514 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12080  spermidine synthase  41.13 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.712162  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10680  hypothetical protein  42.74 
 
 		 315 aa  146  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00411516  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3006  hypothetical protein  42.11 
 
 		 500 aa  143  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02530  hypothetical protein  40.67 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1061  hypothetical protein  33.96 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22530  hypothetical protein  42.72 
 
 		 286 aa  136  3.0000000000000003e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01820  hypothetical protein  36.96 
 
 		 309 aa  123  3e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  30.28 
 
 		 322 aa  76.3  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  23.79 
 
 		 558 aa  73.9  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3243  hypothetical protein  32 
 
 		 974 aa  67  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.870194  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  28.5 
 
 		 490 aa  67  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  24.75 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04160  spermidine synthase  27.73 
 
 		 339 aa  64.3  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0507  spermine synthase  30.22 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0453861  normal  0.458403 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  28.33 
 
 		 541 aa  63.5  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  27.4 
 
 		 533 aa  61.2  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  26.06 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  31.72 
 
 		 516 aa  60.8  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5272  spermidine synthase-like protein  30.48 
 
 		 281 aa  59.3  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1190  Spermidine synthase-like protein  31.45 
 
 		 276 aa  58.9  0.00000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0142358  normal  0.0659665 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  26.09 
 
 		 551 aa  58.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2313  hypothetical protein  34.81 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  27.36 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27350  hypothetical protein  31.65 
 
 		 249 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2030  Spermine synthase  30.32 
 
 		 510 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5699  putative spermidine synthase protein  28.38 
 
 		 278 aa  53.1  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14496  predicted protein  28 
 
 		 314 aa  53.1  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.161441  normal  0.197799 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2904  spermidine synthase-like protein  32.19 
 
 		 551 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0886  spermidine synthase  28.57 
 
 		 310 aa  50.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.176516 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  27.4 
 
 		 255 aa  50.4  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27620  spermidine synthase  28.67 
 
 		 257 aa  50.8  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.090706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44275  predicted protein  31.1 
 
 		 824 aa  50.1  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06540  spermidine synthase  26.88 
 
 		 248 aa  49.7  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3989  hypothetical protein  31.21 
 
 		 251 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0180  putative acyl transferase  27.56 
 
 		 275 aa  49.3  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2159  hypothetical protein  32.89 
 
 		 607 aa  49.3  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1442  hypothetical protein  29.94 
 
 		 251 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280635 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1773  hypothetical protein  29.94 
 
 		 253 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.738032  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6553  spermidine synthase-like protein  27 
 
 		 278 aa  48.9  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15340  hypothetical protein  29.94 
 
 		 249 aa  48.9  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6267  spermidine synthase-like protein  27 
 
 		 278 aa  48.9  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.526143 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3621  hypothetical protein  29.3 
 
 		 253 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1257  transferase  24.51 
 
 		 231 aa  48.9  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0803  spermine synthase  25.68 
 
 		 247 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.449448 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3220  spermine synthase  25.68 
 
 		 247 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3323  spermine synthase  25.68 
 
 		 247 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2906  putative spermidine synthase  28.03 
 
 		 253 aa  48.5  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2143  spermidine synthase-like protein  30.38 
 
 		 259 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.122833  normal  0.469239 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3177  spermidine synthase-like protein  30.82 
 
 		 548 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0169  spermidine synthase-like protein  27.96 
 
 		 284 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.387989  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1867  hypothetical protein  30.57 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4663  putative spermidine synthase  27.52 
 
 		 271 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.616274 
 
 
-
 
NC_003296  RS05370  hypothetical protein  24.67 
 
 		 306 aa  47.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3848  hypothetical protein  30.38 
 
 		 261 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0392798  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1235  spermidine synthase  28.47 
 
 		 267 aa  47  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.265162 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4588  spermidine synthase-like protein  28.85 
 
 		 283 aa  47  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.213578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1476  hypothetical protein  30.38 
 
 		 262 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1067  hypothetical protein  26.13 
 
 		 254 aa  46.6  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.153628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4021  hypothetical protein  28.06 
 
 		 255 aa  46.6  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.687307  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2836  spermidine synthase  24.09 
 
 		 287 aa  46.6  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0960  spermidine synthase  25 
 
 		 247 aa  45.8  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1034  hypothetical protein  31.51 
 
 		 268 aa  45.8  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0225297  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0336  putative spermidine synthase  28.29 
 
 		 274 aa  45.8  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>