125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3035 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3035  outer membrane autotransporter  100 
 
 		 1008 aa  2003    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.935795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2034  Outer membrane autotransporter barrel  39.23 
 
 		 732 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.449525 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2225  autotransporter, putative  40.11 
 
 		 773 aa  398  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192143  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3827  outer membrane autotransporter  38.68 
 
 		 731 aa  386  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1489  outer membrane autotransporter  40.73 
 
 		 729 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1463  outer membrane autotransporter  34.41 
 
 		 733 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458818  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1880  outer membrane autotransporter  37.46 
 
 		 730 aa  376  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.396897 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3408  Outer membrane autotransporter barrel  37.37 
 
 		 709 aa  358  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.560212  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2011  autotransporter, putative  36.97 
 
 		 769 aa  352  2e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2897  Outer membrane autotransporter barrel  37.33 
 
 		 747 aa  330  9e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.112297  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0751  putative autotransporter, IS5K-containing  35.68 
 
 		 429 aa  246  1.9999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2329  putative autotransporter, IS5K-containing  35.44 
 
 		 863 aa  244  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1458  outer membrane autotransporter  35.44 
 
 		 863 aa  244  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.925993 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02119  predicted autotransporter outer membrane protein  35.44 
 
 		 836 aa  244  6e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463949  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1468  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.44 
 
 		 836 aa  244  6e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0686504  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02078  hypothetical protein  35.44 
 
 		 836 aa  244  6e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.513967  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3329  putative autotransporter, IS5K-containing  35.48 
 
 		 863 aa  242  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1396  outer membrane autotransporter  33.41 
 
 		 759 aa  242  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  27.47 
 
 		 1067 aa  239  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2781  putative autotransporter protein  33.18 
 
 		 759 aa  239  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607714  hitchhiker  0.00262672 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1288  putative autotransporter protein  32.73 
 
 		 759 aa  235  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0916938  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2985  putative autotransporter protein  35.05 
 
 		 638 aa  230  9e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3064  outer membrane autotransporter  35.05 
 
 		 638 aa  230  9e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1888  putative autotransporter protein  34.81 
 
 		 638 aa  228  6e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0815512  hitchhiker  0.00028295 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3895  hypothetical protein  31.04 
 
 		 1571 aa  224  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  26.8 
 
 		 1070 aa  223  9.999999999999999e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1052  outer membrane autotransporter  30.96 
 
 		 1526 aa  223  9.999999999999999e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  26.76 
 
 		 1070 aa  222  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2773  hypothetical protein  31.32 
 
 		 1565 aa  222  3e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.426931 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1028  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.73 
 
 		 1526 aa  218  5e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1179  putative autotransporter protein  29.76 
 
 		 1541 aa  176  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.599908  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  27.64 
 
 		 947 aa  175  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0425  pertactin family protein  29.27 
 
 		 1441 aa  173  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0113574 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0512  putative adhesin/invasin  29.2 
 
 		 815 aa  165  5.0000000000000005e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1286  outer membrane autotransporter  27.09 
 
 		 562 aa  165  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1177  putative autotransporter protein  27.59 
 
 		 1117 aa  159  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1658  hypothetical protein  34.6 
 
 		 236 aa  145  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000110069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  27.11 
 
 		 1748 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0402  outer membrane autotransporter  27.18 
 
 		 714 aa  135  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0427  putative autotransporter/pertactin  26.96 
 
 		 1003 aa  135  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.326572  normal  0.353879 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0407  outer membrane autotransporter  27.23 
 
 		 681 aa  134  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000021193 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0415  flagellar protein  27.23 
 
 		 470 aa  134  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0542626 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0409  putative autotransporter/pertactin  27.23 
 
 		 680 aa  134  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0333  outer membrane autotransporter  26.88 
 
 		 1602 aa  132  3e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0469  putative autotransporter/pertactin  27.23 
 
 		 868 aa  132  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.043223 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  26.02 
 
 		 1753 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  26.6 
 
 		 1770 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  26.49 
 
 		 1770 aa  129  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  26.46 
 
 		 1762 aa  124  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  26.46 
 
 		 1762 aa  124  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0513  putative adhesin/invasin  23.8 
 
 		 800 aa  124  9.999999999999999e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.333959  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  26.58 
 
 		 1763 aa  124  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0396  outer membrane autotransporter  26.6 
 
 		 922 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.381376  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00321  conserved hypothetical protein  26.6 
 
 		 968 aa  122  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00325  hypothetical protein  26.6 
 
 		 968 aa  122  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3258  outer membrane autotransporter  26.91 
 
 		 1000 aa  122  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0291  outer membrane autotransporter domain protein  26.85 
 
 		 398 aa  122  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0437  outer membrane autotransporter  26.91 
 
 		 465 aa  121  7.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01177  predicted adhesin  26.63 
 
 		 955 aa  120  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2446  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.63 
 
 		 955 aa  120  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.522244  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1306  putative outer membrane autotransporter  26.63 
 
 		 955 aa  120  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2424  outer membrane autotransporter  26.63 
 
 		 955 aa  120  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.33795 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1059  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.57 
 
 		 1023 aa  117  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0363  putative outer membrane autotransporter  24.79 
 
 		 765 aa  115  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.497355  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1348  putative outer membrane autotransporter  26.1 
 
 		 961 aa  114  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3036  outer membrane autotransporter  26.26 
 
 		 995 aa  110  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  24.84 
 
 		 1594 aa  102  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0734  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.34 
 
 		 1086 aa  100  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.837049 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  24.33 
 
 		 1040 aa  86.7  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  25.05 
 
 		 1099 aa  78.2  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1317  hypothetical protein  37.07 
 
 		 136 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000510687  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3095  outer membrane autotransporter  25.93 
 
 		 1028 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446562  normal  0.576928 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  22.19 
 
 		 773 aa  76.6  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  26.78 
 
 		 4391 aa  76.3  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  24.26 
 
 		 1234 aa  75.5  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  25.05 
 
 		 1115 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  26.78 
 
 		 4312 aa  73.6  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2929  hypothetical protein  37.38 
 
 		 108 aa  72.8  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.659634  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1976  hypothetical protein  40.86 
 
 		 108 aa  73.2  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0242164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  25.89 
 
 		 1093 aa  70.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  25.89 
 
 		 1093 aa  70.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  26.73 
 
 		 909 aa  67.4  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  24.77 
 
 		 1806 aa  66.6  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  25.74 
 
 		 1327 aa  65.1  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  21.55 
 
 		 1579 aa  61.6  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  24.93 
 
 		 955 aa  62  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  25.43 
 
 		 1571 aa  61.6  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  24.08 
 
 		 950 aa  61.6  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3962  outer membrane autotransporter barrel domain  24.46 
 
 		 955 aa  61.6  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.54 
 
 		 1357 aa  60.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  25.97 
 
 		 466 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  23.71 
 
 		 1165 aa  59.7  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  23.71 
 
 		 1165 aa  59.7  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.96 
 
 		 868 aa  58.5  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4252  outer membrane autotransporter  26.77 
 
 		 864 aa  57.8  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.94 
 
 		 1055 aa  57.4  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0104  immunoglobulin A1 protease domain protein  22.37 
 
 		 1300 aa  57.8  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.270044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0051  secreted serine peptidase EatA  23.62 
 
 		 1366 aa  57.4  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.611432  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1247  autotransporter protein YapE  24.84 
 
 		 820 aa  56.6  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  24.23 
 
 		 1108 aa  57.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>