More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_05538 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_05538  RHS Repeat family  100 
 
 		 1579 aa  3232    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0425564  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  85.14 
 
 		 1428 aa  2435    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  51.94 
 
 		 1434 aa  1219    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2951  RhsD protein  37.84 
 
 		 1539 aa  650    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2104  rhsD protein  39.9 
 
 		 1593 aa  735    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0967057  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  41.41 
 
 		 1543 aa  759    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0267  rhsD protein  37.78 
 
 		 1539 aa  652    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00283  RhsD protein  99.09 
 
 		 613 aa  1094    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.333499  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  41.41 
 
 		 1552 aa  756    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  35.59 
 
 		 1492 aa  634  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  35.42 
 
 		 1466 aa  629  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00291  RHS Repeat family  95.75 
 
 		 412 aa  612  1e-173  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.132267  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4580  YD repeat protein  29.26 
 
 		 1401 aa  391  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6418  YD repeat-containing protein  29.17 
 
 		 1368 aa  366  1e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0100911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  31.81 
 
 		 1560 aa  363  1e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  30.65 
 
 		 1547 aa  353  1e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  30.78 
 
 		 1550 aa  347  1e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  30.47 
 
 		 1520 aa  347  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  30.77 
 
 		 1197 aa  340  9.999999999999999e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  29.53 
 
 		 1527 aa  338  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  29.53 
 
 		 1551 aa  336  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  31.45 
 
 		 1485 aa  330  1.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  30.82 
 
 		 1259 aa  327  1e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  29.35 
 
 		 1586 aa  324  8e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  29.66 
 
 		 1554 aa  318  6e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  28.39 
 
 		 1528 aa  315  3.9999999999999997e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  32.43 
 
 		 1488 aa  305  5.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  28.65 
 
 		 1609 aa  299  3e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  30.54 
 
 		 1508 aa  296  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  28.16 
 
 		 1573 aa  295  4e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0462  YD repeat-containing protein  47.13 
 
 		 352 aa  293  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.756225  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1609  YD repeat-containing protein  46.84 
 
 		 348 aa  292  3e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1792  YD repeat-containing protein  46.84 
 
 		 348 aa  292  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.227953  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  28.3 
 
 		 1362 aa  291  8e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0412  YD repeat-containing protein  46.78 
 
 		 342 aa  286  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0858889  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  28.77 
 
 		 1576 aa  285  7.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  27.07 
 
 		 2096 aa  281  7e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  28.86 
 
 		 1421 aa  277  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2870  YD repeat protein  29.03 
 
 		 2144 aa  276  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  28.71 
 
 		 1495 aa  274  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  29.68 
 
 		 1518 aa  272  4e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  27.55 
 
 		 1446 aa  270  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  28.04 
 
 		 1626 aa  265  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  27.25 
 
 		 1572 aa  263  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  27.9 
 
 		 1614 aa  262  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  29.23 
 
 		 1602 aa  259  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  26.92 
 
 		 1611 aa  256  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  27.48 
 
 		 1531 aa  253  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  27.73 
 
 		 1673 aa  253  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0770  YD repeat-containing protein  33.75 
 
 		 693 aa  250  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.163533  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  25.75 
 
 		 1352 aa  250  2e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2570  YD repeat-containing protein  27.33 
 
 		 1565 aa  249  3e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.332337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2577  YD repeat-containing protein  27.33 
 
 		 1565 aa  249  3e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.328115  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  31.1 
 
 		 1509 aa  249  4e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  26.35 
 
 		 1411 aa  243  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  27.51 
 
 		 1583 aa  243  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  27.74 
 
 		 1348 aa  243  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2508  YD repeat-containing protein  25.07 
 
 		 1699 aa  241  5.999999999999999e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0105853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  26.58 
 
 		 1489 aa  239  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  26.22 
 
 		 1229 aa  239  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  27.09 
 
 		 1620 aa  238  7e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  27.87 
 
 		 1604 aa  236  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  27.83 
 
 		 2149 aa  235  4.0000000000000004e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3233  YD repeat protein  27.33 
 
 		 1639 aa  234  8.000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.471244  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2647  YD repeat-containing protein  29.37 
 
 		 934 aa  233  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217872  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  27.03 
 
 		 1981 aa  233  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  28.72 
 
 		 1487 aa  233  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  28.52 
 
 		 1494 aa  232  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  28.52 
 
 		 1494 aa  232  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  26.07 
 
 		 1386 aa  231  8e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  27.41 
 
 		 1586 aa  230  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  26.9 
 
 		 1528 aa  230  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  27.31 
 
 		 1595 aa  228  6e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  25.37 
 
 		 1409 aa  228  9e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  25.87 
 
 		 1385 aa  226  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  26.63 
 
 		 1429 aa  226  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  25.25 
 
 		 3027 aa  225  6e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  25.27 
 
 		 2277 aa  224  8e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  27.4 
 
 		 1495 aa  224  8e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2818  YD repeat protein  26.4 
 
 		 1679 aa  224  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1609  YD repeat protein  26.86 
 
 		 1447 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  27.56 
 
 		 1517 aa  223  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  26.71 
 
 		 1568 aa  222  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  25.73 
 
 		 1400 aa  219  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  26.95 
 
 		 1553 aa  217  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  25.05 
 
 		 1600 aa  213  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0051  YD repeat protein  25.73 
 
 		 1437 aa  213  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  23.77 
 
 		 2035 aa  212  4e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  26.14 
 
 		 1541 aa  211  7e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  26.14 
 
 		 1381 aa  211  8e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  26.14 
 
 		 1541 aa  211  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  26.14 
 
 		 1541 aa  211  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  26.14 
 
 		 1541 aa  211  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  26.26 
 
 		 1422 aa  211  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  26.14 
 
 		 1541 aa  210  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  25.69 
 
 		 1271 aa  210  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1504  YD repeat protein  26.35 
 
 		 1457 aa  209  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4081  Rhs family protein  25.64 
 
 		 1140 aa  209  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451767  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0420  YD repeat protein  26.36 
 
 		 1475 aa  208  8e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1160  YD repeat protein  26.77 
 
 		 1423 aa  205  6e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00301652  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>