More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2022 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2022  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 358 aa  698    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.105064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0188  RND family efflux transporter MFP subunit  31.21 
 
 		 369 aa  115  7.999999999999999e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3351  RND family efflux transporter MFP subunit  30.19 
 
 		 367 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2040  RND family mulitdrug efflux protein  30.72 
 
 		 358 aa  102  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.428821  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1943  secretion protein HlyD  30.4 
 
 		 523 aa  99  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.354822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  29.69 
 
 		 367 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  29.69 
 
 		 367 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1122  RND family efflux transporter MFP subunit  32.37 
 
 		 366 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4207  RND family efflux transporter MFP subunit  32.6 
 
 		 366 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1516  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.82 
 
 		 366 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3301  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.29 
 
 		 366 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1372  secretion protein HlyD  29.68 
 
 		 405 aa  92  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203736  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4102  RND family efflux transporter MFP subunit  32.6 
 
 		 366 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2234  RND family efflux transporter MFP subunit  33.01 
 
 		 407 aa  91.3  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.282252  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1715  acriflavin resistance periplasmic protein  28.01 
 
 		 357 aa  91.3  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000921401  normal  0.0591325 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0591  RND family efflux transporter MFP subunit  29.78 
 
 		 350 aa  89.4  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2000  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.27 
 
 		 360 aa  84.7  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.27 
 
 		 360 aa  84.7  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1100  RND family efflux transporter MFP subunit  32.51 
 
 		 361 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.204612 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46580  putative multidrug efflux gene product  31.12 
 
 		 371 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000561033  hitchhiker  0.00000166961 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2484  secretion protein HlyD  30.91 
 
 		 369 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00634188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1452  RND family efflux transporter MFP subunit  26.3 
 
 		 369 aa  82.4  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0187105  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0139  secretion protein HlyD  27.19 
 
 		 356 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0915  secretion protein, putative  28.03 
 
 		 368 aa  82  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44050  multidrug efflux pump membrane fusion protein  27.79 
 
 		 427 aa  80.9  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2381  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 357 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0671  secretion protein HlyD  24.02 
 
 		 432 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0505  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.22 
 
 		 349 aa  80.1  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1079  secretion protein HlyD  27.64 
 
 		 366 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1916  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.58 
 
 		 388 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.631291  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3131  secretion protein HlyD  25.86 
 
 		 363 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.735534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2214  putative component of multidrug efflux system  29.26 
 
 		 368 aa  78.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.082194  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.49 
 
 		 361 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.66 
 
 		 383 aa  78.6  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2532  secretion protein HlyD  29.56 
 
 		 359 aa  78.2  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19676  normal  0.860631 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3758  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.36 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4768  RND family efflux transporter MFP subunit  24.86 
 
 		 362 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000176985 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0821  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.17 
 
 		 371 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1148  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 373 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0703  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.01 
 
 		 355 aa  76.6  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3081  secretion protein HlyD  29.17 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000964041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3470  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.35 
 
 		 379 aa  76.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1555  secretion protein HlyD  30.39 
 
 		 394 aa  77  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1418  RND family efflux transporter MFP subunit  27.98 
 
 		 384 aa  77  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.267918  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4709  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.41 
 
 		 383 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1653  putative transport/efflux transmembrane protein  30.06 
 
 		 402 aa  76.3  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.493931 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2178  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.69 
 
 		 371 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700364  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1455  RND family efflux transporter MFP subunit  30.33 
 
 		 345 aa  76.3  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0288  RND family efflux transporter MFP subunit  26.71 
 
 		 355 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.527133 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6578  RND family efflux transporter MFP subunit  32.15 
 
 		 369 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.845685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2140  RND family efflux transporter MFP subunit  27.96 
 
 		 393 aa  75.5  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0793  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.53 
 
 		 390 aa  75.5  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1354  HlyD family secretion protein  23.87 
 
 		 364 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336467  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.22 
 
 		 377 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01960  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  26.22 
 
 		 356 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3206  transport lipoprotein  32.59 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443249  normal  0.0512525 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3760  secretion protein HlyD  26.69 
 
 		 362 aa  74.7  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.196565 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1309  efflux protein  27.94 
 
 		 364 aa  75.5  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2289  RND family efflux transporter MFP subunit  29.49 
 
 		 371 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.412391  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2678  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.46 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1356  secretion protein HlyD  29.48 
 
 		 365 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.925373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2192  secretion protein HlyD  27.01 
 
 		 352 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0015  secretion protein, HlyD family  25.47 
 
 		 372 aa  75.5  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1325  RND family efflux transporter MFP subunit  25.93 
 
 		 370 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.784041  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0235  RND efflux membrane fusion protein precursor  25.22 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5640  secretion protein HlyD  30.34 
 
 		 375 aa  73.6  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3002  membrane-fusion protein, component of multidrug efflux system  27.81 
 
 		 367 aa  73.6  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5087  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.8 
 
 		 357 aa  73.6  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156095  normal  0.0832308 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2202  RND family efflux transporter MFP subunit  26.2 
 
 		 407 aa  73.2  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6292  RND family efflux transporter MFP subunit  31.81 
 
 		 369 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.585328  hitchhiker  0.00894017 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3300  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.17 
 
 		 395 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  24.52 
 
 		 354 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3547  RND family efflux transporter MFP subunit  30.97 
 
 		 371 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6002  RND family efflux transporter MFP subunit  29.15 
 
 		 363 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249457  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3797  RND family efflux transporter MFP subunit  26.77 
 
 		 376 aa  72  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2103  RND family efflux transporter MFP subunit  29.17 
 
 		 403 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0796794  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5362  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.7 
 
 		 371 aa  71.6  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0864007  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2666  RND family efflux transporter MFP subunit  26.05 
 
 		 387 aa  71.2  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0045  RND family efflux transporter MFP subunit  23.87 
 
 		 356 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3214  putative efflux protein  25 
 
 		 367 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1081  secretion protein HlyD  27.91 
 
 		 374 aa  71.6  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.157732  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0940  component of multidrug efflux system  30.73 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0746  AcrA/E family efflux transporter MFP subunit  25.56 
 
 		 366 aa  70.9  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.339879  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1564  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.94 
 
 		 402 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal  0.253617 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3340  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.08 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2778  RND family efflux transporter MFP subunit  27.7 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.223876 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3411  secretion protein HlyD  29.84 
 
 		 363 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.591463  normal  0.695679 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5274  RND family efflux transporter MFP subunit  27.02 
 
 		 377 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0726879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  30.31 
 
 		 352 aa  71.2  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1510  secretion protein HlyD  23.9 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1830  RND family efflux transporter MFP subunit  25.41 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.495597  normal  0.102007 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4340  RND family efflux transporter MFP subunit  30.77 
 
 		 387 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.625227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2427  RND family efflux transporter MFP subunit  40.16 
 
 		 380 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.412114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1672  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.55 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  23.43 
 
 		 354 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2781  RND family efflux transporter MFP subunit  28.69 
 
 		 364 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2820  RND family efflux transporter MFP subunit  25.72 
 
 		 363 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0120499  normal  0.368522 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1893  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.96 
 
 		 402 aa  70.1  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.227434 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1296  RND family efflux transporter MFP subunit  27.09 
 
 		 373 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00794293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2361  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.76 
 
 		 372 aa  69.7  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.320362 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>