More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1297 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1297  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 721 aa  1477    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2118  TonB-dependent siderophore receptor  34.46 
 
 		 704 aa  306  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0907  TonB-dependent siderophore receptor  33.43 
 
 		 712 aa  302  1e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2060  TonB-dependent siderophore receptor  32.49 
 
 		 708 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3275  TonB-dependent siderophore receptor  31.74 
 
 		 742 aa  293  9e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1407  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 705 aa  293  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2420  TonB-dependent siderophore receptor  31.84 
 
 		 728 aa  291  4e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2899  TonB-dependent siderophore receptor  31.81 
 
 		 689 aa  290  4e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.27988  normal  0.214281 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0109  TonB-dependent siderophore receptor  31.56 
 
 		 703 aa  289  1e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5560  TonB-dependent receptor  31.62 
 
 		 739 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3326  TonB-dependent receptor, plug  31.98 
 
 		 737 aa  288  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.686308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0594  TonB-dependent siderophore receptor  31.65 
 
 		 708 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1931  TonB-dependent siderophore receptor  32.08 
 
 		 723 aa  286  7e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4489  TonB-dependent siderophore receptor  32.08 
 
 		 696 aa  280  5e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0102  TonB-dependent siderophore receptor  31.65 
 
 		 755 aa  279  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.058066  normal  0.995779 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4827  TonB-dependent siderophore receptor  30.58 
 
 		 690 aa  278  4e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497518 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2754  TonB-dependent siderophore receptor  33.74 
 
 		 747 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4232  TonB-dependent siderophore receptor  33.59 
 
 		 747 aa  275  3e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0866  TonB-dependent siderophore receptor  31.59 
 
 		 696 aa  275  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.86038  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1347  TonB-dependent siderophore receptor  31.59 
 
 		 696 aa  275  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122487  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2047  TonB-dependent siderophore receptor  32.12 
 
 		 716 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977961 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2855  TonB-dependent siderophore receptor  33.59 
 
 		 747 aa  273  9e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3362  tonB-dependent receptor family protein  30.78 
 
 		 813 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0573796  normal  0.429192 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1329  TonB-dependent siderophore receptor  31.3 
 
 		 701 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.267924 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0411  TonB-dependent siderophore receptor  31.81 
 
 		 758 aa  270  7e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2631  TonB-dependent siderophore receptor  33.43 
 
 		 770 aa  269  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2705  TonB-dependent siderophore receptor  30.49 
 
 		 705 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3457  TonB-dependent siderophore receptor  31.21 
 
 		 707 aa  266  7e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4064  TonB-dependent siderophore receptor  31.07 
 
 		 707 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0831  TonB-dependent receptor plug  32.35 
 
 		 721 aa  263  6e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.519524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1526  TonB-dependent siderophore receptor  30.97 
 
 		 724 aa  261  3e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.970314  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0700  TonB-dependent siderophore receptor  30.76 
 
 		 776 aa  261  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0376627  normal  0.580851 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4567  TonB-dependent siderophore receptor  31.78 
 
 		 746 aa  260  7e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.436524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26420  putative TonB-dependent receptor  30.42 
 
 		 718 aa  259  9e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0316508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2243  putative TonB-dependent receptor  30.5 
 
 		 720 aa  259  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0859  TonB-dependent siderophore receptor  33.59 
 
 		 727 aa  258  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225734 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1412  TonB-dependent siderophore receptor family protein  31.11 
 
 		 822 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3462  hypothetical protein  30.11 
 
 		 797 aa  253  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.385249 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3657  TonB-dependent receptor  31.14 
 
 		 735 aa  252  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.558128  normal  0.251953 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0227  TonB-dependent siderophore receptor  30.66 
 
 		 738 aa  250  6e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3193  Outer membrane receptor protein, mostly Fe transport  31.63 
 
 		 756 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3209  TonB-dependent siderophore receptor family protein  31.63 
 
 		 820 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3793  TonB-dependent siderophore receptor  28.61 
 
 		 720 aa  244  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16695  normal  0.789951 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4740  TonB-dependent siderophore receptor  31.38 
 
 		 726 aa  244  3.9999999999999997e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.58513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2711  TonB-dependent siderophore receptor  31.63 
 
 		 756 aa  243  7e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.192964  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0537  TonB-dependent siderophore receptor  28.93 
 
 		 749 aa  243  7e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0190971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3002  TonB-dependent siderophore receptor  30.26 
 
 		 717 aa  243  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.527618 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3154  TonB-dependent siderophore receptor  31.63 
 
 		 756 aa  242  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2036  TonB-dependent siderophore receptor family protein  31.48 
 
 		 756 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1899  TonB-dependent siderophore receptor  31.48 
 
 		 756 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2054  TonB-dependent siderophore receptor  30.03 
 
 		 703 aa  241  2.9999999999999997e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.314681  normal  0.98162 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0877  TonB-dependent siderophore receptor  31.48 
 
 		 756 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0596191  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3318  TonB-dependent siderophore receptor  28.45 
 
 		 710 aa  241  4e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2853  TonB-dependent receptor, putative  29.53 
 
 		 784 aa  239  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0123555  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0535  hypothetical protein  30.47 
 
 		 730 aa  238  4e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2412  TonB-dependent siderophore receptor  29.76 
 
 		 717 aa  236  8e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05640  hypothetical protein  30.33 
 
 		 730 aa  234  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3330  TonB-dependent siderophore receptor  28.79 
 
 		 728 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.417694  normal  0.580446 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2318  TonB-dependent siderophore receptor  26.36 
 
 		 779 aa  201  6e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375964  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  23.47 
 
 		 719 aa  147  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  24.93 
 
 		 776 aa  144  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  22.95 
 
 		 706 aa  139  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  22.95 
 
 		 706 aa  139  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  24.04 
 
 		 795 aa  138  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1775  TonB-dependent siderophore receptor  28.07 
 
 		 721 aa  136  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  23.37 
 
 		 710 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  26.25 
 
 		 701 aa  130  9.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  22.42 
 
 		 707 aa  130  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  23.17 
 
 		 770 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  24.22 
 
 		 695 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  23.17 
 
 		 710 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2952  TonB-dependent receptor  32.38 
 
 		 399 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  25.42 
 
 		 806 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  23.96 
 
 		 755 aa  127  8.000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3716  TonB-dependent receptor, plug  25.46 
 
 		 527 aa  127  8.000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0878035  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  24.05 
 
 		 713 aa  124  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2391  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 762 aa  124  5e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3640  TonB-dependent siderophore receptor  24.92 
 
 		 708 aa  124  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168279  normal  0.0985281 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  24.89 
 
 		 710 aa  124  8e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  23.66 
 
 		 708 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4894  TonB-dependent siderophore receptor  23.78 
 
 		 714 aa  122  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142345  normal  0.811526 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00020  TonB-dependent outer membrane Receptor  27.58 
 
 		 601 aa  120  7e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000882452  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  24.86 
 
 		 729 aa  120  7e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  26.96 
 
 		 797 aa  120  9e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  25.57 
 
 		 747 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  25.43 
 
 		 745 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  25.57 
 
 		 747 aa  119  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4483  TonB-dependent siderophore receptor  24.02 
 
 		 712 aa  118  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000188322  hitchhiker  0.0000171512 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  23.63 
 
 		 792 aa  118  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  25.57 
 
 		 747 aa  119  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0110  TonB dependent receptor  24.29 
 
 		 693 aa  118  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  25.65 
 
 		 817 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4042  TonB-dependent siderophore receptor  23.84 
 
 		 697 aa  117  5e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.296308  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  26.28 
 
 		 791 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4504  TonB-dependent siderophore receptor  23.41 
 
 		 703 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000141313  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  24.17 
 
 		 711 aa  117  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  26.12 
 
 		 809 aa  117  8.999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3841  TonB-dependent siderophore receptor  23.1 
 
 		 712 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000249714  hitchhiker  0.000312087 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  24.61 
 
 		 710 aa  116  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4127  TonB-dependent siderophore receptor  23.64 
 
 		 702 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00050238  normal  0.542591 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>