More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3574 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3574  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 267 aa  542  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.845428  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2378  polysaccharide deacetylase  74.06 
 
 		 265 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal  0.428473 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3076  polysaccharide deacetylase  69.96 
 
 		 265 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112381  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3341  polysaccharide deacetylase  63.6 
 
 		 256 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2434  polysaccharide deacetylase  60.98 
 
 		 293 aa  317  1e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.591575  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4792  putative polysaccharide deacetylase  64.78 
 
 		 269 aa  301  5.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4083  polysaccharide deacetylase  57.45 
 
 		 270 aa  247  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.32938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0697  polysaccharide deacetylase  49.56 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1620  polysaccharide deacetylase  46.72 
 
 		 321 aa  196  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0105344  normal  0.102129 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1710  polysaccharide deacetylase  40.62 
 
 		 427 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190308  normal  0.343412 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3077  polysaccharide deacetylase  42.51 
 
 		 440 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00148769  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2377  polysaccharide deacetylase  42.61 
 
 		 439 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4793  putative polysaccharide deacetylase  42.61 
 
 		 393 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3575  polysaccharide deacetylase  42.06 
 
 		 439 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3342  polysaccharide deacetylase  41.81 
 
 		 430 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.313292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2943  polysaccharide deacetylase  41.07 
 
 		 313 aa  168  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.519142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3449  polysaccharide deacetylase  39.38 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282005  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2500  polysaccharide deacetylase  39.82 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2435  polysaccharide deacetylase  41.38 
 
 		 428 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.328944  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2107  polysaccharide deacetylase  41.26 
 
 		 310 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.471515  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3511  polysaccharide deacetylase  39.3 
 
 		 346 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.269417  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0282  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  40.62 
 
 		 350 aa  162  8.000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1585  polysaccharide deacetylase  39.91 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2067  polysaccharide deacetylase  37.72 
 
 		 356 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1948  polysaccharide deacetylase  37.99 
 
 		 348 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2343  polysaccharide deacetylase  38.39 
 
 		 322 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0425  polysaccharide deacetylase  40.43 
 
 		 345 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1255  polysaccharide deacetylase  39.04 
 
 		 356 aa  158  7e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3879  putative polysaccharide deacetylase  36.94 
 
 		 260 aa  142  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.827287  normal  0.456812 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1576  polysaccharide deacetylase  36.61 
 
 		 307 aa  135  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.197144 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1074  polysaccharide deacetylase  37.17 
 
 		 280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000250549 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1219  polysaccharide deacetylase  35.6 
 
 		 281 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000011337 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  38.33 
 
 		 352 aa  105  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  30.28 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0800  polysaccharide deacetylase  33.82 
 
 		 520 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1762  polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 		 243 aa  94.4  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1579  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 262 aa  92.8  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  32.32 
 
 		 247 aa  92  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 299 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  34.21 
 
 		 256 aa  91.3  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1829  polysaccharide deacetylase  26.14 
 
 		 300 aa  91.3  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000043926  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 		 413 aa  87.8  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  32.56 
 
 		 242 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  35.57 
 
 		 503 aa  87.4  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  28.88 
 
 		 221 aa  87  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 1101 aa  85.9  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  32.35 
 
 		 301 aa  85.5  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  33.95 
 
 		 413 aa  85.5  9e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  33.33 
 
 		 1099 aa  84.7  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0900  polysaccharide deacetylase  34.8 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.479614 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  31.22 
 
 		 321 aa  84  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  35.78 
 
 		 752 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10670  predicted xylanase/chitin deacetylase  30.37 
 
 		 440 aa  83.2  0.000000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  32.11 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  32.46 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  37.59 
 
 		 275 aa  82  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  37.59 
 
 		 275 aa  82  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  37.59 
 
 		 275 aa  82  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  37.59 
 
 		 275 aa  82  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1541  polysaccharide deacetylase  36 
 
 		 280 aa  82  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0577624  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3411  polysaccharide deacetylase  34.91 
 
 		 242 aa  81.6  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  32.27 
 
 		 287 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  28.43 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  35.42 
 
 		 276 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  31.96 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3879  polysaccharide deacetylase  36.25 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2789  xylanase/chitin deacetylase  32.8 
 
 		 244 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  29.76 
 
 		 1124 aa  80.9  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  32.54 
 
 		 537 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  31.02 
 
 		 542 aa  80.1  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  31.38 
 
 		 387 aa  80.1  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  34.72 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  34.72 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  34.72 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  30.93 
 
 		 372 aa  80.1  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1979  putative polysaccharide deacetylase  29.25 
 
 		 273 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00191884  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1565  polysaccharide deacetylase  32.11 
 
 		 345 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.869415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5072  polysaccharide deacetylase  28.95 
 
 		 355 aa  79.7  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  31.22 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  30.89 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  40.18 
 
 		 275 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3179  polysaccharide deacetylase  29.08 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  32.09 
 
 		 404 aa  79.3  0.00000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  29.02 
 
 		 522 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  36.88 
 
 		 275 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3350  putative polysaccharide deacetylase  29.72 
 
 		 273 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302749  hitchhiker  0.00000000000000655968 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  30.1 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0935  polysaccharide deacetylase  31.28 
 
 		 281 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0476216  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1840  polysaccharide deacetylase  29.47 
 
 		 273 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000153578  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2417  polysaccharide deacetylase  35 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2080  putative polysaccharide deacetylase  28.77 
 
 		 273 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000146273  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2008  polysaccharide deacetylase  28.02 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000244714  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1775  polysaccharide deacetylase  39.42 
 
 		 192 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  28.71 
 
 		 405 aa  77.4  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2012  putative polysaccharide deacetylase  28.77 
 
 		 273 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.46073e-43 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1808  polysaccharide deacetylase  28.77 
 
 		 273 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000183162  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  28.35 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1791  polysaccharide deacetylase  28.77 
 
 		 273 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000907429  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  29.91 
 
 		 324 aa  77.4  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2948  polysaccharide deacetylase  29.47 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000275955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>