54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3403 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3403  C-5 sterol desaturase  100 
 
 
326 aa  667    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0911  sterol desaturase  40.18 
 
 
332 aa  248  7e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186369  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2491  fatty acid hydroxylase  38.26 
 
 
344 aa  243  3e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.169325  normal  0.90493 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2297  fatty acid hydroxylase  39.42 
 
 
344 aa  242  7e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6776  fatty acid hydroxylase  30.06 
 
 
334 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.159357 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3005  fatty acid hydroxylase  29.77 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0236  C-5 sterol desaturase  28.14 
 
 
236 aa  76.3  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.652571  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05010  C-5 sterol desaturase, putative  25.09 
 
 
328 aa  72.4  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.549969  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3136  sterol desaturase  28.72 
 
 
253 aa  68.9  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.868848 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09275  C-4 methylsterol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01160)  29.41 
 
 
259 aa  63.9  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000567385  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06506  sterol delta 5,6-desaturase ERG3 (AFU_orthologue; AFUA_6G05140)  30.56 
 
 
352 aa  62.8  0.000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.194474  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38826  predicted protein  29.26 
 
 
282 aa  60.8  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.914013  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28450  C-5 sterol desaturase (Sterol-C5-desaturase) (Ergosterol delta 5,6 desaturase)  29.58 
 
 
369 aa  58.5  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.284899  normal  0.304884 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2984  C-5 sterol desaturase  25.74 
 
 
239 aa  57.8  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0218495  normal  0.0192453 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_6297  predicted protein  30.07 
 
 
185 aa  56.6  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.711941  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0146  fatty acid hydroxylase  25.93 
 
 
257 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113209 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2514  fatty acid hydroxylase  27.65 
 
 
267 aa  54.3  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.842442  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0680  C-5 sterol desaturase  27.92 
 
 
271 aa  53.9  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0075  fatty acid hydroxylase  29.82 
 
 
324 aa  53.1  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00145627 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0600  sterol desaturase-like  27.72 
 
 
306 aa  52  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02573  conserved hypothetical protein  30.34 
 
 
313 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000109595  normal  0.411684 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14208  predicted protein  26.51 
 
 
249 aa  50.8  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  26.92 
 
 
274 aa  50.8  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2347  fatty acid hydroxylase  25.25 
 
 
262 aa  50.8  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1692  fatty acid hydroxylase  28.37 
 
 
248 aa  50.4  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  28.47 
 
 
272 aa  50.1  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  27.19 
 
 
265 aa  50.1  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  27.12 
 
 
270 aa  48.5  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02410  C-4 methyl sterol oxidase, putative  30.26 
 
 
343 aa  47.4  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  26.95 
 
 
400 aa  46.6  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78360  predicted protein  30.13 
 
 
305 aa  46.2  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4418  fatty acid hydroxylase  30.57 
 
 
374 aa  46.2  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  30.61 
 
 
272 aa  45.8  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08907  C-4 methyl sterol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02440)  27.66 
 
 
291 aa  45.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.225916  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5219  hypothetical protein  24.04 
 
 
431 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  28.38 
 
 
597 aa  45.8  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.392021 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3509  sterol desaturase-like protein  25.49 
 
 
426 aa  44.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1382  fatty acid hydroxylase  31.01 
 
 
227 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03638  conserved hypothetical protein  35.38 
 
 
257 aa  44.3  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0179967  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  26.38 
 
 
279 aa  44.3  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37371  predicted protein  25.51 
 
 
288 aa  43.5  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4137  fatty acid hydroxylase  29.3 
 
 
374 aa  43.9  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  27.7 
 
 
597 aa  43.5  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  24.26 
 
 
626 aa  43.5  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06161  C-5 sterol desaturase  22.29 
 
 
271 aa  43.5  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  23.65 
 
 
273 aa  43.5  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7771  fatty acid hydroxylase  25.37 
 
 
284 aa  43.1  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.186795  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5280  fatty acid hydroxylase  23.56 
 
 
431 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  28.12 
 
 
295 aa  43.1  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2637  fatty acid hydroxylase  26.27 
 
 
328 aa  42.7  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  23.56 
 
 
284 aa  42.7  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77904  Sphingolipid hydroxylase  24.6 
 
 
345 aa  42.7  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.726842  normal  0.428926 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  23.78 
 
 
413 aa  42.7  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000349  sterol desaturase family protein  23.87 
 
 
285 aa  42.7  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>