More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7912 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  100 
 
 		 953 aa  1923    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  55.75 
 
 		 1505 aa  830    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  66.45 
 
 		 945 aa  1034    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  44.32 
 
 		 1200 aa  608  9.999999999999999e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  46.66 
 
 		 1444 aa  605  9.999999999999999e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  42.17 
 
 		 1143 aa  416  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1903  Carbohydrate binding family 6  40.09 
 
 		 918 aa  407  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.602156  normal  0.263579 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4672  PKD domain containing protein  41.17 
 
 		 941 aa  407  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  40.2 
 
 		 1135 aa  405  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  39.6 
 
 		 1142 aa  402  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  40.76 
 
 		 1151 aa  398  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  38.94 
 
 		 1138 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2208  PKD domain containing protein  39.36 
 
 		 908 aa  391  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0778173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  36.33 
 
 		 1182 aa  355  2.9999999999999997e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1484  PKD domain containing protein  38.49 
 
 		 918 aa  350  5e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.287223 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5332  PKD domain containing protein  37.23 
 
 		 909 aa  345  2e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0649636  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0335  PKD domain containing protein  37.17 
 
 		 984 aa  341  5e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 800 aa  267  8.999999999999999e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  36.5 
 
 		 1194 aa  247  6.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  95.24 
 
 		 392 aa  243  9e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  30.79 
 
 		 1029 aa  186  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  37.02 
 
 		 801 aa  155  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4878  PKD domain containing protein  28.82 
 
 		 1081 aa  148  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1249  PKD domain-containing protein  27 
 
 		 712 aa  148  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.8229  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  56.56 
 
 		 674 aa  146  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  59.52 
 
 		 588 aa  142  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  54.69 
 
 		 571 aa  142  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  47.55 
 
 		 1441 aa  140  8.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  56 
 
 		 433 aa  138  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  53.33 
 
 		 962 aa  137  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  52.42 
 
 		 1070 aa  137  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  55.2 
 
 		 987 aa  137  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  52.42 
 
 		 755 aa  134  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  55.8 
 
 		 999 aa  133  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3212  peptidase S45 penicillin amidase  51.61 
 
 		 1103 aa  132  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0203581  normal  0.139028 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  49.18 
 
 		 637 aa  132  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4887  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  52.71 
 
 		 581 aa  132  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.825597 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.76 
 
 		 756 aa  131  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  52.99 
 
 		 578 aa  130  9.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  50.79 
 
 		 1007 aa  130  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  55.65 
 
 		 815 aa  130  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  47.37 
 
 		 639 aa  129  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  49.28 
 
 		 850 aa  129  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  56.67 
 
 		 1158 aa  128  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3723  hypothetical protein  54.76 
 
 		 449 aa  126  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4824  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  54.03 
 
 		 1117 aa  126  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.90345 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6675  coagulation factor 5/8 type domain protein  52.42 
 
 		 929 aa  126  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2893  Alkaline phosphatase  52.76 
 
 		 452 aa  125  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21156  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  33.89 
 
 		 841 aa  125  4e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.16 
 
 		 819 aa  124  8e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1480  coagulation factor 5/8 type domain protein  50.39 
 
 		 722 aa  123  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6648  coagulation factor 5/8 type domain protein  52 
 
 		 940 aa  122  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314852  normal  0.100583 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  25.35 
 
 		 892 aa  121  7e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  42.69 
 
 		 1581 aa  120  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  47.2 
 
 		 752 aa  119  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.62 
 
 		 1321 aa  118  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  42.86 
 
 		 732 aa  117  8.999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  47.2 
 
 		 558 aa  117  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  46.94 
 
 		 729 aa  117  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.19 
 
 		 984 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  49.15 
 
 		 971 aa  115  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  34.97 
 
 		 1059 aa  115  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8724  Protein related to penicillin acylase-like protein  50.81 
 
 		 1059 aa  114  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4412  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  49.22 
 
 		 578 aa  114  8.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.35 
 
 		 915 aa  111  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  24.65 
 
 		 1657 aa  108  7e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1525  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  49.07 
 
 		 695 aa  107  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.299502  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0779  PKD domain-containing protein  26.85 
 
 		 999 aa  107  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0794  PKD domain-containing protein  26.85 
 
 		 999 aa  107  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135837  normal  0.0870072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  27.15 
 
 		 999 aa  105  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  28.35 
 
 		 377 aa  104  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  23.07 
 
 		 972 aa  104  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  35.08 
 
 		 1338 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0825  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.18 
 
 		 478 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.752393  normal  0.358271 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3544  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  41.48 
 
 		 471 aa  101  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1830  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.29 
 
 		 442 aa  100  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  45 
 
 		 4013 aa  99.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5195  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  43.61 
 
 		 480 aa  99.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3281  coagulation factor 5/8 type-like  44.36 
 
 		 487 aa  99.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5087  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  44.36 
 
 		 487 aa  99.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4788  coagulation factor 5/8 type domain protein  47.66 
 
 		 1564 aa  99  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  35.29 
 
 		 1332 aa  97.1  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  41.86 
 
 		 879 aa  96.3  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  25.55 
 
 		 366 aa  95.5  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03685  signal peptide protein  42.96 
 
 		 475 aa  95.1  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal  0.498425 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2315  glucose/sorbosone dehydrogenase  28.42 
 
 		 412 aa  94.7  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4855  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.04 
 
 		 472 aa  93.2  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3778  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.04 
 
 		 472 aa  93.2  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0933074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.07 
 
 		 1362 aa  91.7  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  29.31 
 
 		 394 aa  90.5  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  42.31 
 
 		 1028 aa  89.7  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  29 
 
 		 369 aa  90.1  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4499  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  42.96 
 
 		 470 aa  89.7  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0137  glucose sorbosone dehydrogenase  29.95 
 
 		 386 aa  90.1  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  41.04 
 
 		 604 aa  89.7  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0569  putative secreted protein  40 
 
 		 470 aa  89.4  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  40.74 
 
 		 951 aa  89.4  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  29.81 
 
 		 374 aa  89  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  29.81 
 
 		 374 aa  89  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  24.89 
 
 		 388 aa  89  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>