96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3005 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3005  fatty acid hydroxylase  100 
 
 		 269 aa  548  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3136  sterol desaturase  41.8 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0236  C-5 sterol desaturase  41.77 
 
 		 236 aa  178  7e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.652571  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0680  C-5 sterol desaturase  36.29 
 
 		 271 aa  172  3.9999999999999995e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0146  fatty acid hydroxylase  37.5 
 
 		 257 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113209 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2514  fatty acid hydroxylase  30.34 
 
 		 267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.842442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_6297  predicted protein  33.55 
 
 		 185 aa  94.4  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.711941  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05010  C-5 sterol desaturase, putative  27.71 
 
 		 328 aa  92.4  7e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.549969  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2984  C-5 sterol desaturase  29.96 
 
 		 239 aa  91.7  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0218495  normal  0.0192453 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06506  sterol delta 5,6-desaturase ERG3 (AFU_orthologue; AFUA_6G05140)  29.29 
 
 		 352 aa  81.6  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.194474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2347  fatty acid hydroxylase  27.69 
 
 		 262 aa  81.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3403  C-5 sterol desaturase  29.77 
 
 		 326 aa  81.3  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1692  fatty acid hydroxylase  29.66 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2297  fatty acid hydroxylase  27.36 
 
 		 344 aa  69.7  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14208  predicted protein  27.8 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28450  C-5 sterol desaturase (Sterol-C5-desaturase) (Ergosterol delta 5,6 desaturase)  26.19 
 
 		 369 aa  66.2  0.0000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.284899  normal  0.304884 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  33.33 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1488  fatty acid hydroxylase  26.09 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568753 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2491  fatty acid hydroxylase  28.64 
 
 		 344 aa  65.1  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.169325  normal  0.90493 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5014  sterol desaturase-like protein  23.18 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1382  fatty acid hydroxylase  29.03 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6776  fatty acid hydroxylase  27.88 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159357 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  26.03 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2619  fatty acid hydroxylase  24.69 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.010312  normal  0.695137 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  28.57 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1517  hypothetical protein  24.69 
 
 		 332 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.012017  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_18900  predicted protein  24.51 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2153  sterol desaturase-like protein  27.41 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135202  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1528  hypothetical protein  26.87 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0526335  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2257  hypothetical protein  26.87 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.648004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3063  hypothetical protein  26.87 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00223094  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2639  hypothetical protein  26.87 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2695  hypothetical protein  26.87 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231759  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5924  sterol desaturase-like  27.41 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2171  fatty acid hydroxylase  27.41 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.689731 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2774  hypothetical protein  26.87 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  25 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2190  sterol desaturase-like protein  28.15 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26403  predicted protein  33.83 
 
 		 621 aa  57.4  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00293247  decreased coverage  0.00469523 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2063  fatty acid hydroxylase  28.15 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1840  hypothetical protein  27.41 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194533  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  25.85 
 
 		 295 aa  57  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1118  fatty acid hydroxylase  27.41 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.325858  normal  0.912027 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03638  conserved hypothetical protein  36.23 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0179967  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08907  C-4 methyl sterol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02440)  28.48 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.225916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78360  predicted protein  27.98 
 
 		 305 aa  55.1  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  27.52 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  24.73 
 
 		 279 aa  55.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38826  predicted protein  24.74 
 
 		 282 aa  53.9  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.914013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5462  sterol desaturase-like  25.93 
 
 		 324 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  24.46 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1485  fatty acid hydroxylase  26.24 
 
 		 327 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47593  predicted protein  32.89 
 
 		 663 aa  53.9  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02410  C-4 methyl sterol oxidase, putative  30.23 
 
 		 343 aa  53.5  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1699  sterol desaturase family protein  24.86 
 
 		 196 aa  52.8  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.844125  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06973  C-4 methyl sterol oxidase Erg25, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04820)  28.41 
 
 		 302 aa  52.4  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.244737  hitchhiker  0.0000000000000142581 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  27.06 
 
 		 270 aa  52.4  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  28.67 
 
 		 330 aa  52  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  28.67 
 
 		 330 aa  52  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09275  C-4 methylsterol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01160)  28.8 
 
 		 259 aa  51.2  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000567385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  25.35 
 
 		 281 aa  50.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  28.95 
 
 		 337 aa  50.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  26.8 
 
 		 273 aa  50.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  29.66 
 
 		 626 aa  49.7  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  25.37 
 
 		 304 aa  49.7  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0287  sterol desaturase-like protein  27.5 
 
 		 287 aa  49.3  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897379 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0045  hypothetical protein  27.53 
 
 		 291 aa  48.9  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  26.81 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  27.59 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  26.4 
 
 		 272 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  25.32 
 
 		 597 aa  47.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0600  sterol desaturase-like  26.83 
 
 		 306 aa  47  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  25.54 
 
 		 283 aa  46.2  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1082  fatty acid hydroxylase  25.79 
 
 		 324 aa  45.8  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10852  predicted protein  27.59 
 
 		 167 aa  45.8  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  24.84 
 
 		 597 aa  45.8  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.392021 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1174  fatty acid hydroxylase  25.79 
 
 		 324 aa  45.8  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  26.14 
 
 		 273 aa  45.4  0.0009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74706  membrane-bound non-heme di-iron oxygenase involved in lipid metabolism  27.43 
 
 		 294 aa  45.1  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  23.12 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0365  fatty acid hydroxylase  26.95 
 
 		 274 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0951  hypothetical protein  26.42 
 
 		 244 aa  45.4  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  26.06 
 
 		 267 aa  43.9  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  26.92 
 
 		 270 aa  44.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7771  fatty acid hydroxylase  28.06 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.186795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0911  sterol desaturase  23.64 
 
 		 332 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186369  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02573  conserved hypothetical protein  24.89 
 
 		 313 aa  44.3  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000109595  normal  0.411684 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3261  hypothetical protein  26.45 
 
 		 264 aa  43.9  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0633506  hitchhiker  0.0000000000915879 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5280  fatty acid hydroxylase  30.57 
 
 		 431 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5219  hypothetical protein  29.68 
 
 		 431 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1903  hypothetical protein  29.47 
 
 		 245 aa  43.5  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4418  fatty acid hydroxylase  27.1 
 
 		 374 aa  43.1  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4137  fatty acid hydroxylase  24.29 
 
 		 374 aa  43.1  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  28.76 
 
 		 268 aa  43.1  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5128  sterol desaturase-like protein  29.68 
 
 		 431 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  22.15 
 
 		 256 aa  42  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>