203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1101 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1101  sodium:solute symporter family protein  100 
 
 
486 aa  980    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.465096 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2903  Na+/solute symporter  50.21 
 
 
488 aa  489  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1598  Na+/solute symporter  48.56 
 
 
487 aa  470  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.414751 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07575  putative transmembrane sodium-solute transporter  46.36 
 
 
478 aa  431  1e-119  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3029  Na+/solute symporter  42.68 
 
 
492 aa  409  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00934608 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4818  Na+/solute symporter  43.69 
 
 
501 aa  399  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1047  sodium/solute symporter  43.92 
 
 
488 aa  394  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322443  normal  0.451489 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6812  Na+/solute symporter  45.13 
 
 
493 aa  390  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0641673  hitchhiker  0.00114247 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09590  Na+/proline symporter  32.31 
 
 
501 aa  201  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0974546  normal  0.236374 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1825  SSS sodium solute transporter superfamily  29.98 
 
 
533 aa  163  7e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.915648  normal  0.529366 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  25.97 
 
 
520 aa  159  1e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3352  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.4 
 
 
479 aa  153  8e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0232  Na+/solute symporter  28.37 
 
 
467 aa  148  2.0000000000000003e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2009  sodium:solute symporter family protein  26.89 
 
 
473 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2763  Na+/solute symporter  27.01 
 
 
472 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.83 
 
 
542 aa  145  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4170  Na+/solute symporter  24.9 
 
 
526 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0688566  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2070  Na+/solute symporter  25.64 
 
 
489 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0261  Na+/solute symporter  25.26 
 
 
468 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.728087  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0195  sodium:solute symporter family protein  26.51 
 
 
468 aa  133  7.999999999999999e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2358  Na+/solute symporter  26.21 
 
 
472 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.552943  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5947  Na+/solute symporter  28.48 
 
 
509 aa  127  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0206  Na+/solute symporter  24.81 
 
 
470 aa  124  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03377  sodium:solute symporter family protein  25.23 
 
 
523 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  24.48 
 
 
530 aa  120  7e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0609  sodium/solute symporter  26.42 
 
 
513 aa  120  7e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.952879  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1227  Na+/solute symporter  25.51 
 
 
517 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212817  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04816  alkaline phosphatase synthesis sensor protein phoR  26.86 
 
 
513 aa  116  8.999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.46 
 
 
526 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495731  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1869  Na+/solute symporter  25.48 
 
 
502 aa  110  4.0000000000000004e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.319535 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2962  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.84 
 
 
574 aa  108  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.324391  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5478  Na+/solute symporter  23.31 
 
 
568 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0650513 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12043  sodium iodide symporter  25.82 
 
 
547 aa  107  6e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1380  SSS sodium solute transporter superfamily  24.29 
 
 
562 aa  104  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.366294 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1518  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.9 
 
 
892 aa  102  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02564  hypothetical protein  24.7 
 
 
581 aa  102  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3022  SSS sodium solute transporter superfamily  21.53 
 
 
883 aa  99.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.61129  normal  0.844759 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0297  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.56 
 
 
510 aa  99.8  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.977217  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0304  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.56 
 
 
510 aa  99.8  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0525  SSS sodium solute transporter superfamily  22.81 
 
 
522 aa  97.8  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.692758  unclonable  0.0000000000137784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  24.36 
 
 
523 aa  95.9  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2466  SSS sodium solute transporter superfamily  24.59 
 
 
509 aa  92  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4963400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  23.54 
 
 
557 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2609  Na+/solute symporter  25.62 
 
 
566 aa  85.9  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  24.26 
 
 
598 aa  85.5  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.77 
 
 
526 aa  85.5  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1193  sodium-glucose/galactose cotransporter  23.61 
 
 
498 aa  84  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0641857  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1203  sodium-glucose/galactose cotransporter  23.61 
 
 
498 aa  84  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.410205 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1238  sodium-glucose/galactose cotransporter  23.61 
 
 
498 aa  84  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.425742 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1223  sodium-glucose/galactose cotransporter  23.61 
 
 
498 aa  84  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.532882 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0176  sodium:solute transporter  22.07 
 
 
505 aa  83.6  0.000000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  22.1 
 
 
557 aa  83.2  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2866  sodium-solute symporter  23.32 
 
 
581 aa  82  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00297174 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0179  sodium/solute symporter family protein  22.22 
 
 
505 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1640  SSS sodium solute transporter superfamily  22.6 
 
 
566 aa  81.6  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171262  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  24.6 
 
 
537 aa  79.3  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  23.57 
 
 
509 aa  79  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2774  SSS sodium solute transporter superfamily  23.41 
 
 
529 aa  77.8  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00224729  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2048  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.02 
 
 
550 aa  75.1  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.69 
 
 
548 aa  75.1  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.31 
 
 
523 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  21.35 
 
 
486 aa  73.2  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0416  sodium/solute symporter family protein  21.65 
 
 
570 aa  72  0.00000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.951118  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.01 
 
 
567 aa  72  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0043  Na+/solute symporter  20.82 
 
 
565 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3985  SSS sodium solute transporter superfamily  23.1 
 
 
527 aa  71.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000567258  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  22.35 
 
 
551 aa  70.9  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0990  SSS sodium solute transporter superfamily  21.91 
 
 
560 aa  70.1  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394544  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.65 
 
 
533 aa  69.7  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  23.38 
 
 
482 aa  69.3  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  24.02 
 
 
483 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  20.45 
 
 
522 aa  67.4  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4407  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  20.17 
 
 
613 aa  67  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0343463  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0993  SSS sodium solute transporter superfamily  19.1 
 
 
569 aa  66.6  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0554078  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2815  SSS sodium solute transporter superfamily  20.48 
 
 
527 aa  66.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.06 
 
 
526 aa  66.2  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.96 
 
 
522 aa  64.7  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3621  SSS sodium solute transporter superfamily  20.85 
 
 
596 aa  63.9  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.434287  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  22.3 
 
 
592 aa  63.9  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1671  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22 
 
 
593 aa  63.5  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0302135 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0375  Na+/solute symporter  24.43 
 
 
478 aa  62.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.197469 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3686  sodium/panthothenate symporter  22.19 
 
 
483 aa  62.8  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.925299  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  20.13 
 
 
565 aa  62.8  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  21.81 
 
 
564 aa  63.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.06 
 
 
522 aa  62  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6588  SSS sodium solute transporter superfamily  22.02 
 
 
529 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  22.51 
 
 
461 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  22.13 
 
 
479 aa  61.2  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0436  Na+/solute symporter  24.44 
 
 
478 aa  60.1  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5643  putative symporter YidK  20.09 
 
 
532 aa  60.1  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0528726  normal  0.86029 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04060  SSS sodium solute transporter  23.33 
 
 
565 aa  60.1  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0463  sodium/solute symporter transmembrane protein  22.97 
 
 
479 aa  59.3  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6118  SSS sodium solute transporter superfamily  20.05 
 
 
562 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  21.59 
 
 
482 aa  59.3  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  23.37 
 
 
520 aa  58.9  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  20.16 
 
 
520 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3541  Na+/solute symporter  22.3 
 
 
597 aa  58.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165749  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  20.16 
 
 
520 aa  57.8  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3355  Na+/solute symporter  21.76 
 
 
517 aa  57  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1951  solute:Na+ symporter permease transmembrane protein  22.75 
 
 
688 aa  56.6  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.788395  normal  0.806133 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>