18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_74706 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_74706  membrane-bound non-heme di-iron oxygenase involved in lipid metabolism  100 
 
 
294 aa  609  1e-173  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78360  predicted protein  62.59 
 
 
305 aa  391  1e-108  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06973  C-4 methyl sterol oxidase Erg25, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04820)  58.16 
 
 
302 aa  342  2.9999999999999997e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.244737  hitchhiker  0.0000000000000142581 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02410  C-4 methyl sterol oxidase, putative  52.77 
 
 
343 aa  296  2e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08907  C-4 methyl sterol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02440)  48.91 
 
 
291 aa  278  7e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.225916  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38826  predicted protein  37.04 
 
 
282 aa  181  1e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.914013  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02573  conserved hypothetical protein  28.92 
 
 
313 aa  73.6  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000109595  normal  0.411684 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09275  C-4 methylsterol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01160)  29.02 
 
 
259 aa  69.7  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000567385  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03230  sphingosine hydroxylase, putative  33.83 
 
 
346 aa  63.5  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00640  sphinganine hydroxylase BasA (Eurofung)  26.76 
 
 
430 aa  59.7  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0535507  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0236  C-5 sterol desaturase  27.95 
 
 
236 aa  53.9  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.652571  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3136  sterol desaturase  26.18 
 
 
253 aa  52.8  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05010  C-5 sterol desaturase, putative  32.48 
 
 
328 aa  51.2  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.549969  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77904  Sphingolipid hydroxylase  26.47 
 
 
345 aa  50.1  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.726842  normal  0.428926 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3005  fatty acid hydroxylase  27.43 
 
 
269 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06506  sterol delta 5,6-desaturase ERG3 (AFU_orthologue; AFUA_6G05140)  28.49 
 
 
352 aa  43.9  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.194474  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28450  C-5 sterol desaturase (Sterol-C5-desaturase) (Ergosterol delta 5,6 desaturase)  27.37 
 
 
369 aa  43.5  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.284899  normal  0.304884 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0680  C-5 sterol desaturase  26.16 
 
 
271 aa  42.4  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>