27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2491 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2491  fatty acid hydroxylase  100 
 
 
344 aa  716    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.169325  normal  0.90493 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2297  fatty acid hydroxylase  84.01 
 
 
344 aa  626  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6776  fatty acid hydroxylase  53.17 
 
 
334 aa  373  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.159357 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0911  sterol desaturase  43.5 
 
 
332 aa  301  9e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186369  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3403  C-5 sterol desaturase  38.26 
 
 
326 aa  243  3e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1692  fatty acid hydroxylase  32.67 
 
 
248 aa  66.6  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3005  fatty acid hydroxylase  28.64 
 
 
269 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0680  C-5 sterol desaturase  28.31 
 
 
271 aa  61.6  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05010  C-5 sterol desaturase, putative  24.3 
 
 
328 aa  60.1  0.00000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.549969  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0146  fatty acid hydroxylase  37.8 
 
 
257 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113209 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06506  sterol delta 5,6-desaturase ERG3 (AFU_orthologue; AFUA_6G05140)  27.88 
 
 
352 aa  55.8  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.194474  normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_18900  predicted protein  28.12 
 
 
283 aa  55.5  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2347  fatty acid hydroxylase  29.17 
 
 
262 aa  55.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2514  fatty acid hydroxylase  31.52 
 
 
267 aa  54.3  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.842442  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28450  C-5 sterol desaturase (Sterol-C5-desaturase) (Ergosterol delta 5,6 desaturase)  27.44 
 
 
369 aa  53.9  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.284899  normal  0.304884 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09275  C-4 methylsterol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01160)  30.91 
 
 
259 aa  53.1  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000567385  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0236  C-5 sterol desaturase  26.85 
 
 
236 aa  51.2  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.652571  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38826  predicted protein  29.41 
 
 
282 aa  48.9  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.914013  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3136  sterol desaturase  27.54 
 
 
253 aa  49.3  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2984  C-5 sterol desaturase  32 
 
 
239 aa  46.2  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0218495  normal  0.0192453 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  23.58 
 
 
413 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03638  conserved hypothetical protein  42.86 
 
 
257 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0179967  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14208  predicted protein  29.6 
 
 
249 aa  43.5  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0600  sterol desaturase-like  26.63 
 
 
306 aa  43.5  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1382  fatty acid hydroxylase  28.57 
 
 
227 aa  43.5  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5014  sterol desaturase-like protein  30.84 
 
 
230 aa  42.7  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02573  conserved hypothetical protein  25.78 
 
 
313 aa  42.7  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000109595  normal  0.411684 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>