211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_39990 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_39990  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  530  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3388  hypothetical protein  98.43 
 
 		 255 aa  524  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0628245  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2751  hypothetical protein  54.87 
 
 		 240 aa  282  3.0000000000000004e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1903  hypothetical protein  52.94 
 
 		 245 aa  265  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0951  hypothetical protein  43.28 
 
 		 244 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4807  fatty acid hydroxylase  39.21 
 
 		 249 aa  172  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1233  methyltransferase type 11  31.51 
 
 		 526 aa  144  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.153132  normal  0.111718 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  32.58 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  33.33 
 
 		 264 aa  80.5  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  33.12 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  36.02 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  30.63 
 
 		 380 aa  77.8  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  34.36 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  35.81 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  28.29 
 
 		 281 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  37.88 
 
 		 321 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  31.87 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  27.43 
 
 		 284 aa  74.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1362  fatty acid hydroxylase  32.7 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000314622  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  30.39 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  29.9 
 
 		 272 aa  72  0.000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  32.89 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  36.05 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  32.53 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1116  fatty acid hydroxylase  27.2 
 
 		 258 aa  68.9  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  32.88 
 
 		 278 aa  68.6  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0365  fatty acid hydroxylase  30.67 
 
 		 274 aa  68.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  31.67 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  28.7 
 
 		 268 aa  67.8  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0287  sterol desaturase-like protein  29.21 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897379 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0242  hypothetical protein  31.9 
 
 		 325 aa  67  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  34.85 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  28.77 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3261  hypothetical protein  29.85 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0633506  hitchhiker  0.0000000000915879 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2296  fatty acid hydroxylase  31.71 
 
 		 292 aa  65.9  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0175363 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  28.19 
 
 		 273 aa  65.5  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  33.08 
 
 		 259 aa  65.5  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  28.05 
 
 		 291 aa  65.5  0.0000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  27.75 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  31.79 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5462  sterol desaturase-like  29.7 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1517  hypothetical protein  26.58 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.012017  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1001  sterol desaturase-related protein  33.12 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  29.07 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  31.21 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3724  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  32.84 
 
 		 312 aa  62  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  28.48 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  31.67 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1804  hypothetical protein  30.86 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000255396 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2619  fatty acid hydroxylase  27.03 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.010312  normal  0.695137 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  32.05 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  28.26 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  34.35 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1485  fatty acid hydroxylase  26.67 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5924  sterol desaturase-like  25.19 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2171  fatty acid hydroxylase  25.4 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.689731 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2153  sterol desaturase-like protein  25.19 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135202  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2554  fatty acid hydroxylase  30.41 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0421703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  27.92 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  27.92 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03230  sphingosine hydroxylase, putative  29.87 
 
 		 346 aa  59.7  0.00000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1840  hypothetical protein  29.34 
 
 		 329 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194533  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1629  fatty acid hydroxylase  31.33 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0812703  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  33.08 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5005  fatty acid hydroxylase  30.26 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  30.07 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1118  fatty acid hydroxylase  29.19 
 
 		 325 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.325858  normal  0.912027 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0001  hypothetical protein  27.31 
 
 		 297 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.840453 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2362  sterol desaturase-like protein  30.53 
 
 		 278 aa  58.5  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266263  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3135  sterol desaturase-like  29.07 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2783  hypothetical protein  29.31 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292274 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2774  hypothetical protein  29.34 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0910  sterol desaturase-like  29.61 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2066  hypothetical protein  28.95 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  30.5 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2257  hypothetical protein  29.34 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.648004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3063  hypothetical protein  29.34 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00223094  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77904  Sphingolipid hydroxylase  29.63 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.726842  normal  0.428926 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2639  hypothetical protein  29.34 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2695  hypothetical protein  29.34 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231759  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1528  hypothetical protein  29.34 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0526335  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2063  fatty acid hydroxylase  29.45 
 
 		 324 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  31.54 
 
 		 376 aa  57  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0212  hypothetical protein  29.11 
 
 		 269 aa  57  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2190  sterol desaturase-like protein  29.45 
 
 		 324 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0540  fatty acid hydroxylase  28.64 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2296  fatty acid hydroxylase  30.25 
 
 		 374 aa  56.2  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152596 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  27.78 
 
 		 376 aa  56.2  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  28.24 
 
 		 386 aa  55.8  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000349  sterol desaturase family protein  28.68 
 
 		 285 aa  55.5  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0045  hypothetical protein  25.94 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6645  fatty acid hydroxylase  30.61 
 
 		 305 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00730628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2887  sterol desaturase family protein  28.19 
 
 		 304 aa  55.5  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  26.44 
 
 		 374 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4495  fatty acid hydroxylase  31.41 
 
 		 402 aa  55.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1174  fatty acid hydroxylase  30.81 
 
 		 324 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2864  fatty acid hydroxylase  27.88 
 
 		 377 aa  55.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  26.44 
 
 		 373 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0717  sterol desaturase family protein  26.95 
 
 		 288 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390125  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  29.33 
 
 		 385 aa  53.9  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>