75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0146 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0146  fatty acid hydroxylase  100 
 
 
257 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113209 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0680  C-5 sterol desaturase  51.85 
 
 
271 aa  240  1e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3005  fatty acid hydroxylase  37.14 
 
 
269 aa  177  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3136  sterol desaturase  38.22 
 
 
253 aa  157  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0236  C-5 sterol desaturase  36.73 
 
 
236 aa  144  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.652571  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2514  fatty acid hydroxylase  31.72 
 
 
267 aa  119  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.842442  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05010  C-5 sterol desaturase, putative  33.33 
 
 
328 aa  97.8  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.549969  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_6297  predicted protein  30.6 
 
 
185 aa  88.6  8e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.711941  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1692  fatty acid hydroxylase  27.52 
 
 
248 aa  78.2  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2347  fatty acid hydroxylase  29.69 
 
 
262 aa  77.8  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06506  sterol delta 5,6-desaturase ERG3 (AFU_orthologue; AFUA_6G05140)  26.9 
 
 
352 aa  76.3  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.194474  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2984  C-5 sterol desaturase  28.86 
 
 
239 aa  67.4  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0218495  normal  0.0192453 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  30.1 
 
 
270 aa  65.1  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14208  predicted protein  27.47 
 
 
249 aa  64.7  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2297  fatty acid hydroxylase  32.33 
 
 
344 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06973  C-4 methyl sterol oxidase Erg25, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04820)  32.24 
 
 
302 aa  61.6  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.244737  hitchhiker  0.0000000000000142581 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3403  C-5 sterol desaturase  25.97 
 
 
326 aa  61.6  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2491  fatty acid hydroxylase  30 
 
 
344 aa  60.5  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.169325  normal  0.90493 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  25.93 
 
 
265 aa  59.7  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  28.21 
 
 
272 aa  59.3  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  28.3 
 
 
272 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0911  sterol desaturase  31.34 
 
 
332 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186369  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6776  fatty acid hydroxylase  28.78 
 
 
334 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.159357 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0045  hypothetical protein  30.34 
 
 
291 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  29.08 
 
 
321 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28450  C-5 sterol desaturase (Sterol-C5-desaturase) (Ergosterol delta 5,6 desaturase)  25 
 
 
369 aa  54.3  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.284899  normal  0.304884 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  24.66 
 
 
259 aa  53.5  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5014  sterol desaturase-like protein  28.89 
 
 
230 aa  53.9  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1488  fatty acid hydroxylase  22.27 
 
 
231 aa  53.1  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.568753 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  27.97 
 
 
279 aa  52.8  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  31.39 
 
 
272 aa  52  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  25.53 
 
 
273 aa  52  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  29.66 
 
 
330 aa  51.6  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  29.66 
 
 
330 aa  51.6  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_18900  predicted protein  23.36 
 
 
283 aa  51.6  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1140  hypothetical protein  25.17 
 
 
304 aa  50.8  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132577  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03638  conserved hypothetical protein  25.48 
 
 
257 aa  50.4  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0179967  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0136  hypothetical protein  25.87 
 
 
270 aa  50.1  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.45703  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1390  membrane protein  27.81 
 
 
267 aa  50.1  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104354  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1810  sterol desaturase-related protein  30.61 
 
 
386 aa  50.1  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0163387  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2845  sterol desaturase-like protein  23.12 
 
 
308 aa  49.7  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02255  hypothetical protein  25.54 
 
 
281 aa  49.3  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0001  hypothetical protein  22.84 
 
 
297 aa  48.9  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.840453 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02573  conserved hypothetical protein  32 
 
 
313 aa  48.5  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000109595  normal  0.411684 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38826  predicted protein  24.44 
 
 
282 aa  48.5  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.914013  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02410  C-4 methyl sterol oxidase, putative  28.99 
 
 
343 aa  48.1  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  22.62 
 
 
295 aa  48.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09275  C-4 methylsterol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01160)  24.43 
 
 
259 aa  48.5  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000567385  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  25.62 
 
 
626 aa  48.1  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0242  hypothetical protein  28.34 
 
 
325 aa  47.4  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10852  predicted protein  27.89 
 
 
167 aa  47.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0365  fatty acid hydroxylase  25.82 
 
 
274 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78360  predicted protein  28.47 
 
 
305 aa  47  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  26.34 
 
 
597 aa  47  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  25.71 
 
 
284 aa  46.6  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1012  hypothetical protein  30.09 
 
 
337 aa  46.6  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1699  sterol desaturase family protein  22.64 
 
 
196 aa  46.2  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.844125  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1382  fatty acid hydroxylase  25 
 
 
227 aa  45.8  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  25.85 
 
 
597 aa  45.4  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.392021 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  24.86 
 
 
273 aa  44.7  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4158  sterol desaturase-like  28.67 
 
 
336 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.174308  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47593  predicted protein  29.29 
 
 
663 aa  44.3  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  29.73 
 
 
268 aa  43.9  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  28.68 
 
 
373 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  24.65 
 
 
267 aa  43.9  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  28.68 
 
 
373 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  28.68 
 
 
374 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  27.41 
 
 
301 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  26.11 
 
 
374 aa  43.5  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  21.69 
 
 
256 aa  43.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4333  sterol desaturase-like protein  24.14 
 
 
407 aa  42.7  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08907  C-4 methyl sterol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02440)  32.17 
 
 
291 aa  42.4  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.225916  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3261  hypothetical protein  26.03 
 
 
264 aa  42  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0633506  hitchhiker  0.0000000000915879 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74706  membrane-bound non-heme di-iron oxygenase involved in lipid metabolism  26.28 
 
 
294 aa  42  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0689  sterol desaturase-like protein  27.04 
 
 
284 aa  42  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>