50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2347 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2347  fatty acid hydroxylase  100 
 
 		 262 aa  528  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1692  fatty acid hydroxylase  67.34 
 
 		 248 aa  319  3e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2984  C-5 sterol desaturase  31.09 
 
 		 239 aa  99.4  6e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0218495  normal  0.0192453 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3136  sterol desaturase  34.15 
 
 		 253 aa  86.7  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5014  sterol desaturase-like protein  27.94 
 
 		 230 aa  86.3  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2514  fatty acid hydroxylase  32.52 
 
 		 267 aa  85.1  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.842442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0680  C-5 sterol desaturase  32.55 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3005  fatty acid hydroxylase  27.69 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0236  C-5 sterol desaturase  30.47 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.652571  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1488  fatty acid hydroxylase  25.13 
 
 		 231 aa  75.1  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568753 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0146  fatty acid hydroxylase  29.69 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113209 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05010  C-5 sterol desaturase, putative  27.81 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.549969  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1699  sterol desaturase family protein  25.14 
 
 		 196 aa  58.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.844125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6776  fatty acid hydroxylase  31.33 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159357 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14208  predicted protein  23.43 
 
 		 249 aa  57  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_6297  predicted protein  29.79 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.711941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2297  fatty acid hydroxylase  28.09 
 
 		 344 aa  56.2  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10852  predicted protein  30.63 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2491  fatty acid hydroxylase  29.17 
 
 		 344 aa  55.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.169325  normal  0.90493 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28450  C-5 sterol desaturase (Sterol-C5-desaturase) (Ergosterol delta 5,6 desaturase)  26.27 
 
 		 369 aa  55.1  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.284899  normal  0.304884 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  24.62 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1382  fatty acid hydroxylase  28.1 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02573  conserved hypothetical protein  26.18 
 
 		 313 aa  51.6  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000109595  normal  0.411684 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  25.36 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0911  sterol desaturase  28.57 
 
 		 332 aa  50.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3403  C-5 sterol desaturase  25.25 
 
 		 326 aa  50.8  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  24.1 
 
 		 264 aa  50.8  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  29.09 
 
 		 626 aa  48.9  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  27.65 
 
 		 385 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  24.29 
 
 		 284 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0242  hypothetical protein  25.95 
 
 		 325 aa  47  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26403  predicted protein  27.21 
 
 		 621 aa  46.6  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00293247  decreased coverage  0.00469523 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09275  C-4 methylsterol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01160)  25.9 
 
 		 259 aa  46.6  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000567385  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03638  conserved hypothetical protein  29.13 
 
 		 257 aa  45.8  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0179967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0600  sterol desaturase-like  27.72 
 
 		 306 aa  45.8  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_18900  predicted protein  26 
 
 		 283 aa  45.8  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  28.19 
 
 		 401 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0689  sterol desaturase-like protein  23.65 
 
 		 284 aa  45.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47593  predicted protein  29.55 
 
 		 663 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  28.19 
 
 		 401 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  27.98 
 
 		 374 aa  45.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  25.62 
 
 		 270 aa  43.9  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2066  hypothetical protein  26.7 
 
 		 331 aa  43.5  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1174  fatty acid hydroxylase  24.48 
 
 		 324 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  29.89 
 
 		 380 aa  43.5  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  28.85 
 
 		 272 aa  43.5  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0045  hypothetical protein  30.77 
 
 		 291 aa  43.1  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5042  fatty acid hydroxylase  28.57 
 
 		 431 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.373199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  25.6 
 
 		 267 aa  42  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  27.52 
 
 		 321 aa  42  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>