28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_28450 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_28450  C-5 sterol desaturase (Sterol-C5-desaturase) (Ergosterol delta 5,6 desaturase)  100 
 
 		 369 aa  766    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.284899  normal  0.304884 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06506  sterol delta 5,6-desaturase ERG3 (AFU_orthologue; AFUA_6G05140)  48.39 
 
 		 352 aa  348  7e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.194474  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05010  C-5 sterol desaturase, putative  41.14 
 
 		 328 aa  246  4e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.549969  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03638  conserved hypothetical protein  42.86 
 
 		 257 aa  222  6e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0179967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_6297  predicted protein  45.41 
 
 		 185 aa  154  2e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.711941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14208  predicted protein  34.29 
 
 		 249 aa  97.8  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0680  C-5 sterol desaturase  28.86 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3005  fatty acid hydroxylase  26.19 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3403  C-5 sterol desaturase  29.58 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02573  conserved hypothetical protein  26.97 
 
 		 313 aa  55.8  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000109595  normal  0.411684 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3136  sterol desaturase  26.56 
 
 		 253 aa  55.8  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2347  fatty acid hydroxylase  26.27 
 
 		 262 aa  55.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2491  fatty acid hydroxylase  27.44 
 
 		 344 aa  53.9  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.169325  normal  0.90493 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38826  predicted protein  29.47 
 
 		 282 aa  53.5  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.914013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2984  C-5 sterol desaturase  25.56 
 
 		 239 aa  53.5  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0218495  normal  0.0192453 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0236  C-5 sterol desaturase  27.82 
 
 		 236 aa  53.1  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.652571  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09275  C-4 methylsterol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01160)  28.65 
 
 		 259 aa  53.1  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000567385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47593  predicted protein  32.03 
 
 		 663 aa  52.8  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6776  fatty acid hydroxylase  26.03 
 
 		 334 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159357 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00640  sphinganine hydroxylase BasA (Eurofung)  28.02 
 
 		 430 aa  50.4  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0535507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1488  fatty acid hydroxylase  26.92 
 
 		 231 aa  49.7  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568753 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2297  fatty acid hydroxylase  25.61 
 
 		 344 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_18900  predicted protein  23.47 
 
 		 283 aa  48.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0911  sterol desaturase  25.5 
 
 		 332 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0146  fatty acid hydroxylase  24.68 
 
 		 257 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113209 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  25.15 
 
 		 272 aa  43.5  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74706  membrane-bound non-heme di-iron oxygenase involved in lipid metabolism  27.37 
 
 		 294 aa  43.5  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45494  predicted protein  28.46 
 
 		 348 aa  42.7  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>