21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_77904 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009044  PICST_77904  Sphingolipid hydroxylase  100 
 
 
345 aa  716    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.726842  normal  0.428926 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03230  sphingosine hydroxylase, putative  44.22 
 
 
346 aa  249  6e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00640  sphinganine hydroxylase BasA (Eurofung)  61.74 
 
 
430 aa  203  5e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0535507  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08907  C-4 methyl sterol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02440)  36 
 
 
291 aa  67  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.225916  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02410  C-4 methyl sterol oxidase, putative  28.29 
 
 
343 aa  66.2  0.0000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38826  predicted protein  34.78 
 
 
282 aa  63.2  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.914013  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78360  predicted protein  29.6 
 
 
305 aa  62  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06973  C-4 methyl sterol oxidase Erg25, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04820)  30.07 
 
 
302 aa  60.1  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.244737  hitchhiker  0.0000000000000142581 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3388  hypothetical protein  32.59 
 
 
255 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0628245  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39990  hypothetical protein  29.63 
 
 
255 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02573  conserved hypothetical protein  33.04 
 
 
313 aa  55.1  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000109595  normal  0.411684 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05010  C-5 sterol desaturase, putative  27.33 
 
 
328 aa  50.1  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.549969  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74706  membrane-bound non-heme di-iron oxygenase involved in lipid metabolism  26.47 
 
 
294 aa  50.1  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06506  sterol delta 5,6-desaturase ERG3 (AFU_orthologue; AFUA_6G05140)  28.86 
 
 
352 aa  49.3  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.194474  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3136  sterol desaturase  27.14 
 
 
253 aa  48.5  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0615  sterol desaturase-like  30.2 
 
 
331 aa  47.4  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2514  fatty acid hydroxylase  26.49 
 
 
267 aa  46.2  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.842442  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0236  C-5 sterol desaturase  28.57 
 
 
236 aa  45.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.652571  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02830  conserved hypothetical protein  22.1 
 
 
348 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.11787  normal  0.073643 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0951  hypothetical protein  28.77 
 
 
244 aa  44.3  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3403  C-5 sterol desaturase  24.6 
 
 
326 aa  42.7  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>