262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1060 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1060  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 186 aa  376  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0913  transcriptional regulator, TetR family  86.56 
 
 		 186 aa  326  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.457382 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7842  TetR family transcriptional regulator  68.82 
 
 		 182 aa  242  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341573  normal  0.515425 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0676  TetR family transcriptional regulator  63.44 
 
 		 191 aa  231  5e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.49013  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2134  transcriptional regulator, TetR family  59.67 
 
 		 186 aa  216  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3422  transcriptional regulator, TetR family  61.11 
 
 		 187 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.296256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1146  TetR family transcriptional regulator  60.77 
 
 		 194 aa  204  6e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1297  transcriptional regulator, TetR family  57.06 
 
 		 182 aa  201  7e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4264  TetR family transcriptional regulator  56.5 
 
 		 181 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3102  regulatory protein TetR  60 
 
 		 187 aa  191  5e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44802  normal  0.6435 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3295  transcriptional regulator, TetR family  57.39 
 
 		 185 aa  190  8e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.457543 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0043  transcriptional regulator, TetR family  46.49 
 
 		 188 aa  142  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3948  transcriptional regulator, TetR family  39.43 
 
 		 180 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 183 aa  87  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2270  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1649  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.279043 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5683  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  27.51 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2924  regulatory protein TetR  28.4 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5860  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6178  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2114  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1963  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0206  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2559  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3185  transcriptional regulator, TetR family  26.23 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5306  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5395  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.488916  normal  0.171159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0275  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0122  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.288839  decreased coverage  0.00195597 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5685  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1740  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.976934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10198  transcriptional regulator  28.05 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3237  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0582489  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_003296  RS01911  putative transcription regulator protein  30.05 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0303213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7118  putative transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0105564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 286 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3287  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4071  putative transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 193 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294777  normal  0.94431 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48190  putative transcriptional regulator  25.9 
 
 		 186 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0114913  normal  0.0538885 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28390  transcriptional regulator  28.16 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 195 aa  51.6  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 210 aa  51.6  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0148  transcriptional regulator  27.03 
 
 		 179 aa  51.6  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 201 aa  51.2  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0798  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3212  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6284  regulatory protein, TetR  24.43 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4482  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 197 aa  49.7  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14402  normal  0.0182705 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3836  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 192 aa  49.3  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 212 aa  49.3  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 211 aa  48.9  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C37  transcriptional regulator  23.16 
 
 		 191 aa  48.5  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1392  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2958  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 		 186 aa  48.1  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0440878  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 202 aa  48.1  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2816  transcriptional regulator, TetR family protein  32.63 
 
 		 188 aa  47  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3993  transcriptional regulator, TetR family protein  26.98 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000102791  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06210  putative transcriptional regulator  27.32 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0238159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3009  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101347  normal  0.721246 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0581  putative transcriptional regulator  45.61 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 196 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  28.43 
 
 		 205 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  22.7 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1320  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2638  TetR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0259  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0361  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 212 aa  45.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.23201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7851  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 165 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  28.19 
 
 		 222 aa  46.2  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 212 aa  45.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0114  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 197 aa  45.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3361  TetR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 238 aa  45.8  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.752589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5020  putative transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294081  normal  0.0543061 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5671  transcriptional regulator, TetR family  25.91 
 
 		 190 aa  46.2  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3545  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 192 aa  45.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  26.59 
 
 		 193 aa  45.4  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 206 aa  45.4  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 200 aa  45.4  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4133  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 193 aa  45.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7134  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 204 aa  45.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0109323  normal  0.572193 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 208 aa  45.1  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3845  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4685  transcriptional regulator, TetR family  21.97 
 
 		 189 aa  45.4  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.26494  hitchhiker  0.000674431 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  37.14 
 
 		 214 aa  45.4  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  37.97 
 
 		 182 aa  45.4  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 211 aa  45.4  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 205 aa  45.1  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4331  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 220 aa  45.1  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4127  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 181 aa  45.1  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 198 aa  45.1  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>