136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_3136 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_3136  sterol desaturase  100 
 
 		 253 aa  500  1e-141  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0236  C-5 sterol desaturase  73.59 
 
 		 236 aa  331  7.000000000000001e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.652571  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3005  fatty acid hydroxylase  41.8 
 
 		 269 aa  194  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0680  C-5 sterol desaturase  41.88 
 
 		 271 aa  145  4.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0146  fatty acid hydroxylase  38.22 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113209 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2514  fatty acid hydroxylase  40.96 
 
 		 267 aa  113  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.842442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2347  fatty acid hydroxylase  34.15 
 
 		 262 aa  90.5  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_6297  predicted protein  29.63 
 
 		 185 aa  89.4  5e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.711941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1692  fatty acid hydroxylase  33.67 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05010  C-5 sterol desaturase, putative  26.96 
 
 		 328 aa  77.8  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.549969  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06506  sterol delta 5,6-desaturase ERG3 (AFU_orthologue; AFUA_6G05140)  25.37 
 
 		 352 aa  73.6  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.194474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3403  C-5 sterol desaturase  28.72 
 
 		 326 aa  72.8  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_18900  predicted protein  32.35 
 
 		 283 aa  71.6  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2984  C-5 sterol desaturase  27.57 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0218495  normal  0.0192453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1382  fatty acid hydroxylase  30.65 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  28.75 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14208  predicted protein  30.67 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78360  predicted protein  30.49 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1699  sterol desaturase family protein  24.49 
 
 		 196 aa  64.7  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.844125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5014  sterol desaturase-like protein  23.86 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02410  C-4 methyl sterol oxidase, putative  30.67 
 
 		 343 aa  63.2  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38826  predicted protein  28.05 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.914013  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06973  C-4 methyl sterol oxidase Erg25, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04820)  27.91 
 
 		 302 aa  62  0.000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.244737  hitchhiker  0.0000000000000142581 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2774  hypothetical protein  30.28 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  31.11 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2257  hypothetical protein  30.28 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.648004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3063  hypothetical protein  30.28 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00223094  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2639  hypothetical protein  30.28 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2695  hypothetical protein  30.28 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231759  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1528  hypothetical protein  30.28 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0526335  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1118  fatty acid hydroxylase  28.07 
 
 		 325 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.325858  normal  0.912027 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1840  hypothetical protein  29.79 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194533  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2845  sterol desaturase-like protein  31.9 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1488  fatty acid hydroxylase  20.28 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568753 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2190  sterol desaturase-like protein  28.41 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  30.77 
 
 		 281 aa  60.1  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2063  fatty acid hydroxylase  28.41 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589022  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02573  conserved hypothetical protein  27.5 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000109595  normal  0.411684 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74706  membrane-bound non-heme di-iron oxygenase involved in lipid metabolism  26.18 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  32.07 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28450  C-5 sterol desaturase (Sterol-C5-desaturase) (Ergosterol delta 5,6 desaturase)  25.1 
 
 		 369 aa  59.7  0.00000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.284899  normal  0.304884 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2066  hypothetical protein  27.46 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5924  sterol desaturase-like  26.47 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2153  sterol desaturase-like protein  26.47 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135202  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2171  fatty acid hydroxylase  26.47 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.689731 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2619  fatty acid hydroxylase  28.37 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.010312  normal  0.695137 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  35.14 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  35.14 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  30.23 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5462  sterol desaturase-like  27.33 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1517  hypothetical protein  27.66 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.012017  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  27.43 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  29.67 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6776  fatty acid hydroxylase  28.68 
 
 		 334 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159357 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0911  sterol desaturase  28.86 
 
 		 332 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1174  fatty acid hydroxylase  28.3 
 
 		 324 aa  53.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1082  fatty acid hydroxylase  27.67 
 
 		 324 aa  53.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  28.09 
 
 		 376 aa  53.1  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  30.57 
 
 		 273 aa  52.4  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  31.45 
 
 		 275 aa  52.4  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  27.74 
 
 		 295 aa  52.8  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  31.65 
 
 		 626 aa  52.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2491  fatty acid hydroxylase  27.54 
 
 		 344 aa  52.4  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.169325  normal  0.90493 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47593  predicted protein  29.45 
 
 		 663 aa  52  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03638  conserved hypothetical protein  28.38 
 
 		 257 aa  52  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0179967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  29.87 
 
 		 374 aa  51.2  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3509  sterol desaturase-like protein  26.9 
 
 		 426 aa  52  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804962  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  28.75 
 
 		 272 aa  51.2  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09275  C-4 methylsterol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01160)  29.68 
 
 		 259 aa  51.2  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000567385  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  29.32 
 
 		 337 aa  50.8  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  29.63 
 
 		 401 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1804  hypothetical protein  27.93 
 
 		 320 aa  50.8  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000255396 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2297  fatty acid hydroxylase  26.21 
 
 		 344 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  25.17 
 
 		 259 aa  50.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5005  fatty acid hydroxylase  27.01 
 
 		 326 aa  51.2  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1485  fatty acid hydroxylase  25.34 
 
 		 327 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  29.63 
 
 		 401 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03230  sphingosine hydroxylase, putative  27.27 
 
 		 346 aa  50.4  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1439  hypothetical protein  27.72 
 
 		 328 aa  50.4  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08907  C-4 methyl sterol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02440)  29.45 
 
 		 291 aa  49.7  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.225916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  31.91 
 
 		 265 aa  49.7  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  28.4 
 
 		 385 aa  49.3  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  29.25 
 
 		 597 aa  49.3  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00640  sphinganine hydroxylase BasA (Eurofung)  27.07 
 
 		 430 aa  48.9  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0535507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77904  Sphingolipid hydroxylase  27.14 
 
 		 345 aa  48.9  0.00007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.726842  normal  0.428926 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3502  fatty acid hydroxylase  27.98 
 
 		 309 aa  48.9  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0956724 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  30.05 
 
 		 282 aa  48.5  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1254  hypothetical protein  26.23 
 
 		 324 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.757696  normal  0.605 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0537  fatty acid hydroxylase  32.03 
 
 		 319 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  29.17 
 
 		 597 aa  48.5  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.392021 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  27.5 
 
 		 267 aa  48.1  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  28.57 
 
 		 386 aa  47.4  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2783  hypothetical protein  25.86 
 
 		 321 aa  47.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292274 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  28.1 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0242  hypothetical protein  29.3 
 
 		 325 aa  47.4  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3177  fatty acid hydroxylase  27.68 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  23.97 
 
 		 293 aa  47  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2062  transmembrane protein  25.16 
 
 		 324 aa  46.2  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  26.26 
 
 		 283 aa  46.6  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0321  fatty acid hydroxylase  27.4 
 
 		 289 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404063  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>