More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1178 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1526  Na+/solute symporter  83.11 
 
 		 586 aa  986    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1120  Na+/solute symporter  73.42 
 
 		 587 aa  865    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.13754  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0961  Na+/solute symporter  78.53 
 
 		 587 aa  900    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1178  sodium:solute symporter family protein  100 
 
 		 585 aa  1164    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.107894 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1384  sodium:solute symporter family protein  82.31 
 
 		 588 aa  968    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1358  Na+/solute symporter  74.79 
 
 		 587 aa  864    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00027915  normal  0.0566975 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1083  Na+/solute symporter  76.36 
 
 		 588 aa  907    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0991073  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2245  Na+/solute symporter  51.68 
 
 		 609 aa  523  1e-147  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2672  Na+/solute symporter  45.75 
 
 		 599 aa  506  9.999999999999999e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13128  sodium/glucose cotransporter  44.09 
 
 		 575 aa  426  1e-118  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.194229  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1324  Na+/solute symporter  36.1 
 
 		 603 aa  347  5e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1755  hypothetical protein  37.7 
 
 		 577 aa  319  7.999999999999999e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2062  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  35.94 
 
 		 584 aa  273  6e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18811  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  32.19 
 
 		 583 aa  265  1e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0257597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1011  Na+/proline symporter  32.19 
 
 		 583 aa  263  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16021  Na+/proline symporter  32.53 
 
 		 587 aa  262  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04421  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  33.79 
 
 		 589 aa  249  8e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0610  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  35.6 
 
 		 587 aa  249  1e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.922091  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0638  Na+/solute symporter  29.24 
 
 		 538 aa  171  5e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0129  Na+/solute symporter  26.82 
 
 		 596 aa  160  5e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2033  Na+/solute symporter  26.68 
 
 		 625 aa  150  7e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2441  Na+/solute symporter  25.62 
 
 		 625 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231666  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0565  Na+/solute symporter  26.81 
 
 		 594 aa  140  6e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.426275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0303  Na+/solute symporter  25.88 
 
 		 596 aa  138  4e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2288  Na+/solute symporter  27.39 
 
 		 593 aa  135  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.175475 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2072  Na+/solute symporter  25.32 
 
 		 609 aa  130  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0164847 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3541  Na+/solute symporter  27.42 
 
 		 597 aa  128  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165749  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3587  Na+/solute symporter  25.29 
 
 		 556 aa  114  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.15 
 
 		 526 aa  110  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  25.04 
 
 		 523 aa  108  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2893  Na+/solute symporter  25.05 
 
 		 604 aa  107  8e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.81 
 
 		 522 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  27.66 
 
 		 461 aa  102  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  26.2 
 
 		 479 aa  101  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.24 
 
 		 520 aa  100  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  25.52 
 
 		 520 aa  99.8  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  24.42 
 
 		 520 aa  99  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.06 
 
 		 520 aa  98.2  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.96 
 
 		 519 aa  94.7  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.04 
 
 		 522 aa  94.4  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  24.85 
 
 		 520 aa  93.2  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  26.91 
 
 		 461 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.46 
 
 		 523 aa  90.9  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2608  SSS sodium solute transporter superfamily  25.84 
 
 		 570 aa  89.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  24.51 
 
 		 592 aa  89.4  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2416  Na+/solute symporter  26.03 
 
 		 575 aa  88.6  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.664159  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.37 
 
 		 533 aa  87.4  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  24.94 
 
 		 537 aa  86.7  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  26.87 
 
 		 460 aa  86.3  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  26.61 
 
 		 461 aa  85.9  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  26.8 
 
 		 463 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  26.8 
 
 		 463 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  25.54 
 
 		 483 aa  85.5  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.69 
 
 		 548 aa  85.1  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1152  SSS sodium solute transporter superfamily  24.73 
 
 		 562 aa  84.3  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0742973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3355  Na+/solute symporter  25.77 
 
 		 517 aa  83.6  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  25.5 
 
 		 459 aa  83.6  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5244  SSS sodium solute transporter superfamily  23.35 
 
 		 545 aa  83.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6588  SSS sodium solute transporter superfamily  25.06 
 
 		 529 aa  83.2  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.01 
 
 		 526 aa  82.4  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  27.41 
 
 		 459 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.13 
 
 		 542 aa  81.6  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0176  sodium:solute transporter  24.76 
 
 		 505 aa  81.6  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  25.91 
 
 		 551 aa  81.3  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.38 
 
 		 522 aa  81.3  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0179  sodium/solute symporter family protein  24.29 
 
 		 505 aa  80.9  0.00000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3085  sodium/proline symporter  25.91 
 
 		 484 aa  80.5  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.198592 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0289  Na+/solute symporter  26.49 
 
 		 590 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0322805  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  25.83 
 
 		 483 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  25.17 
 
 		 518 aa  79.7  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2466  SSS sodium solute transporter superfamily  24.38 
 
 		 509 aa  79  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4963400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  26.59 
 
 		 459 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  23.75 
 
 		 483 aa  78.2  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  27.47 
 
 		 462 aa  78.2  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0297  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.07 
 
 		 510 aa  78.2  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.977217  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0304  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.07 
 
 		 510 aa  78.2  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  26.63 
 
 		 476 aa  78.2  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6961  Na+/solute symporter  24.76 
 
 		 533 aa  77.4  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.931741  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  25.23 
 
 		 497 aa  77.4  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  26.21 
 
 		 459 aa  77  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.28 
 
 		 567 aa  76.6  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  24.24 
 
 		 482 aa  76.6  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  26.21 
 
 		 459 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0525  SSS sodium solute transporter superfamily  24.83 
 
 		 522 aa  75.1  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.692758  unclonable  0.0000000000137784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3072  SSS sodium solute transporter superfamily  22.42 
 
 		 539 aa  75.5  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00704051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0609  sodium/solute symporter  24.42 
 
 		 513 aa  74.7  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.952879  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  25.92 
 
 		 530 aa  74.7  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000913  sodium-solute symporter putative  25.58 
 
 		 590 aa  74.3  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  25.06 
 
 		 483 aa  73.9  0.000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04060  SSS sodium solute transporter  21.56 
 
 		 565 aa  73.9  0.000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03377  sodium:solute symporter family protein  26.3 
 
 		 523 aa  73.6  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  25.99 
 
 		 488 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0672  Na+/solute symporter  21.53 
 
 		 633 aa  73.2  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2732  SSS sodium solute transporter superfamily  24.45 
 
 		 561 aa  73.6  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4728  SSS sodium solute transporter superfamily  24.78 
 
 		 549 aa  72.8  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  hitchhiker  0.00040203 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1520  Sodium/proline symporter  25.17 
 
 		 483 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1463  sodium/proline symporter  23.72 
 
 		 483 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.169082  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  27.89 
 
 		 500 aa  72  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0350  Na+/solute symporter  24.34 
 
 		 489 aa  71.6  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3621  SSS sodium solute transporter superfamily  22.34 
 
 		 596 aa  71.6  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.434287  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>