28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC02410 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006685  CNC02410  C-4 methyl sterol oxidase, putative  100 
 
 
343 aa  709    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06973  C-4 methyl sterol oxidase Erg25, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04820)  55.88 
 
 
302 aa  321  9.999999999999999e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.244737  hitchhiker  0.0000000000000142581 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78360  predicted protein  48.37 
 
 
305 aa  307  2.0000000000000002e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74706  membrane-bound non-heme di-iron oxygenase involved in lipid metabolism  52.77 
 
 
294 aa  296  3e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08907  C-4 methyl sterol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02440)  49.21 
 
 
291 aa  271  2e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.225916  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38826  predicted protein  40 
 
 
282 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.914013  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09275  C-4 methylsterol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01160)  32.23 
 
 
259 aa  90.5  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000567385  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02573  conserved hypothetical protein  31.09 
 
 
313 aa  80.9  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000109595  normal  0.411684 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77904  Sphingolipid hydroxylase  28.29 
 
 
345 aa  66.2  0.0000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.726842  normal  0.428926 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00640  sphinganine hydroxylase BasA (Eurofung)  29.08 
 
 
430 aa  64.3  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0535507  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05010  C-5 sterol desaturase, putative  24.56 
 
 
328 aa  63.5  0.000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.549969  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03230  sphingosine hydroxylase, putative  30.22 
 
 
346 aa  63.2  0.000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3136  sterol desaturase  33.33 
 
 
253 aa  60.5  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_6297  predicted protein  30.77 
 
 
185 aa  59.3  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.711941  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2514  fatty acid hydroxylase  29.69 
 
 
267 aa  58.9  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.842442  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10852  predicted protein  31.17 
 
 
167 aa  58.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0236  C-5 sterol desaturase  29.53 
 
 
236 aa  55.8  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.652571  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3005  fatty acid hydroxylase  30.23 
 
 
269 aa  53.5  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06506  sterol delta 5,6-desaturase ERG3 (AFU_orthologue; AFUA_6G05140)  26 
 
 
352 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.194474  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  28.77 
 
 
401 aa  50.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  28.77 
 
 
401 aa  50.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  27.4 
 
 
385 aa  48.9  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3403  C-5 sterol desaturase  30.26 
 
 
326 aa  47.4  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0911  sterol desaturase  25.19 
 
 
332 aa  46.6  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186369  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  24.2 
 
 
283 aa  44.3  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  24.86 
 
 
265 aa  43.5  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0680  C-5 sterol desaturase  26.23 
 
 
271 aa  43.5  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28450  C-5 sterol desaturase (Sterol-C5-desaturase) (Ergosterol delta 5,6 desaturase)  25.64 
 
 
369 aa  42.7  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.284899  normal  0.304884 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>