More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6108 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6108  preprotein translocase subunit SecF  100 
 
 		 347 aa  695    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359416  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2114  protein-export membrane protein SecF  66.46 
 
 		 390 aa  432  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205616  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2060  protein-export membrane protein SecF  68.39 
 
 		 326 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1340  preprotein translocase subunit SecF  48.7 
 
 		 414 aa  330  3e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.265736  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5141  preprotein translocase subunit SecF  46.22 
 
 		 417 aa  298  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358124  hitchhiker  0.00205157 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2357  protein-export membrane protein SecF  51.28 
 
 		 389 aa  296  4e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3050  protein-export membrane protein SecF  48.96 
 
 		 330 aa  286  2.9999999999999996e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1374  preprotein translocase subunit SecF  47.23 
 
 		 398 aa  285  5.999999999999999e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1803  protein-export membrane protein SecF  43.8 
 
 		 394 aa  282  6.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162985  decreased coverage  0.00000393416 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3823  protein-export membrane protein SecF  46.22 
 
 		 416 aa  278  9e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.344735  normal  0.619548 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1813  protein-export membrane protein SecF  43.86 
 
 		 394 aa  278  1e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.126223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2390  protein translocase subunit secF  42.3 
 
 		 412 aa  271  1e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1997  protein-export membrane protein SecF  42.12 
 
 		 358 aa  268  8e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.498449  normal  0.0822875 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1799  protein-export membrane protein SecF  47.77 
 
 		 360 aa  266  5e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.544061  normal  0.135983 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1365  protein-export membrane protein SecF  44.44 
 
 		 366 aa  261  2e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3815  preprotein translocase subunit SecF  41.79 
 
 		 422 aa  258  8e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130348  normal  0.401094 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17560  protein translocase subunit secF  43.96 
 
 		 371 aa  255  6e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.095972 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3173  protein-export membrane protein SecF  45.54 
 
 		 453 aa  252  8.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12818  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2028  preprotein translocase subunit SecF  43.26 
 
 		 338 aa  251  1e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000424362 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3390  protein-export membrane protein SecF  39.16 
 
 		 432 aa  246  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000120226  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2298  preprotein translocase subunit SecF  41.08 
 
 		 340 aa  246  4.9999999999999997e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15300  protein translocase subunit secF  47.25 
 
 		 406 aa  244  1.9999999999999999e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.54161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2584  preprotein translocase subunit SecF  38.29 
 
 		 423 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.173731  normal  0.904597 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13990  protein translocase subunit secF  40.63 
 
 		 364 aa  243  5e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.269244  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0946  protein-export membrane protein SecF  38.48 
 
 		 349 aa  243  5e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2316  preprotein translocase subunit SecF  37.43 
 
 		 417 aa  242  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.658853  normal  0.312291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2277  preprotein translocase subunit SecF  37.43 
 
 		 417 aa  242  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2324  preprotein translocase subunit SecF  37.43 
 
 		 417 aa  242  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223224  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15110  protein translocase subunit secF  42.15 
 
 		 414 aa  236  4e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.66233 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12606  preprotein translocase subunit SecF  37.9 
 
 		 442 aa  236  6e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1696  protein-export membrane protein SecF  39.28 
 
 		 396 aa  231  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467956  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1943  protein-export membrane protein SecF  38.23 
 
 		 374 aa  229  7e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00503357  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2305  protein-export membrane protein SecF  38.44 
 
 		 421 aa  226  4e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.879944  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1671  protein-export membrane protein SecF  42.86 
 
 		 363 aa  226  4e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12850  protein translocase subunit secF  40.47 
 
 		 346 aa  220  3e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0129827  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0984  protein-export membrane protein SecD  40.45 
 
 		 900 aa  213  2.9999999999999995e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.583326 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  35.08 
 
 		 977 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  34.42 
 
 		 989 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07200  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  40.14 
 
 		 855 aa  190  2.9999999999999997e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  33.79 
 
 		 286 aa  178  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  35.4 
 
 		 761 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1463  preprotein translocase subunit SecF  31.15 
 
 		 303 aa  166  5e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000137336  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  31.94 
 
 		 280 aa  165  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  30.32 
 
 		 759 aa  158  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  31.83 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0387  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.01 
 
 		 911 aa  152  7e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.807363  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1629  protein-export membrane protein SecD  33.44 
 
 		 748 aa  152  7e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.683752  normal  0.475056 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2885  preprotein translocase subunit SecF  31.61 
 
 		 310 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  31.9 
 
 		 316 aa  150  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1335  protein translocase subunit secF  33.54 
 
 		 292 aa  149  6e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  31.44 
 
 		 296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  28.85 
 
 		 307 aa  147  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.96 
 
 		 750 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  32.99 
 
 		 304 aa  145  8.000000000000001e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  31.46 
 
 		 305 aa  145  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  32.99 
 
 		 304 aa  145  1e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1489  preprotein translocase subunit SecF  32.48 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.921272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  29.35 
 
 		 307 aa  143  3e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  31.13 
 
 		 305 aa  143  4e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3211  preprotein translocase subunit SecF  35.68 
 
 		 310 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.828599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  32.67 
 
 		 310 aa  140  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30 
 
 		 762 aa  140  3e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0113  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.75 
 
 		 991 aa  140  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.758548 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  30.9 
 
 		 291 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1115  protein-export membrane protein SecF  31.07 
 
 		 302 aa  140  3.9999999999999997e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1797  preprotein translocase subunit SecF  30.23 
 
 		 307 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  32.3 
 
 		 740 aa  139  6e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.9 
 
 		 750 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1341  protein-export membrane protein SecF  29.84 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4310  protein-export membrane protein SecF  28.57 
 
 		 357 aa  138  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1330  SecF protein  29.45 
 
 		 338 aa  137  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0105179  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  31.03 
 
 		 313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1027  preprotein translocase subunit SecF  32.36 
 
 		 312 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0198826 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1355  preprotein translocase subunit SecF  32.53 
 
 		 293 aa  135  8e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2731  preprotein translocase subunit SecF  30.32 
 
 		 367 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.447806  normal  0.258523 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0123  protein-export membrane protein SecF  30.9 
 
 		 293 aa  135  9.999999999999999e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.504249  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  29.69 
 
 		 302 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0008  preprotein translocase subunit SecF  32.43 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.748405  normal  0.104556 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1219  preprotein translocase subunit SecF  31.97 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417925 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2737  protein-export membrane protein SecF  29.63 
 
 		 308 aa  134  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.468895  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1907  preprotein translocase subunit SecF  29.04 
 
 		 289 aa  134  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0418717  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4538  protein-export membrane protein SecF  29.81 
 
 		 320 aa  133  3.9999999999999996e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  29.39 
 
 		 302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2196  preprotein translocase subunit SecF  29 
 
 		 289 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.38 
 
 		 856 aa  133  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1904  protein-export membrane protein SecF  30.1 
 
 		 302 aa  133  5e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2836  protein translocase subunit secF  29.18 
 
 		 302 aa  133  6e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  29.35 
 
 		 302 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1727  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.85 
 
 		 759 aa  132  6.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.347489  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.85 
 
 		 759 aa  132  6.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0014  preprotein translocase subunit SecF  31.06 
 
 		 311 aa  132  7.999999999999999e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00246116  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2349  preprotein translocase subunit SecF  32.23 
 
 		 312 aa  132  9e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0511  preprotein translocase subunit SecF  29.29 
 
 		 311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.956081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1002  protein-export membrane protein SecF  25.44 
 
 		 319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5076  preprotein translocase subunit SecF  27.16 
 
 		 328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0626  protein-export membrane protein SecF  28.89 
 
 		 310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000549124  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0702  preprotein translocase subunit SecF  30.41 
 
 		 316 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.686375  normal  0.807805 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0013  preprotein translocase subunit SecF  32.24 
 
 		 309 aa  130  3e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245212 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.69 
 
 		 846 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0903  protein translocase subunit secF  28.66 
 
 		 318 aa  130  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000021842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>