27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB03230 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006684  CNB03230  sphingosine hydroxylase, putative  100 
 
 
346 aa  722    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00640  sphinganine hydroxylase BasA (Eurofung)  41.64 
 
 
430 aa  266  5e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0535507  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77904  Sphingolipid hydroxylase  44.22 
 
 
345 aa  249  6e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.726842  normal  0.428926 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06973  C-4 methyl sterol oxidase Erg25, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04820)  30.95 
 
 
302 aa  69.7  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.244737  hitchhiker  0.0000000000000142581 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08907  C-4 methyl sterol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02440)  35.37 
 
 
291 aa  68.9  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.225916  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78360  predicted protein  32.35 
 
 
305 aa  65.1  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02573  conserved hypothetical protein  30.52 
 
 
313 aa  64.3  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000109595  normal  0.411684 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02410  C-4 methyl sterol oxidase, putative  29.67 
 
 
343 aa  63.5  0.000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74706  membrane-bound non-heme di-iron oxygenase involved in lipid metabolism  33.83 
 
 
294 aa  63.5  0.000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38826  predicted protein  30.05 
 
 
282 aa  59.7  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.914013  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3388  hypothetical protein  29.87 
 
 
255 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0628245  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39990  hypothetical protein  29.87 
 
 
255 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0236  C-5 sterol desaturase  29.33 
 
 
236 aa  53.1  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.652571  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14208  predicted protein  27.95 
 
 
249 aa  49.7  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3136  sterol desaturase  28 
 
 
253 aa  48.1  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  30.56 
 
 
284 aa  47.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1233  methyltransferase type 11  30.61 
 
 
526 aa  47.4  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.153132  normal  0.111718 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0212  hypothetical protein  29.5 
 
 
269 aa  47  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0680  C-5 sterol desaturase  28.03 
 
 
271 aa  47  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2318  hypothetical protein  28.37 
 
 
284 aa  43.9  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4807  fatty acid hydroxylase  28.67 
 
 
249 aa  43.9  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2751  hypothetical protein  24.32 
 
 
240 aa  43.9  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09275  C-4 methylsterol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01160)  24.79 
 
 
259 aa  43.5  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000567385  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2514  fatty acid hydroxylase  28.15 
 
 
267 aa  43.5  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.842442  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2984  C-5 sterol desaturase  26.92 
 
 
239 aa  43.1  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0218495  normal  0.0192453 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55230  hypothetical protein  29.25 
 
 
301 aa  42.7  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.226286  hitchhiker  0.000000221588 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3352  fatty acid hydroxylase  27.86 
 
 
305 aa  42.7  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.211672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>