48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2984 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2984  C-5 sterol desaturase  100 
 
 		 239 aa  492  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0218495  normal  0.0192453 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1692  fatty acid hydroxylase  29.79 
 
 		 248 aa  108  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2347  fatty acid hydroxylase  31.09 
 
 		 262 aa  99.4  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3005  fatty acid hydroxylase  29.96 
 
 		 269 aa  91.7  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3136  sterol desaturase  27.57 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2514  fatty acid hydroxylase  27.96 
 
 		 267 aa  65.5  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.842442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0236  C-5 sterol desaturase  22.65 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.652571  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3403  C-5 sterol desaturase  25.74 
 
 		 326 aa  57.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0146  fatty acid hydroxylase  26.11 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113209 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_6297  predicted protein  29.33 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.711941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0680  C-5 sterol desaturase  25.32 
 
 		 271 aa  53.9  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  30.71 
 
 		 275 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06506  sterol delta 5,6-desaturase ERG3 (AFU_orthologue; AFUA_6G05140)  21.6 
 
 		 352 aa  53.9  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.194474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28450  C-5 sterol desaturase (Sterol-C5-desaturase) (Ergosterol delta 5,6 desaturase)  25.56 
 
 		 369 aa  53.5  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.284899  normal  0.304884 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_18900  predicted protein  25.43 
 
 		 283 aa  50.1  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4434  fatty acid hydroxylase  29.41 
 
 		 303 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00391015  normal  0.0114256 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5014  sterol desaturase-like protein  22.12 
 
 		 230 aa  48.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0689  sterol desaturase-like protein  28.47 
 
 		 284 aa  47  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5286  hypothetical protein  25.1 
 
 		 323 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.789525  normal  0.137555 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5722  hypothetical protein  25.1 
 
 		 323 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2491  fatty acid hydroxylase  32 
 
 		 344 aa  46.2  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.169325  normal  0.90493 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5395  fatty acid hydroxylase  28.48 
 
 		 295 aa  46.2  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.291326 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0075  fatty acid hydroxylase  25.81 
 
 		 324 aa  45.8  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00145627 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2297  fatty acid hydroxylase  43.4 
 
 		 344 aa  45.4  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6776  fatty acid hydroxylase  31.53 
 
 		 334 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159357 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1254  hypothetical protein  27.61 
 
 		 324 aa  44.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.757696  normal  0.605 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0911  sterol desaturase  30.89 
 
 		 332 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5741  hypothetical protein  28.95 
 
 		 320 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  28.76 
 
 		 400 aa  43.1  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2304  fatty acid hydroxylase  31.58 
 
 		 298 aa  43.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38826  predicted protein  28.67 
 
 		 282 aa  43.1  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.914013  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03230  sphingosine hydroxylase, putative  26.92 
 
 		 346 aa  43.1  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  31.13 
 
 		 259 aa  42.7  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05010  C-5 sterol desaturase, putative  25.27 
 
 		 328 aa  42.7  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.549969  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1644  fatty acid hydroxylase  27.34 
 
 		 295 aa  42.7  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14208  predicted protein  28.78 
 
 		 249 aa  42.7  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1433  hypothetical protein  24.55 
 
 		 324 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1451  hypothetical protein  24.55 
 
 		 324 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1174  fatty acid hydroxylase  25.77 
 
 		 324 aa  42  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06973  C-4 methyl sterol oxidase Erg25, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04820)  25.36 
 
 		 302 aa  42  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.244737  hitchhiker  0.0000000000000142581 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2774  hypothetical protein  23.36 
 
 		 329 aa  42  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  30 
 
 		 265 aa  42  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2639  hypothetical protein  23.36 
 
 		 329 aa  42  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2695  hypothetical protein  23.36 
 
 		 329 aa  42  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231759  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2257  hypothetical protein  23.36 
 
 		 329 aa  41.6  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.648004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3063  hypothetical protein  23.36 
 
 		 329 aa  41.6  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00223094  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1382  fatty acid hydroxylase  23.64 
 
 		 227 aa  41.6  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1528  hypothetical protein  23.36 
 
 		 329 aa  41.6  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0526335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>