155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4108 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 165 aa  333  5e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  44.59 
 
 		 190 aa  117  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.67 
 
 		 204 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.67 
 
 		 204 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4406  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.89 
 
 		 169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0295153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2964  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.04 
 
 		 160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 		 192 aa  101  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.86 
 
 		 166 aa  93.2  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  38.19 
 
 		 179 aa  86.3  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3556  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 		 169 aa  84  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  35.9 
 
 		 163 aa  83.6  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3647  cupin 2 domain-containing protein  38.89 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  33.99 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  36.64 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  33.57 
 
 		 163 aa  77  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2295  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.03 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  34.48 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.29 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302037  normal  0.0222415 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2609  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.49 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0604  cupin 2, barrel  38.78 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398371  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0617  cupin 2 domain-containing protein  38.78 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3706  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.31 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.95 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.399642  normal  0.0760956 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0595  cupin 2 domain-containing protein  37.76 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.28 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3620  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.68 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3197  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36 
 
 		 191 aa  67.4  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229687  normal  0.39078 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0760  cupin 2 domain-containing protein  37.76 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.519438 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0565  hypothetical protein  41.1 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.52627 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0144  cupin 2 domain-containing protein  35.71 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4525  cupin 2 domain-containing protein  34.78 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0204  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.37 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6348  cupin 2 domain-containing protein  32.82 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.14 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4239  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.17 
 
 		 163 aa  62  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.637233  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5299  hypothetical protein  34.69 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  32.43 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5545  cupin 2 domain-containing protein  39.18 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2141  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.92 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2309  hypothetical protein  37.39 
 
 		 139 aa  60.5  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.5332  hitchhiker  0.00622303 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.46 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6281  hypothetical protein  30.28 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  29.68 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4562  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.88 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3997  cupin 2 domain-containing protein  26.57 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439431  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3503  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.08 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1447  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.65 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.901222  normal  0.428247 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0884  cupin 2, barrel  33.98 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2213  cupin 2 domain-containing protein  33.02 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.971914  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.52 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0109  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.21 
 
 		 377 aa  54.7  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.146013 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.15 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0356258  normal  0.456316 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1714  cupin 2 domain-containing protein  31.96 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06772  conserved hypothetical protein  27.74 
 
 		 372 aa  53.1  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1864  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.81 
 
 		 144 aa  53.9  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0320  cupin 2 domain-containing protein  26.05 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.864661  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4882  hypothetical protein  27.94 
 
 		 145 aa  53.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3501  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.48 
 
 		 184 aa  52.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3153  cupin 2 domain-containing protein  34.78 
 
 		 135 aa  52.4  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6634  cupin 2 domain-containing protein  32.26 
 
 		 189 aa  52.4  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.718615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3405  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.78 
 
 		 156 aa  51.6  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5084  cupin superfamily protein  28.37 
 
 		 147 aa  50.8  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0259637  normal  0.536671 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6135  hypothetical protein  38 
 
 		 155 aa  51.2  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.715074  normal  0.381762 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0079  hypothetical protein  38.37 
 
 		 282 aa  50.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3067  cupin 2 domain-containing protein  30.3 
 
 		 145 aa  50.4  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3608  cupin 2 domain-containing protein  25.19 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0378  cupin region  27.97 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930622  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3113  cupin 2 domain-containing protein  27.36 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.487782  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  35.62 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1355  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 		 195 aa  49.7  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.646374  normal  0.0330672 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  31.03 
 
 		 123 aa  49.7  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2685  hypothetical protein  25.17 
 
 		 152 aa  48.9  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.273941  normal  0.254874 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3746  cupin 2 domain-containing protein  32.39 
 
 		 124 aa  49.3  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3707  cupin 2, barrel  33.02 
 
 		 138 aa  48.1  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.602346 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0535  cupin 2 domain-containing protein  29.6 
 
 		 147 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1675  cupin 2, barrel  29.6 
 
 		 147 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5649  cupin 2 domain-containing protein  29.6 
 
 		 147 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1700  cupin 2 domain-containing protein  29.6 
 
 		 147 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.792463 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1649  cupin 2 domain-containing protein  29.6 
 
 		 147 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.316822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0548  cupin 2 domain-containing protein  29.6 
 
 		 147 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.915131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0630  cupin 2 domain-containing protein  29.6 
 
 		 147 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00345  cupin domain protein  35.9 
 
 		 121 aa  47.8  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00219915  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  34.25 
 
 		 137 aa  47.8  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0262  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.23 
 
 		 121 aa  47.8  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.11735 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.64 
 
 		 332 aa  47.4  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1041  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 311 aa  47.4  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421449  normal  0.0580221 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1043  cupin 2 domain-containing protein  31.25 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5062  hypothetical protein  31.54 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2781  cupin 2, barrel  27.1 
 
 		 338 aa  46.6  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.402218  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0119  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.53 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.338448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2644  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  31.58 
 
 		 475 aa  46.2  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.789787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0950  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.89 
 
 		 389 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3773  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.84 
 
 		 421 aa  46.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.239832  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.74 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0829  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.87 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.55618  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0452  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.69 
 
 		 136 aa  46.6  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11002  dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07350)  28.57 
 
 		 355 aa  45.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.627949  normal  0.657367 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3858  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.85 
 
 		 133 aa  45.4  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1444  cupin 2 domain-containing protein  26.88 
 
 		 132 aa  45.1  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>