26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0911 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0911  sterol desaturase  100 
 
 		 332 aa  679    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2491  fatty acid hydroxylase  43.5 
 
 		 344 aa  301  8.000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.169325  normal  0.90493 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2297  fatty acid hydroxylase  42.9 
 
 		 344 aa  292  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6776  fatty acid hydroxylase  38.44 
 
 		 334 aa  263  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159357 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3403  C-5 sterol desaturase  40.18 
 
 		 326 aa  248  7e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0680  C-5 sterol desaturase  27.98 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09275  C-4 methylsterol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01160)  28.9 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000567385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0146  fatty acid hydroxylase  27.21 
 
 		 257 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113209 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2347  fatty acid hydroxylase  28.57 
 
 		 262 aa  50.8  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3136  sterol desaturase  28.86 
 
 		 253 aa  49.3  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0236  C-5 sterol desaturase  27.85 
 
 		 236 aa  48.9  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.652571  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_6297  predicted protein  26.36 
 
 		 185 aa  47  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.711941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2514  fatty acid hydroxylase  28.78 
 
 		 267 aa  47.4  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.842442  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02410  C-4 methyl sterol oxidase, putative  25.19 
 
 		 343 aa  46.6  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_18900  predicted protein  28.47 
 
 		 283 aa  45.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1692  fatty acid hydroxylase  26.58 
 
 		 248 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28450  C-5 sterol desaturase (Sterol-C5-desaturase) (Ergosterol delta 5,6 desaturase)  25.5 
 
 		 369 aa  45.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.284899  normal  0.304884 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2984  C-5 sterol desaturase  30.89 
 
 		 239 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0218495  normal  0.0192453 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08907  C-4 methyl sterol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02440)  35.82 
 
 		 291 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.225916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3005  fatty acid hydroxylase  23.64 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14208  predicted protein  25.94 
 
 		 249 aa  44.3  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  26.64 
 
 		 270 aa  43.1  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05010  C-5 sterol desaturase, putative  29.55 
 
 		 328 aa  43.5  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.549969  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  25.51 
 
 		 274 aa  43.1  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03638  conserved hypothetical protein  31.07 
 
 		 257 aa  43.1  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0179967  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06506  sterol delta 5,6-desaturase ERG3 (AFU_orthologue; AFUA_6G05140)  26.19 
 
 		 352 aa  42.4  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.194474  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>