58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_14208 on replicon NC_011682
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011682  PHATRDRAFT_14208  predicted protein  100 
 
 
249 aa  516  1e-146  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_6297  predicted protein  37.57 
 
 
185 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.711941  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28450  C-5 sterol desaturase (Sterol-C5-desaturase) (Ergosterol delta 5,6 desaturase)  34.29 
 
 
369 aa  97.8  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.284899  normal  0.304884 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06506  sterol delta 5,6-desaturase ERG3 (AFU_orthologue; AFUA_6G05140)  30.87 
 
 
352 aa  94.7  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.194474  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05010  C-5 sterol desaturase, putative  34.76 
 
 
328 aa  93.2  4e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.549969  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0680  C-5 sterol desaturase  30.25 
 
 
271 aa  73.9  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3005  fatty acid hydroxylase  27.8 
 
 
269 aa  67  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3136  sterol desaturase  31.54 
 
 
253 aa  61.2  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0236  C-5 sterol desaturase  27.33 
 
 
236 aa  58.9  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.652571  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03638  conserved hypothetical protein  34.17 
 
 
257 aa  57.4  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0179967  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2347  fatty acid hydroxylase  23.43 
 
 
262 aa  57  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0146  fatty acid hydroxylase  27.47 
 
 
257 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113209 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38826  predicted protein  29.37 
 
 
282 aa  52.8  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.914013  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3403  C-5 sterol desaturase  26.51 
 
 
326 aa  50.8  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5924  sterol desaturase-like  28.91 
 
 
324 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2171  fatty acid hydroxylase  29.38 
 
 
324 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.689731 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2153  sterol desaturase-like protein  28.91 
 
 
324 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135202  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1174  fatty acid hydroxylase  23.39 
 
 
324 aa  50.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2514  fatty acid hydroxylase  26.56 
 
 
267 aa  49.7  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.842442  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03230  sphingosine hydroxylase, putative  27.95 
 
 
346 aa  49.7  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  27.16 
 
 
400 aa  49.7  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02573  conserved hypothetical protein  29.14 
 
 
313 aa  49.3  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000109595  normal  0.411684 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  27.17 
 
 
267 aa  49.7  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6776  fatty acid hydroxylase  31.69 
 
 
334 aa  49.3  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.159357 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  26.51 
 
 
270 aa  49.3  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_18900  predicted protein  26.36 
 
 
283 aa  48.9  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2066  hypothetical protein  23.77 
 
 
331 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2063  fatty acid hydroxylase  26.04 
 
 
324 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589022  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2190  sterol desaturase-like protein  25.66 
 
 
324 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08907  C-4 methyl sterol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02440)  29.14 
 
 
291 aa  47.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.225916  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  26.57 
 
 
272 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  28.47 
 
 
282 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1082  fatty acid hydroxylase  24.06 
 
 
324 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.853948  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00640  sphinganine hydroxylase BasA (Eurofung)  28.36 
 
 
430 aa  46.6  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0535507  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1118  fatty acid hydroxylase  27.78 
 
 
325 aa  46.2  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.325858  normal  0.912027 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  24.48 
 
 
304 aa  45.4  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1485  fatty acid hydroxylase  27.16 
 
 
327 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12734  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5462  sterol desaturase-like  26.42 
 
 
324 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1804  hypothetical protein  24.32 
 
 
320 aa  45.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000255396 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0911  sterol desaturase  25.94 
 
 
332 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186369  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4807  fatty acid hydroxylase  28.95 
 
 
249 aa  44.3  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  23.81 
 
 
293 aa  43.9  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2491  fatty acid hydroxylase  29.6 
 
 
344 aa  43.5  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.169325  normal  0.90493 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1840  hypothetical protein  28.7 
 
 
329 aa  43.5  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194533  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1104  sterol desaturase-related protein  27.22 
 
 
278 aa  43.5  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0432208  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2296  fatty acid hydroxylase  27.89 
 
 
374 aa  43.5  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00152596 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  26.53 
 
 
275 aa  43.5  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1528  hypothetical protein  28.72 
 
 
329 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0526335  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2695  hypothetical protein  28.72 
 
 
329 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231759  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2639  hypothetical protein  28.72 
 
 
329 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2257  hypothetical protein  28.72 
 
 
329 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.648004  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2774  hypothetical protein  28.72 
 
 
329 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3063  hypothetical protein  28.72 
 
 
329 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00223094  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2783  hypothetical protein  24.34 
 
 
321 aa  42.7  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292274 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2845  sterol desaturase-like protein  25.64 
 
 
308 aa  42.4  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5014  sterol desaturase-like protein  23.61 
 
 
230 aa  42.4  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2984  C-5 sterol desaturase  28.78 
 
 
239 aa  42.7  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0218495  normal  0.0192453 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77904  Sphingolipid hydroxylase  27.03 
 
 
345 aa  42  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.726842  normal  0.428926 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>