More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3938 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3938  response regulator receiver protein  100 
 
 		 295 aa  594  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  0.0101023 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2488  LuxR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 359 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.008035 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2577  transcriptional regulator, LuxR family  38.65 
 
 		 372 aa  169  7e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0769027  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0922  transcriptional regulator, LuxR family  37.24 
 
 		 378 aa  150  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2913  transcriptional regulator, LuxR family  32.86 
 
 		 356 aa  140  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000129888  hitchhiker  0.0000689146 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1037  transcriptional regulator, LuxR family  38.55 
 
 		 363 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.760351 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1468  transcriptional regulator, LuxR family protein  28.87 
 
 		 356 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.468229  hitchhiker  0.0000161531 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2665  transcriptional regulator, LuxR family  31.54 
 
 		 359 aa  115  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.564836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3500  LuxR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 357 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3188  LuxR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 368 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0110301  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3565  regulatory protein LuxR  28.37 
 
 		 376 aa  108  8.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0956  transcriptional regulator, LuxR family  33.21 
 
 		 344 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.886587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2191  LuxR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 374 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.218442  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0440  LuxR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 323 aa  99  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1758  transcriptional regulator, LuxR family  32.42 
 
 		 374 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1687  transcriptional regulator, LuxR family  30.62 
 
 		 376 aa  92.8  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1438  LuxR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 367 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0017227  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1021  transcriptional regulator, LuxR family  29.67 
 
 		 347 aa  84.7  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3529  transcriptional regulator, LuxR family  29.37 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0854004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2318  LuxR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7170  LuxR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  normal  0.21358 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0591  hypothetical protein  42.11 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7171  LuxR family transcriptional regulator  58.7 
 
 		 76 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.710202  normal  0.194337 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2644  response regulator receiver domain-containing protein  49.09 
 
 		 235 aa  54.3  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4851  GAF modulated transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 237 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0743346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 454 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  43.4 
 
 		 471 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 216 aa  52.8  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2193  transcriptional regulator, LuxR family  40.3 
 
 		 258 aa  52  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5343  LuxR family transcriptional regulator  48 
 
 		 361 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0342945 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 224 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124896  normal  0.0124728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2357  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.61 
 
 		 234 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000650  transcriptional regulator LuxR family  44.26 
 
 		 292 aa  52.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1005  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.68 
 
 		 211 aa  52  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1772  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.51 
 
 		 262 aa  51.6  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2254  LuxR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 224 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000750634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1221  LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 910 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26510  transcriptional regulator, luxR family  44.44 
 
 		 903 aa  51.2  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.427696 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 213 aa  51.6  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3551  transcriptional regulator, LuxR family  45.28 
 
 		 893 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3161  two component response regulator transcription regulator protein  37.88 
 
 		 231 aa  50.4  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3680  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.06 
 
 		 223 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.233635 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0602  transcriptional regulator, LuxR family protein  39.22 
 
 		 210 aa  50.8  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.126322  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2523  regulatory protein, LuxR  35.37 
 
 		 879 aa  50.4  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1224  LuxR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 894 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4114  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.64 
 
 		 208 aa  50.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0576718  normal  0.109105 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2430  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.06 
 
 		 223 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1298  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.48 
 
 		 228 aa  50.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.70055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0068  regulatory protein LuxR  48.15 
 
 		 867 aa  50.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.289946  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0972  two component LuxR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 227 aa  50.4  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299836  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3380  two component LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 259 aa  50.4  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277634 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1851  two component LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 262 aa  50.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.467917  normal  0.53175 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_374  DNA-binding response regulator, LuxR family  40.32 
 
 		 232 aa  50.4  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000120759  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0409  two component LuxR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 232 aa  50.1  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135269  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2699  transmission activator LetA  39.44 
 
 		 219 aa  50.1  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2571  transmission activator LetA  46.15 
 
 		 219 aa  50.1  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3952  two component LuxR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 222 aa  50.1  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173353 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2842  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 492 aa  50.1  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2873  two component LuxR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 216 aa  50.1  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0432  LuxR family DNA-binding response regulator  40.32 
 
 		 232 aa  49.7  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00543066  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0647  two component LuxR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 225 aa  49.7  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0533  two component LuxR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 219 aa  49.7  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.405575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5165  two component LuxR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 231 aa  49.7  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.162111 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1903  transcriptional regulator, LuxR family  37.7 
 
 		 196 aa  49.7  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000231921 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  35.82 
 
 		 966 aa  49.3  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1148  regulatory protein LuxR  37.7 
 
 		 921 aa  49.7  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1936  ATP-dependent transcription regulator LuxR  31.45 
 
 		 880 aa  49.3  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.443116  hitchhiker  0.000000309593 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4109  LuxR family GAF modulated transcriptional regulator  41.82 
 
 		 256 aa  49.3  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.721487  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  36.92 
 
 		 1019 aa  49.3  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1290  two component LuxR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 209 aa  49.3  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.542915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3452  transcriptional regulator, LuxR family  48.08 
 
 		 227 aa  49.3  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  hitchhiker  0.00000787423 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 292 aa  49.3  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.350857 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1243  transcriptional regulator, LuxR family  36.84 
 
 		 550 aa  49.3  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  38.24 
 
 		 995 aa  48.9  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3200  LuxR family transcriptional regulator  29 
 
 		 205 aa  49.3  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.891545 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.89 
 
 		 213 aa  48.5  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  42.65 
 
 		 827 aa  48.9  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3391  transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 171 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0382463  normal  0.946449 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2938  two component transcriptional regulator, LuxR family  42 
 
 		 215 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0978  two component signal transduction response regulator  44 
 
 		 223 aa  48.9  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402933  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2846  two component transcriptional regulator, LuxR family  42 
 
 		 215 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.243379  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2754  two component LuxR family transcriptional regulator  42 
 
 		 215 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221671  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2409  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.08 
 
 		 221 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000055116  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0367  transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 556 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3030  two component LuxR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 218 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4471  transcriptional regulator, LuxR family  40.35 
 
 		 680 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 214 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05153  hypothetical protein  42.59 
 
 		 218 aa  48.5  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  38.46 
 
 		 536 aa  48.5  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 218 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.109155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  39.66 
 
 		 940 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0377  two component LuxR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 245 aa  48.5  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4084  two component LuxR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 246 aa  48.5  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3237  response regulator  45.1 
 
 		 219 aa  48.5  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001276  transcriptional regulator VpsT  42.59 
 
 		 210 aa  48.5  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3046  two component LuxR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 218 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.826568  normal  0.671191 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0094  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.1 
 
 		 220 aa  48.9  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0653  LuxR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 206 aa  48.5  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.203226 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 229 aa  48.5  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1292  transcriptional regulator, LuxR family  46.3 
 
 		 845 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000215082 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>