More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1166 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1166  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1084 aa  2167    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.689476  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  33.3 
 
 		 1025 aa  488  1e-136  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  33.27 
 
 		 1059 aa  472  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  33.75 
 
 		 1047 aa  463  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0458  TonB-dependent receptor plug  32.51 
 
 		 1071 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  30.94 
 
 		 1068 aa  435  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  32.57 
 
 		 1064 aa  418  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  30.94 
 
 		 1105 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  30.42 
 
 		 1059 aa  398  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  29.86 
 
 		 1051 aa  398  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1460  TonB-dependent receptor plug  31.53 
 
 		 1065 aa  392  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  30.82 
 
 		 1093 aa  385  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  29.4 
 
 		 1074 aa  371  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3993  TonB-dependent receptor plug  30.21 
 
 		 1081 aa  372  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356607  hitchhiker  0.00078443 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  29.69 
 
 		 1071 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  29.69 
 
 		 1101 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  29.79 
 
 		 1058 aa  367  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  30.17 
 
 		 1135 aa  368  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  28.79 
 
 		 1038 aa  369  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 1050 aa  360  6e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  29.63 
 
 		 1040 aa  359  9.999999999999999e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7043  TonB-dependent receptor plug  28.31 
 
 		 1189 aa  354  5.9999999999999994e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  30.78 
 
 		 1028 aa  353  7e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  29.43 
 
 		 1166 aa  346  1e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  29.77 
 
 		 1043 aa  340  8e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3959  TonB-dependent receptor plug  30.29 
 
 		 1044 aa  340  9.999999999999999e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  30.01 
 
 		 1063 aa  336  1e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  29.57 
 
 		 1081 aa  335  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  28.82 
 
 		 1057 aa  335  2e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  29.3 
 
 		 1038 aa  332  2e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  29.23 
 
 		 1153 aa  332  3e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  27.99 
 
 		 1011 aa  330  1.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  27.75 
 
 		 1065 aa  329  2.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 1078 aa  328  3e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  27.69 
 
 		 1072 aa  325  4e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0369  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 1234 aa  323  8e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3031  TonB-dependent receptor plug  29.16 
 
 		 1022 aa  323  9.999999999999999e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  28.51 
 
 		 1127 aa  323  9.999999999999999e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2719  TonB-dependent receptor plug  29.5 
 
 		 1073 aa  319  2e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0834373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  29.39 
 
 		 1115 aa  319  2e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  28.95 
 
 		 1142 aa  318  3e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6733  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 1098 aa  317  8e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00154569  normal  0.0819442 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  28.67 
 
 		 1031 aa  313  1e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 1039 aa  310  9e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  29.55 
 
 		 1138 aa  309  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6466  TonB-dependent receptor plug  29.23 
 
 		 1147 aa  308  4.0000000000000004e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000431216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  29.27 
 
 		 1059 aa  307  9.000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4131  TonB-dependent receptor plug  27.07 
 
 		 1027 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28448  normal  0.339257 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3367  TonB-dependent receptor plug  28.79 
 
 		 1033 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.994528 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  28.41 
 
 		 1169 aa  302  2e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04165  outer membrane protein  28.35 
 
 		 1071 aa  302  3e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  29.59 
 
 		 1027 aa  300  9e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3363  TonB-dependent receptor plug  27.43 
 
 		 1043 aa  299  2e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0179499  normal  0.688062 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  29.19 
 
 		 1023 aa  299  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  28.51 
 
 		 1129 aa  298  4e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  29.31 
 
 		 1137 aa  296  1e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0570  TonB-dependent receptor plug  27.16 
 
 		 1088 aa  294  5e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.7399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0403  TonB-dependent receptor, plug  28.04 
 
 		 1083 aa  293  1e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5278  TonB-dependent receptor plug  27.92 
 
 		 1163 aa  293  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.054683  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0339  TonB-dependent receptor plug  29.08 
 
 		 1087 aa  293  1e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.135408  decreased coverage  0.000558504 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  27.57 
 
 		 1073 aa  290  1e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 1033 aa  289  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6791  TonB-dependent receptor plug  26.86 
 
 		 1138 aa  287  9e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672159 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4175  TonB-dependent receptor plug  27.82 
 
 		 1099 aa  285  3.0000000000000004e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000931261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  27.31 
 
 		 1041 aa  283  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  25.95 
 
 		 1008 aa  281  4e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  28.04 
 
 		 1165 aa  280  8e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  27.07 
 
 		 1036 aa  277  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  27.09 
 
 		 1032 aa  272  2e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  27.69 
 
 		 1088 aa  271  5e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0665  TonB-dependent receptor, plug  25.84 
 
 		 1051 aa  266  1e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1886  TonB-dependent receptor plug  26.8 
 
 		 1063 aa  266  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  26.21 
 
 		 1010 aa  261  4e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 1144 aa  261  6e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1888  TonB-dependent receptor plug  26.8 
 
 		 1153 aa  258  3e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0801  TonB-dependent receptor plug  27.5 
 
 		 1116 aa  255  4.0000000000000004e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383306  normal  0.353517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2768  TonB-dependent receptor plug  28.21 
 
 		 1067 aa  254  5.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113347 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  26.78 
 
 		 1034 aa  244  5e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 1050 aa  242  2.9999999999999997e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  27.21 
 
 		 1161 aa  239  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  27.53 
 
 		 1013 aa  238  5.0000000000000005e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  27.5 
 
 		 1008 aa  237  9e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 994 aa  236  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 1037 aa  236  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  26.43 
 
 		 1028 aa  233  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  25.77 
 
 		 1155 aa  232  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5059  TonB-dependent receptor plug  26.88 
 
 		 1047 aa  232  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.25287 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  26.17 
 
 		 1079 aa  231  7e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  27.98 
 
 		 1010 aa  228  5.0000000000000005e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1573  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 1041 aa  227  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.885203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1769  TonB-dependent receptor plug  25.11 
 
 		 1085 aa  226  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  25.38 
 
 		 1070 aa  225  3e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  25.73 
 
 		 1103 aa  224  7e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  25.73 
 
 		 1040 aa  224  9e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  27.01 
 
 		 1137 aa  220  8.999999999999998e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  26.28 
 
 		 1082 aa  218  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 1029 aa  218  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 996 aa  217  8e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 1020 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  27.33 
 
 		 1164 aa  215  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>