27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_78360 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009045  PICST_78360  predicted protein  100 
 
 
305 aa  634    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74706  membrane-bound non-heme di-iron oxygenase involved in lipid metabolism  62.59 
 
 
294 aa  391  1e-107  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06973  C-4 methyl sterol oxidase Erg25, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04820)  61.54 
 
 
302 aa  370  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.244737  hitchhiker  0.0000000000000142581 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02410  C-4 methyl sterol oxidase, putative  48.37 
 
 
343 aa  306  3e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08907  C-4 methyl sterol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02440)  49.64 
 
 
291 aa  301  1e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.225916  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38826  predicted protein  39.84 
 
 
282 aa  191  1e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.914013  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02573  conserved hypothetical protein  30.46 
 
 
313 aa  77  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000109595  normal  0.411684 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09275  C-4 methylsterol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01160)  28.85 
 
 
259 aa  72.4  0.000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000567385  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00640  sphinganine hydroxylase BasA (Eurofung)  29.49 
 
 
430 aa  68.2  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0535507  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03230  sphingosine hydroxylase, putative  32.35 
 
 
346 aa  65.1  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77904  Sphingolipid hydroxylase  29.6 
 
 
345 aa  62  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.726842  normal  0.428926 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3136  sterol desaturase  31.17 
 
 
253 aa  60.5  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2514  fatty acid hydroxylase  28.32 
 
 
267 aa  57.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.842442  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0236  C-5 sterol desaturase  29.53 
 
 
236 aa  56.2  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.652571  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10852  predicted protein  28.05 
 
 
167 aa  55.8  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3005  fatty acid hydroxylase  27.98 
 
 
269 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06506  sterol delta 5,6-desaturase ERG3 (AFU_orthologue; AFUA_6G05140)  27.93 
 
 
352 aa  54.7  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.194474  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1699  sterol desaturase family protein  29.8 
 
 
196 aa  52.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.844125  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05010  C-5 sterol desaturase, putative  29.29 
 
 
328 aa  50.1  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.549969  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0680  C-5 sterol desaturase  26.83 
 
 
271 aa  48.5  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1488  fatty acid hydroxylase  26.36 
 
 
231 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.568753 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6776  fatty acid hydroxylase  28.19 
 
 
334 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.159357 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_6297  predicted protein  26.76 
 
 
185 aa  47  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.711941  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3403  C-5 sterol desaturase  30.13 
 
 
326 aa  46.2  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37371  predicted protein  27.14 
 
 
288 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03638  conserved hypothetical protein  34.92 
 
 
257 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0179967  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  26.32 
 
 
275 aa  42.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>