133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0236 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0236  C-5 sterol desaturase  100 
 
 
236 aa  474  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.652571  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3136  sterol desaturase  73.59 
 
 
253 aa  335  5e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3005  fatty acid hydroxylase  41.77 
 
 
269 aa  192  5e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0680  C-5 sterol desaturase  37.02 
 
 
271 aa  147  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0146  fatty acid hydroxylase  36.73 
 
 
257 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113209 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2514  fatty acid hydroxylase  36.51 
 
 
267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.842442  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_6297  predicted protein  29.47 
 
 
185 aa  87  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.711941  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2347  fatty acid hydroxylase  30.77 
 
 
262 aa  84.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1692  fatty acid hydroxylase  30.96 
 
 
248 aa  79  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3403  C-5 sterol desaturase  28.64 
 
 
326 aa  78.2  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05010  C-5 sterol desaturase, putative  29.44 
 
 
328 aa  72.4  0.000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.549969  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  32.24 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1699  sterol desaturase family protein  26.32 
 
 
196 aa  70.9  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.844125  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1382  fatty acid hydroxylase  29.37 
 
 
227 aa  70.5  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06506  sterol delta 5,6-desaturase ERG3 (AFU_orthologue; AFUA_6G05140)  26.67 
 
 
352 aa  68.9  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.194474  normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_18900  predicted protein  33.88 
 
 
283 aa  68.9  0.00000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1488  fatty acid hydroxylase  21.4 
 
 
231 aa  65.9  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.568753 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38826  predicted protein  33.11 
 
 
282 aa  65.5  0.0000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.914013  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02573  conserved hypothetical protein  28.08 
 
 
313 aa  64.3  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000109595  normal  0.411684 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  30.81 
 
 
270 aa  65.1  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1118  fatty acid hydroxylase  27.21 
 
 
325 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.325858  normal  0.912027 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2984  C-5 sterol desaturase  25.9 
 
 
239 aa  63.5  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0218495  normal  0.0192453 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06973  C-4 methyl sterol oxidase Erg25, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04820)  27.92 
 
 
302 aa  62.8  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.244737  hitchhiker  0.0000000000000142581 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2190  sterol desaturase-like protein  26.53 
 
 
324 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14208  predicted protein  27.33 
 
 
249 aa  62.4  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2063  fatty acid hydroxylase  26.53 
 
 
324 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589022  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  28.77 
 
 
272 aa  61.6  0.000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2774  hypothetical protein  26.03 
 
 
329 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2639  hypothetical protein  26.03 
 
 
329 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2695  hypothetical protein  26.03 
 
 
329 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231759  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1840  hypothetical protein  26.03 
 
 
329 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194533  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2257  hypothetical protein  26.03 
 
 
329 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.648004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3063  hypothetical protein  26.03 
 
 
329 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00223094  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78360  predicted protein  29.53 
 
 
305 aa  61.2  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1528  hypothetical protein  26.03 
 
 
329 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0526335  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5014  sterol desaturase-like protein  26.67 
 
 
230 aa  61.2  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5462  sterol desaturase-like  26.03 
 
 
324 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5924  sterol desaturase-like  26.62 
 
 
324 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2153  sterol desaturase-like protein  26.62 
 
 
324 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135202  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2171  fatty acid hydroxylase  26.62 
 
 
324 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.689731 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02410  C-4 methyl sterol oxidase, putative  29.53 
 
 
343 aa  59.3  0.00000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6776  fatty acid hydroxylase  26.87 
 
 
334 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.159357 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  31.25 
 
 
265 aa  58.9  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03230  sphingosine hydroxylase, putative  30 
 
 
346 aa  58.5  0.00000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2845  sterol desaturase-like protein  31.79 
 
 
308 aa  58.5  0.00000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74706  membrane-bound non-heme di-iron oxygenase involved in lipid metabolism  28.3 
 
 
294 aa  57.8  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  29.88 
 
 
374 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3509  sterol desaturase-like protein  32.19 
 
 
426 aa  57.4  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2619  fatty acid hydroxylase  24.48 
 
 
332 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.010312  normal  0.695137 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  29.94 
 
 
330 aa  57  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  29.94 
 
 
330 aa  57  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1517  hypothetical protein  26.85 
 
 
332 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.012017  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  29.5 
 
 
272 aa  56.2  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  29.07 
 
 
279 aa  55.5  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28450  C-5 sterol desaturase (Sterol-C5-desaturase) (Ergosterol delta 5,6 desaturase)  27.82 
 
 
369 aa  55.1  0.0000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.284899  normal  0.304884 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  29.27 
 
 
376 aa  55.5  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  27.74 
 
 
259 aa  54.7  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1485  fatty acid hydroxylase  25.66 
 
 
327 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12734  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  27.56 
 
 
281 aa  53.9  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  29.69 
 
 
267 aa  54.3  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08907  C-4 methyl sterol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02440)  32.17 
 
 
291 aa  53.5  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.225916  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09275  C-4 methylsterol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01160)  29.8 
 
 
259 aa  53.5  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000567385  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2297  fatty acid hydroxylase  24.84 
 
 
344 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2491  fatty acid hydroxylase  25.32 
 
 
344 aa  52.4  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.169325  normal  0.90493 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  24.67 
 
 
273 aa  51.6  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  26.17 
 
 
295 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2066  hypothetical protein  26.44 
 
 
331 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  25.35 
 
 
264 aa  50.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  26.45 
 
 
267 aa  50.8  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  31.51 
 
 
626 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03638  conserved hypothetical protein  29.63 
 
 
257 aa  50.4  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0179967  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0911  sterol desaturase  27.85 
 
 
332 aa  50.1  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186369  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4808  hypothetical protein  27 
 
 
305 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0507867  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  28.47 
 
 
272 aa  50.1  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  27.21 
 
 
401 aa  49.7  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  27.21 
 
 
401 aa  49.7  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02830  conserved hypothetical protein  28.32 
 
 
348 aa  48.9  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.11787  normal  0.073643 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  31.06 
 
 
284 aa  49.3  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47593  predicted protein  28.08 
 
 
663 aa  48.9  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55230  hypothetical protein  27.52 
 
 
301 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.226286  hitchhiker  0.000000221588 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10852  predicted protein  28.67 
 
 
167 aa  48.5  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  28.12 
 
 
256 aa  48.5  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00949  conserved hypothetical protein  26.62 
 
 
347 aa  48.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.6922  normal  0.603934 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  26.53 
 
 
385 aa  48.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  24.05 
 
 
304 aa  48.1  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00640  sphinganine hydroxylase BasA (Eurofung)  29.85 
 
 
430 aa  47.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0535507  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5219  hypothetical protein  31.76 
 
 
431 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  30.36 
 
 
337 aa  47  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1804  hypothetical protein  28.12 
 
 
320 aa  47.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000255396 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  30.56 
 
 
597 aa  47.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0242  hypothetical protein  29.22 
 
 
325 aa  47  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0075  fatty acid hydroxylase  28.1 
 
 
324 aa  47  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00145627 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1001  sterol desaturase-related protein  29.01 
 
 
282 aa  46.6  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  27.06 
 
 
283 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  29.03 
 
 
270 aa  46.2  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  30.5 
 
 
597 aa  46.6  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.392021 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5280  fatty acid hydroxylase  31.08 
 
 
431 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77904  Sphingolipid hydroxylase  29.41 
 
 
345 aa  46.2  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.726842  normal  0.428926 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5128  sterol desaturase-like protein  31.08 
 
 
431 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1362  fatty acid hydroxylase  30.49 
 
 
257 aa  46.2  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000314622  normal  0.441838 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>