120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3592 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3592  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 174 aa  352  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3873  putative transcriptional regulator  71.43 
 
 		 172 aa  210  7e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0174769  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  30.66 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  29.6 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1374  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0728  MarR/EmrR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 168 aa  67.8  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3740  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 154 aa  67  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3268  MarR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  29.86 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3813  MarR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.48019 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7681  CbaR  28.78 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0113297  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1794  MarR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5157  transcriptional regulator, MarR family  27.01 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14169  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3574  transcriptional regulator, MarR family  31.71 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.930143  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0902  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  29.86 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 171 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0294  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2337  MarR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.585939 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3866  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3190  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0978  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2508  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 158 aa  53.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132261  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 149 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  29.85 
 
 		 147 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 156 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 151 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 172 aa  51.6  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 149 aa  51.2  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 149 aa  51.2  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 149 aa  51.2  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1014  regulatory protein, MarR  27.56 
 
 		 170 aa  50.8  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.137304  normal  0.145225 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  27.94 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 149 aa  50.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1198  transcriptional regulator, MarR family  28.35 
 
 		 150 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 149 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3392  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 140 aa  48.9  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284351 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1301  MarR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 144 aa  49.3  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4032  transcriptional regulatory protein  23.91 
 
 		 162 aa  49.3  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0606552 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0634  MarR family transcriptional regulator  23.19 
 
 		 161 aa  49.3  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.353254 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 149 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 149 aa  48.9  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4476  MarR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 174 aa  48.9  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2455  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 148 aa  48.5  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0524  multidrug resistance operon repressor MexR  29.1 
 
 		 147 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.084309  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1847  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 178 aa  48.1  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603807  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1341  MarR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 156 aa  47.8  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1122  MarR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2739  MarR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 144 aa  47.4  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0259  MarR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 152 aa  46.6  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0832  MarR family transcriptional regulator  21.74 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431988  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  21.74 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1331  MarR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2740  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 169 aa  45.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  30.91 
 
 		 156 aa  45.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4459  transcriptional regulator, MarR family  32.94 
 
 		 167 aa  45.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777339 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4330  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 148 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28808  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4036  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 148 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0500935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3489  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 148 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483469 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  26.36 
 
 		 143 aa  45.1  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 170 aa  44.7  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1163  MarR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 163 aa  44.3  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5032  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  28.15 
 
 		 161 aa  43.9  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1067  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  30.68 
 
 		 157 aa  44.3  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.023606  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 155 aa  43.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  33.33 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0337  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.732334  normal  0.045327 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6318  transcriptional regulator, MarR family  26.8 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  34.26 
 
 		 154 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4553  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.561632 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 164 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3545  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 163 aa  42.4  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2487  normal  0.476183 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5307  transcriptional regulator, MarR family  25.66 
 
 		 178 aa  42.4  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1567  transcriptional regulator, MarR family  24.55 
 
 		 141 aa  42.4  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 176 aa  42.4  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  30.08 
 
 		 147 aa  42  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  29.2 
 
 		 167 aa  42  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2834  MarR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 152 aa  42  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.237719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4010  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 168 aa  42  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.898778  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5322  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 152 aa  41.6  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 163 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  25.71 
 
 		 142 aa  42  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>