More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3587 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2416  Na+/solute symporter  65.1 
 
 		 575 aa  716    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.664159  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2608  SSS sodium solute transporter superfamily  67.75 
 
 		 570 aa  730    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3541  Na+/solute symporter  61.78 
 
 		 597 aa  667    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165749  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3587  Na+/solute symporter  100 
 
 		 556 aa  1106    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3355  Na+/solute symporter  29.37 
 
 		 517 aa  155  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0350  Na+/solute symporter  27.47 
 
 		 489 aa  145  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6961  Na+/solute symporter  30.81 
 
 		 533 aa  144  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.931741  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2893  Na+/solute symporter  25.63 
 
 		 604 aa  141  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6588  SSS sodium solute transporter superfamily  25.77 
 
 		 529 aa  124  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2815  SSS sodium solute transporter superfamily  27.07 
 
 		 527 aa  124  7e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3985  SSS sodium solute transporter superfamily  23.79 
 
 		 527 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000567258  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0289  Na+/solute symporter  24.88 
 
 		 590 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0322805  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2672  Na+/solute symporter  25.65 
 
 		 599 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1324  Na+/solute symporter  25.68 
 
 		 603 aa  116  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1178  sodium:solute symporter family protein  25.29 
 
 		 585 aa  114  5e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.107894 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2774  SSS sodium solute transporter superfamily  23.94 
 
 		 529 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00224729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0961  Na+/solute symporter  25.97 
 
 		 587 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.58 
 
 		 526 aa  111  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1083  Na+/solute symporter  24.64 
 
 		 588 aa  109  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0991073  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000913  sodium-solute symporter putative  24.69 
 
 		 590 aa  108  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  25.52 
 
 		 509 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.95 
 
 		 523 aa  105  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  26.51 
 
 		 520 aa  105  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  21.26 
 
 		 472 aa  105  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6118  SSS sodium solute transporter superfamily  24.94 
 
 		 562 aa  104  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1358  Na+/solute symporter  25.69 
 
 		 587 aa  104  5e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00027915  normal  0.0566975 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.37 
 
 		 548 aa  104  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1526  Na+/solute symporter  23.77 
 
 		 586 aa  104  5e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1384  sodium:solute symporter family protein  24.42 
 
 		 588 aa  103  7e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.4 
 
 		 542 aa  102  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13128  sodium/glucose cotransporter  24.04 
 
 		 575 aa  102  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.194229  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  26.7 
 
 		 523 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1518  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.35 
 
 		 892 aa  98.6  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  22.95 
 
 		 564 aa  98.2  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.77 
 
 		 533 aa  97.8  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  24.47 
 
 		 537 aa  95.9  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2466  SSS sodium solute transporter superfamily  24.1 
 
 		 509 aa  95.1  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4963400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04816  alkaline phosphatase synthesis sensor protein phoR  24.35 
 
 		 513 aa  94.7  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1755  hypothetical protein  24.24 
 
 		 577 aa  94.4  5e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  24.47 
 
 		 592 aa  93.2  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.34 
 
 		 522 aa  92  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4407  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.37 
 
 		 613 aa  92.4  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0343463  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  24.59 
 
 		 530 aa  91.7  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1120  Na+/solute symporter  24.94 
 
 		 587 aa  89.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.13754  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0525  SSS sodium solute transporter superfamily  25.26 
 
 		 522 aa  88.6  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.692758  unclonable  0.0000000000137784 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.5 
 
 		 520 aa  89.4  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2906  Na+/solute symporter  28.41 
 
 		 463 aa  89  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  26.5 
 
 		 520 aa  89.4  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.95 
 
 		 519 aa  89  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  23.56 
 
 		 483 aa  87.4  6e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  23.66 
 
 		 520 aa  87.4  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  25.06 
 
 		 520 aa  87.4  7e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  24.79 
 
 		 474 aa  87  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04060  SSS sodium solute transporter  23.27 
 
 		 565 aa  87  8e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0990  SSS sodium solute transporter superfamily  25.45 
 
 		 560 aa  87  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  25.42 
 
 		 483 aa  86.7  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18811  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  23.57 
 
 		 583 aa  86.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0257597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0609  sodium/solute symporter  23.13 
 
 		 513 aa  85.9  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.952879  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.92 
 
 		 567 aa  85.9  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  24.65 
 
 		 461 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2245  Na+/solute symporter  23.46 
 
 		 609 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2070  Na+/solute symporter  23.4 
 
 		 489 aa  85.1  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  24.37 
 
 		 462 aa  84.7  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1011  Na+/proline symporter  23.34 
 
 		 583 aa  84.3  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4843  SSS sodium solute transporter superfamily  23.92 
 
 		 544 aa  84  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.93 
 
 		 526 aa  84.3  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1283  putative symporter YidK  24.74 
 
 		 531 aa  83.2  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03377  sodium:solute symporter family protein  23.88 
 
 		 523 aa  83.6  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3022  SSS sodium solute transporter superfamily  24.49 
 
 		 883 aa  83.2  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.61129  normal  0.844759 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  24.93 
 
 		 598 aa  82  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14290  SSS sodium solute transporter  22.88 
 
 		 566 aa  81.6  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0273  sodium/proline symporter  23.94 
 
 		 504 aa  82  0.00000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0129  Na+/solute symporter  25.5 
 
 		 596 aa  81.3  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0993  SSS sodium solute transporter superfamily  20.54 
 
 		 569 aa  80.9  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0554078  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0176  sodium:solute transporter  24.16 
 
 		 505 aa  80.9  0.00000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  24.42 
 
 		 461 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02564  hypothetical protein  22.25 
 
 		 581 aa  80.9  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2062  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  22.93 
 
 		 584 aa  80.5  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039516  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  24.5 
 
 		 459 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  24.5 
 
 		 459 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0087  putative symporter YidK  25.52 
 
 		 529 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2358  Na+/solute symporter  23.76 
 
 		 472 aa  79.7  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.552943  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0610  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  22.37 
 
 		 587 aa  79  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.922091  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.72 
 
 		 522 aa  79  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.28 
 
 		 520 aa  79  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  24.75 
 
 		 463 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1152  SSS sodium solute transporter superfamily  25.28 
 
 		 562 aa  79  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0742973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.51 
 
 		 522 aa  79  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16021  Na+/proline symporter  22.65 
 
 		 587 aa  78.2  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  24.75 
 
 		 463 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0179  sodium/solute symporter family protein  23.65 
 
 		 505 aa  78.2  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  25.68 
 
 		 492 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  24.32 
 
 		 459 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  24.32 
 
 		 459 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.76 
 
 		 565 aa  77.4  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  28.32 
 
 		 476 aa  77  0.0000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  23.69 
 
 		 487 aa  76.3  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3463  proline/sodium symporter  24.55 
 
 		 495 aa  76.6  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  23.1 
 
 		 483 aa  76.3  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  25.68 
 
 		 493 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>